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BFU2008-00366

Financiado

TOPOLOGIA DEL DNA: IMPLICACIONES BIOLOGICAS Y REGULACION

EL PRESENTE PROYECTO CONTINUARA NUESTROS ESTUDIOS SOBRE LAS IMPLICACIONES BIOLOGICAS DE LA TOPOLOGIA DEL DNA EN EUCARIOTAS Y SU MODULACION MEDIANTE TOPOISOMERASAS, RECIENTEMENTE HEMOS DEMOSTRADO QUE EL ANUDAMIENTO DEL DNA INFORMA... ver más

01/01/2008

CSIC

240K€

Presupuesto del proyecto: 240K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2008-01-01

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Participantes

CSIC

Lider

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA...

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 240K€

Descripción del proyecto EL PRESENTE PROYECTO CONTINUARA NUESTROS ESTUDIOS SOBRE LAS IMPLICACIONES BIOLOGICAS DE LA TOPOLOGIA DEL DNA EN EUCARIOTAS Y SU MODULACION MEDIANTE TOPOISOMERASAS, RECIENTEMENTE HEMOS DEMOSTRADO QUE EL ANUDAMIENTO DEL DNA INFORMA SOBRE LA TRAYECTORIA ESPACIAL DEL DUPLEX COMPACTADO EN ESTRUCTURAS BIOLOGICAS (ARSUAGA ET AL,, PNAS, 2005) Y QUE LOS NUCLEOSOMAS IMPONEN RESTRICCIONES GEOMETRICAS QUE PUEDEN DIRIGIR LA ACTIVIDAD DE LAS TOPOISOMERASAS (SALCEDA ET AL, EMBO J, 2006), NUESTRA HIPOTESIS ACTUAL SIGUE SIENDO QUE LA TOPOISOMERASA II EUCARIOTA NO SIEMPRE OPERA IN VIVO COMO RELAJADOR INESPECIFICO DE TENSION HELICOIDAL, SINO QUE PODRIA CATALIZAR TAMBIEN SUPERENROLLAMIENTO O ANUDAMIENTO, POR TANTO, ADEMAS DE SU FUNCION ESENCIAL COMO DECATENASA DEL DNA REPLICADO, LA TOPOISOMERASA II PUEDE SER UN IMPORTANTE REGULADOR DE LA ARQUITECTURA Y DINAMICA DE LA CROMATINA, NUESTROS RECIENTES ESTUDIOS EN S,CEREVISIAE A ESCALA MOLECULAR (MEDIANTE MINICROMOSOMAS CIRCULARES IN VIVO) Y A ESCALA GENOMICA (MEDIANTE MICRO Y MACRO ARRAYS DE DNA) REFUERZAN ESTA HIPOTESIS, NUESTROS OBJETIVOS EXPERIMENTALES PARA LOS PROXIMOS 3 AÑOS SON LOS SIGUIENTES: 1) CARACTERIZACION DEL MECANISMO QUE GENERA TENSION HELICOIDAL NEGATIVA, CATALIZADA POR LA TOPOISOMERASA II, QUE SE OBSERVA EN MUTANTES DTOP1 TOP2-TS, 2) CARACTERIZACION DE NUDOS DE DNA DE ALTA COMPLEJIDAD QUE APARECEN PARALELAMENTE AL INCREMENTO DE TENSION HELICOIDAL POSITIVA, 3) CARACTERIZACION DE UN NUEVO COMPLEJO TOPO II-DNA RESISTENTE A DISOCIACION SALINA DETECTADO EN MINICROMOSOMAS EXTRAIDOS DE S,CEREVISIAE, 4) EXAMINAR LOS EFECTOS DEL EXCESO DE TENSION HELICOIDAL EN EL TRANSCRIPTOMA DE S,CEREVISIAE, 5) COMPARAR LA ARQUITECTURA Y ELEMENTOS REGULADORES DE GENES SENSIBLES A LA INACTIVACION DE TOPOISOMERASA II, 6) MAPEAR LA TENSION HELICOIDAL DEL DNA A ESCALA GENOMICA MEDIANTE UN NUEVO PROCEDIMIENTO BASADO EN PSORALENOS, Topología del DNA\tensión helicoidal\topoisomerasas\cromatina\genomica estructural\S. Cerevisiae

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