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PID2019-104700GA-I00

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TAXONOMIA DE LA UNION DE FACTORES DE TRANSCRIPCION EN EL GENOMA COMPLETO DE PRIM...

TAXONOMIA DE LA UNION DE FACTORES DE TRANSCRIPCION EN EL GENOMA COMPLETO DE PRIMATES PARA EL ESTUDIO DE ESPECIALIZACIONES DEL CEREBRO HUMANO EN SALUD Y EN ENFERMEDAD LOS SERES HUMANOS POSEEMOS UN SISTEMA NERVIOSO QUE NOS CONFIERE CAPACIDADES COGNITIVAS Y TRASTORNOS COGNITIVOS PRACTICAMENTE UNICOS, EL ESTUDIO DEL DESARROLLO DEL CEREBRO ES CRITICO PARA LA COMPRENSION DE LA EVOLUCION DE ESTAS ESP... ver más

01/01/2019

Fundació Institut...

155K€

Presupuesto del proyecto: 155K€

Líder del proyecto

Fundació Institut Hospital del Mar D'Investig... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 16M€

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2019-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Fundació Institut Hospital d...

Lider

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Líder del proyecto

Fundació Institut Hospital del Mar D'Investig... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 16M€

Presupuesto del proyecto 155K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto LOS SERES HUMANOS POSEEMOS UN SISTEMA NERVIOSO QUE NOS CONFIERE CAPACIDADES COGNITIVAS Y TRASTORNOS COGNITIVOS PRACTICAMENTE UNICOS, EL ESTUDIO DEL DESARROLLO DEL CEREBRO ES CRITICO PARA LA COMPRENSION DE LA EVOLUCION DE ESTAS ESPECIALIZACIONES COGNITIVAS, PARA DISCERNIR LAS CAUSAS GENETICAS QUE INFLUYEN EN LOS FENOTIPOS ESPECIFICOS DEL SER HUMANO, ES NECESARIO IDENTIFICAR LAS VARIANTES RELEVANTES QUE AFECTAN A LOS GENES RELEVANTES ENTRE LAS MILES DE OTRAS VARIANTES QUE SE ESTIMAN QUE SON NEUTRALES, ENTRE LOS APROXIMADAMENTE 35 MILLONES DE POLIMORFISMOS DE NUCLEOTIDOS SIMPLES (SNPS), 5 MILLONES DE INSERCIONES O DELECIONES (INDELS), Y 90 MEGABASES DE VARIANTES ESTRUCTURALES DONDE LOS GENOMAS HUMANO Y CHIMPANCE DIFIEREN, HAY INNUMERABLES VARIANTES ASOCIADAS CON EL DESARROLLO, FUNCION O ENFERMEDAD, SIN EMBARGO, IDENTIFICAR ESTAS VARIANTES, RARAS, DE ENTRE LOS MILES DE VARIANTES QUE SE ESPERA QUE SEAN NEUTRALES ES UNA TAREA HERCULEA, UN VERDADERO ESCENARIO DE "AGUJA EN UN PAJAR", NOSOTROS, Y OTROS, HEMOS RAZONADO QUE LA IDENTIFICACION DE VARIANTES GENETICAS RELEVANTES DESDE EL PUNTO DE VISTA EVOLUTIVO, ASI COMO DE AQUELLAS IMPLICADAS EN LA ENFERMEDAD O LA FUNCION NORMAL, PUEDE GUIARSE POR EL ANALISIS DE LAS DIFERENCIAS ENTRE ESPECIES EN FENOTIPOS MOLECULARES INTERMEDIOS (POR EJEMPLO, CON ESTUDIOS COMPARATIVOS DE LAS FIRMAS TRANSCRIPTOMICAS Y EPIGENOMICAS), QUE SON MUY PROBABLEMENTE LOS EFECTOS PRIMARIOS DE LA VARIACION GENOMICA, PERO INCLUSO CUANDO LA CONEXION TIENE UNA FUERTE PROBABILIDAD DE CAUSALIDAD, ES NECESARIO DEMOSTRAR LOS MECANISMOS SUBYACENTES AL CAMBIO FENOTIPICO, QUE ES UN ESFUERZO QUE RARAMENTE APLICAN LOS BIOLOGOS EVOLUTIVOS, EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES ABORDAR ESTOS DOS PROBLEMAS MEDIANTE I) LA REDUCCION DEL ESPACIO DE BUSQUEDA DE VARIANTES RELEVANTES A UNA LISTA TRATABLE, Y II) LA PRUEBA DE SUS EFECTOS FUNCIONALES EN UN SISTEMA PROXIMO AL DESARROLLO CEREBRAL FETAL HUMANO CONSISTENTE EN CULTIVOS NEURONALES DERIVADOS DE CELULAS MADRE PLURIPOTENTES INDUCIDAS (EN INGLES, IPSC),ESTE PROYECTO VA UN PASO MAS ALLA EN SU ESTRATEGIA PARA IDENTIFICAR VARIANTES RELEVANTES DESDE EL PUNTO DE VISTA EVOLUTIVO, YA QUE INTERROGA DIRECTAMENTE LA DIVERGENCIA EN LOS SEGMENTOS DE LOS ELEMENTOS REGULADORES PREDICHOS QUE AFECTAN DIRECTAMENTE A LA EXPRESION GENICA: LOS SITIOS DE UNION DE FACTORES DE TRANSCRIPCION (ACRONIMO EN INGLES, TFBS), EL ESTUDIO DE LA CONVERGENCIA ESPACIO-TEMPORAL DEL RIESGO DE MULTIPLES RASGOS NEUROPSIQUIATRICOS HA SEÑALADO LA ASOCIACION CONJUNTA DE UN NUMERO REDUCIDO DE FACTORES DE TRANSCRIPCION CON IMPLICACION CRITICA EN EL DESARROLLO NEUROLOGICO NORMAL, EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES ANALIZAR LA DINAMICA TEMPORAL DE LA OCUPACION DEL TFBS DEL GENOMA COMPLETO PARA UNA SELECCION DE ESTOS FACTORES DE TRANSCRIPCION CONVERGENTES PARA EL RIESGO DE ENFERMEDADES NEUROPSIQUIATRICAS EN DIFERENTES ETAPAS DEL NEURODESARROLLO Y CON UNA PERSPECTIVA EVOLUTIVA, EN PARTICULAR, I) COMPARAREMOS LOS SITIOS DE UNION DEL TF EN CULTIVOS NEURALES DERIVADOS DE LA IPSC EN HUMANOS, CHIMPANCES Y MACACOS, II) INTEGRAREMOS DATOS COMPARATIVOS DE NEUROGENOMICA (RNA-SEQ, CHIP-SEQ Y HI-C) PARA VINCULAR LOS SITIOS DE UNION DIVERGENTES A LA EXPRESION GENICA Y III) ASOCIAREMOS ESOS CAMBIOS A VARIANTES ESPECIFICAS DEL SER HUMANO, ESTE MARCO PROPORCIONARA LOS MEDIOS PARA PRIORIZAR VARIANTES EVOLUTIVAS RELEVANTES PARA LAS ESPECIALIZACIONES HUMANAS Y QUE PODREMOS PROBAR EN UN SISTEMA CRISPR/CAS9 IPSC PARA SU CARACTERIZACION FENOTIPICA, FACTORES DE TRANSCRIPCION\EVOLUCION MOLECULAR\CEREBRO\ENFERMEDADES NEUROPSIQUIATRICAS\GENOMICA COMPARATIVA\NEUROGENOMICA

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