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NMRofLargeComplexes

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Unveiling dynamics and substrate interactions of large protein complexes by NMR...

Unveiling dynamics and substrate interactions of large protein complexes by NMR spectroscopy Dynamic properties of proteins are essential for their function. NMR can reveal protein dynamics in solution on a broad range of timescales and at atomic resolution. However, NMR studies of large proteins remain challenging since... ver más

31/08/2022

163K€

Presupuesto del proyecto: 163K€

Líder del proyecto

HOCHSCHULE FUR ANGEWANDTE WISSENSCHAFTEN MUNC... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo H2020 notifico la concesión del proyecto el día 2022-08-31

MSCA-IF-2019: Individual Fellowships

I+D

Cerrada hace 5 años

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1 Participantes

162.81K€ | Lider

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Duración del proyecto: 28 meses Fecha Inicio: 2020-04-02
Fecha Fin: 2022-08-31

Líder del proyecto

HOCHSCHULE FUR ANGEWANDTE WISSENSCHAFTEN MUNC... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Presupuesto del proyecto 163K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto Dynamic properties of proteins are essential for their function. NMR can reveal protein dynamics in solution on a broad range of timescales and at atomic resolution. However, NMR studies of large proteins remain challenging since conventional NMR methods are constrained to small proteins. The aim of this project is to extend the NMR size limit to large protein complexes by combining recent developments in site-specific labeling schemes with novel NMR methods employing state-of-the-art spectrometers. This will facilitate the study of functionally essential but so far uncharacterized dynamics and substrate interactions of two large protein complexes, providing unprecedented insight into the relationship between dynamics, structure and function. Since most proteins are dynamic, extending the scope of protein complexes that are amenable to NMR study is of great interest to many areas of molecular biology. Studies will be conducted on the eukaryotic exosome, a 370 kDa soluble, asymmetric decamer involved in RNA degradation and processing, and the 80 kDa Na+/H+ antiporter NapA, an integral membrane dimer involved in ion transport. For the exosome, individual subunits will be 13C-methyl labeled; the employment of sophisticated NMR methods will then permit the detection of functionally essential dynamics and RNA-substrate binding patterns of the exosome. As NapA is a low-yield membrane protein, an inexpensive 19F-labeling approach will be employed to reveal global transport dynamics and local gating motions. Exosome production and all NMR experiments are to be conducted in Remco Spranger’s lab at the University of Regensburg, Germany. NapA will be produced during a secondment in David Drew’s lab at Stockholm University, Sweden. This newly established international collaboration will permit integration of methods and knowledge to study protein systems previously inaccessible to NMR, strengthen the profile of the applicant and foster research of the involved institutes.

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