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AGL2017-89648-P

Financiado

UN GENOMA PARA DOS DISEÑOS CORPORALES:ESTUDIOS DE GENOMICA FUNCIONAL Y TRANSCRIP...

UN GENOMA PARA DOS DISEÑOS CORPORALES:ESTUDIOS DE GENOMICA FUNCIONAL Y TRANSCRIPTOMA A NIVEL DE GENOMA COMPLETO PARA COMPRENDER LAS BASES GENETICAS DE LA METAMORFOSIS EN PECES NUESTROS ANTERIORES PROYECTOS DE INVESTIGACION APLICADA (AGL2008-00392, AGL2011-23581, AGL2014-52473R) SE CENTRARON CON EXITO EN INVESTIGAR COMO LA MORFOLOGIA DE LOS PECES (PIGMENTACION, DESARROLLO OSEO) PODIA ALTERARSE SEGUN LAS... ver más

01/01/2017

CSIC

200K€

Presupuesto del proyecto: 200K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Ver Participantes

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2017-01-01

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Participantes

CSIC

Lider

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA...

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 200K€

Descripción del proyecto NUESTROS ANTERIORES PROYECTOS DE INVESTIGACION APLICADA (AGL2008-00392, AGL2011-23581, AGL2014-52473R) SE CENTRARON CON EXITO EN INVESTIGAR COMO LA MORFOLOGIA DE LOS PECES (PIGMENTACION, DESARROLLO OSEO) PODIA ALTERARSE SEGUN LAS CONDICIONES DE CULTIVO Y PRODUCIR UNA DEVALUACION DE MERCADO, DURANTE EL DESARROLLO DE ESTOS PROYECTOS NOS DIMOS CUENTA QUE MUCHOS ASPECTOS BASICOS DEL DESARROLLO MORFOLOGICO NORMAL DE LOS PECES SON DESCONOCIDOS, UNO DE ESTOS ASPECTOS CLAVE ES LA METAMORFOSIS, UN PROCESO FASCINANTE EN EL QUE LA MORFOLOGIA DE LA LARVA SE TRANSFORMA EN OTRA TOTALMENTE DIFERENTE PARA AFRONTAR NUEVOS RETOS DURANTE SU VIDA ADULTA, EN LOS PECES, INCLUYENDO ESPECIES PARADIGMATICAS CON VALOR COMERCIAL COMO LOS PECES PLANOS, LAS BASES GENETICAS QUE REGULAN SU DRASTICA METAMORFOSIS SON UN MISTERIO, ASI, ESTE PROYECTO PROPONE ABORDAR LA CUESTION FUNDAMENTAL DE COMO UN GENOMA CREA DOS DISEÑOS CORPORALES COMPLETAMENTE DIFERENTES EN UN MISMO ANIMAL,PARA ELLO, SE PROPONE INVESTIGAR LA DECONSTRUCCION DEL ENTRAMADO DE GENES REGULADORES (EGR) RESPONSABLES DE LA REMODELACION METAMORFICA EN EL RODABALLO (SCOPHTHALMUS MAXIMUS) COMO UN MODELO DE ESTUDIO, LA HIPOTESIS INICIAL ES QUE LA CORRELACION DE TRANSCRIPTOMAS ESPECIFICOS DE ANIMALES ANTES, DURANTE Y DESPUES DE LA METAMORFOSIS CON UN ATLAS DE CROMATINA ACCESIBLE JUNTO CON MARCAS EPIGENETICAS, PERMITIRA IDENTIFICAR NUEVOS GENES Y ELEMENTOS REGULADORES TRANSCRIPCIONALES INVOLUCRADOS EN TALES PROCESOS, LA VIABILIDAD E IDONEIDAD DE ESTA PROPUESTA SE BASA EN EL HECHO DE QUE EL RODABALLO CAMBIA DE UNA LARVA PELAGICA SIMETRICA A UN JUVENIL BENTONICO ASIMETRICO, ESTA DRASTICA METAMORFOSIS CONLLEVA CAMBIOS FISIOLOGICOS SEVEROS EN DIFERENTES SISTEMAS COMO EL TEGUMENTARIO, MUSCULO-ESQUELETICO O NERVIOSO, LA QUE HACE ESTA PROPUESTA UNICA E INNOVADORA ES QUE LA IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION DEL EGR DE DICHA REMODELACION EN EL RODABALLO SE LLEVARA A CABO MEDIANTE LA COMBINACION E INTEGRACION DE DIFERENTES TECNOLOGIAS DE VANGUARDIA, ASI REALIZAREMOS ATAC-SEQ PARA DETECTAR LAS REGIONES DE CROMATINA ACCESIBLE EN LAS DIFERENTES FASES METAMORFICAS, A CONTINUACION, LOS MAPAS DE CROMATINA ACCESIBLE SE CORRELACIONARAN CON MARCAS EPIGENETICAS (METHILCAP-SEQ) Y CON DATOS DE MRNA-SEQ DE DIFERENTES FASES METAMORFICAS PARA IDENTIFICAR ELEMENTOS REGULADORES EN CIS RESPONSABLES DE LA REGULACION DE LOS GENES ESPECIFICOS DE CADA FASE DE LA METAMORFOSIS, POSTERIORMENTE, SE REALIZARA LA CARACTERIZACION FUNCIONAL IN VIVO MEDIANTE TECNICAS DE EXPRESION GENICA DIFERENCIAL: MANIPULACION GENOMICA MEDIADA POR TRANSPOSON Y TECNOLOGIA CRISPR/CAS9 EN EL PEZ CEBRA (DANIO RERIO), UN CONOCIDO MODELO VERTEBRADO, ADEMAS, PARA ENTENDER LA CONSERVACION EVOLUTIVA DE ESTOS PROCESOS EN VERTEBRADOS, COMPARAREMOS LA METAMORFOSIS DEL RODABALLO Y LA LAMPREA (PETROMYZON MARINUS), FILOGENETICAMENTE BASAL, PARA DESCIFRAR EL ORIGEN EVOLUTIVO DE LA MAQUINARIA GENETICA DE REMODELACION METAMORFICA Y PARA FACILITAR LA CONECTIVIDAD ENTRE LOS VERTEBRADOS, LA VIABILIDAD DEL PROYECTO ESTA RESPALDADA POR EL ASESORAMIENTO/CONTRIBUCION DE TRES LIDERES INTERNACIONALMENTE RECONOCIDOS EN SUS CAMPOS DE TRABAJO: JOSE LUIS GOMEZ-SKARMETA Y JUAN TENA (ESPAÑA), EXPERTOS EN GENOMICA FUNCIONAL Y TRANSCRIPTOMICA, Y LA PROF, DEBORAH POWER (PORTUGAL), EXPERTA EN METAMORFOSIS DE VERTEBRADOS,AUNQUE ESTA PROPUESTA ESTA ORIENTADA PRINCIPALMENTE HACIA LA INVESTIGACION BASICA, ESPERAMOS QUE LOS RESULTADOS TENGAN UN USO RENTABLE EN INVESTIGACION APLICADA, METAMORFOSIS\DESARROLLO EMBRIONARIO\PECES\RODABALLO\LAMPREA\ATAC-SEQ\METHYLCAP-SEQ\RNA-SEQ\PEZ CEBRA\CRISPR

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