Descripción del proyecto
LA SUPERVIVENCIA DE LOS PACIENTES CON CANCER DE COLON (CC) DEPENDE EN GRAN MEDIDA DEL ESTADIO DE LA ENFERMEDAD EN EL MOMENTO DEL DIAGNOSTICO. SIN EMBARGO, EL ESTADIAJE PATOLOGICO ACTUAL BASADO EN EL SISTEMA TNM (I-IV) NO LOGRA PREDECIR EL RIESGO DE RECIDIVA Y DE SUPERVIVENCIA GLOBAL PARA PACIENTES INDIVIDUALES, PARTICULARMENTE PARA PACIENTES EN ESTADIO II DESPUES DE LA CIRUGIA DE CANCER DE COLON. SE SABE QUE MAS DEL 20% DE LOS PACIENTES CON CANCER DE COLON DIAGNOSTICADOS EN ESTADIO II SUFRIRAN RECIDIVA Y, EVENTUALMENTE, METASTASIS. AUNQUE SE ESTAN UTILIZANDO ALGUNOS FACTORES CLINICOS DE PRONOSTICO, EXISTE LA NECESIDAD DE DESARROLLAR BIOMARCADORES MOLECULARES BASADOS EN PERFILES DE EXPRESION GENICA PARA UNA PREDICCION MAS PRECISA DE UNA MAYOR O MENOR POSIBILIDAD DE RECIDIVA Y, EVENTUALMENTE, UNA RESPUESTA A LA QUIMIOTERAPIA ADYUVANTE. POR EL MOMENTO, SOLO EXISTEN UNOS POCOS TESTS COMERCIALES PARA LA EVALUACION DEL RIESGO EN PACIENTES CON CANCER DE COLON EN ESTADIO II. ESTOS TESTS PRESENTAN ALGUNAS LIMITACIONES QUE RESTRINGEN UN USO MUCHO MAS AMPLIO. COMO RESULTADO DE UN PROYECTO PREVIO DE INVESTIGACION REALIZADO EN NUESTRO LABORATORIO BASADO EN EL ANALISIS PROTEOMICO DEL SECRETOMA DE CELULAS METASTASICAS DE CC, SE IDENTIFICO UNA FIRMA PRONOSTICA DE 6 GENES/PROTEINAS COMPUESTA POR IGFBP3, CD109, LTBP1, PSAP, BMP1 Y NPC2, DENOMINADA SEC6. DESPUES DE UN ENTRENAMIENTO Y VALIDACION SECUENCIALES EN CUATRO COHORTES DIFERENTES DE CC, SE CONSTRUYO UN ALGORITMO DE PUNTUACION DE RIESGO (RISK-SCORE) PARA LA CORRECTA ESTRATIFICACION DE LOS PACIENTES. LOS COMPONENTES DE LA FIRMA MOLECULAR DE SEC6 MOSTRARON UNA ALTA EXPRESION EN PACIENTES DE CC CON MAL PRONOSTICO PERTENECIENTES AL SUBTIPO STEM-LIKE Y AL SUBTIPO MOLECULAR DE CONSENSO 4 (CMS4). ADEMAS, LA FIRMA MOLECULAR SEC6 PREDIJO LA SUPERVIVENCIA GLOBAL, EL INTERVALO LIBRE DE PROGRESION Y LA SUPERVIVENCIA ESPECIFICA DE LA ENFERMEDAD EN PACIENTES EN ESTADIO II Y III, DEMOSTRANDO UNA ALTA CAPACIDAD PRONOSTICA Y PREDICTIVA, QUE PODRIA PROPORCIONAR UNA NUEVA HERRAMIENTA PARA PERSONALIZAR LA TOMA DE DECISIONES EN EL CUIDADO DEL PACIENTE. EN ESTE PROYECTO SE PROPONE UNA PRUEBA DE CONCEPTO PARA CONFIRMAR LA APLICABILIDAD Y LA TRASLACION CLINICA DE SEC6. NUESTRO OBJETIVO ES VALIDAR EL ALGORITMO BASADO EN SEC6 EN AL MENOS 200 MUESTRAS DE PACIENTES EN ESTADIO II DE CC, NO TRATADOS Y CON HISTORIAS CLINICAS DE 3 A 5 AÑOS DE ANTIGUEDAD OBTENIDAS DE HOSPITALES PUBLICOS DE LA COMUNIDAD DE MADRID. LAS MUESTRAS PARAFINADAS FIJADAS CON FORMALINA SE UTILIZARAN PARA LA EXTRACCION DE RNA Y SE IMPLEMENTARAN METODOS QPCR PARA LA CUANTIFICACION DE LOS NIVELES DE EXPRESION DE LOS COMPONENTES DE SEC6 EN LAS MUESTRAS. A CONTINUACION, SE REALIZARA LA OPTIMIZACION DEL ALGORITMO SEC6 EN BASE A LOS RESULTADOS DE LA QPCR. SE DETERMINARAN LAS CARACTERISTICAS DE RENDIMIENTO ANALITICO PARA GENES INDIVIDUALES Y GRUPOS DE GENES UNA VEZ OPTIMIZADO EL ENSAYO. EN PARALELO, SE REALIZARAN ACTIVIDADES EXPLORATORIAS RELACIONADAS CON LA COMERCIALIZACION, INCLUIDO EL ANALISIS DE MERCADO, EL DESARROLLO COMERCIAL Y LA NEGOCIACION Y LICENCIA POSTERIOR. EN RESUMEN, NUESTRO OBJETIVO ES DEMOSTRAR LA CAPACIDAD DE NUESTRA PRUEBA PARA PREDECIR EL RIESGO DE RECIDIVA EN PACIENTES DE CC USANDO MUESTRAS CLINICAS PARAFINADAS, PROTEGER LA PROPIEDAD INTELECTUAL Y PROMOVER LA TRANSFERENCIA TECNOLOGICA A LAS EMPRESAS INTERESADAS.