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PID2020-117923GB-I00

Financiado

SUPREMACIA DE LOS PLASMIDOS

SI ENTENDEMOS LOS PLASMIDOS, COMPRENDEMOS LOS ELEMENTOS MAS ACTIVOS DE LA EVOLUCION BACTERIANA, ESTA ASEVERACION NECESITA SER RIGUROSAMENTE PROBADA, Y ESO ES EXACTAMENTE LO QUE PACY TRATARA DE HACER, PACY CONTIENE DOS SECCIONES Y... ver más

01/01/2020

UNICAN

212K€

Presupuesto del proyecto: 212K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE CANTABRIA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 471

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2020-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE CANTABRIA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 471

Presupuesto del proyecto 212K€

Descripción del proyecto SI ENTENDEMOS LOS PLASMIDOS, COMPRENDEMOS LOS ELEMENTOS MAS ACTIVOS DE LA EVOLUCION BACTERIANA, ESTA ASEVERACION NECESITA SER RIGUROSAMENTE PROBADA, Y ESO ES EXACTAMENTE LO QUE PACY TRATARA DE HACER, PACY CONTIENE DOS SECCIONES Y CINCO PAQUETES DE TRABAJO (WPS), EL WP1 INCREMENTARA EL CONOCIMIENTO GLOBAL SOBRE LOS PLASMIDOS, A PARTIR DE NUESTRA CLASIFICACION TAXONOMICA DE LOS PLASMIDOS Y LA DEFINICION DE PTUS (UNIDADES TAXONOMICAS PLASMIDICAS) ARQUETIPICAS, UN ESTUDIO EN PROFUNDIDAD DE LAS PTUS EN ORDENES BACTERIANOS SELECCIONADOS PERMITIRA DESTILAR NUEVOS PRINCIPIOS QUE EXPLIQUEN LA ACTIVIDAD FUNCIONAL DE LOS PLASMIDOS, EL WP1 ESTUDIA LAS ARMAS USADAS POR LOS PLASMIDOS EN SUS INTERACCIONES CON OTROS PLASMIDOS, NECESITAREMOS ESTE ARSENAL PARA ARMAR PLASMIDOS DONADORES QUE SERAN UTILIZADOS EN LAS INTERVENCIONES EN MICROBIOMAS EN LA SECCION 2 DE PACY, EN WP2 INVESTIGAREMOS ESPECIFICAMENTE LOS SISTEMAS DE SECRECION TIPO VI, PUESTO QUE CONSTITUYEN UN NUEVO TIPO DE ARMA, CON MUCHAS ARISTAS POR DESCUBRIR, LA SECCION 1 (WPS 1 Y 2) ESTUDIA PLASMIDOS INDIVIDUALES EN HOSPEDADORES BACTERIANOS INDIVIDUALES, EL WP3 INAUGURA NUESTRO VIAJE EXPLORATORIO EN LOS ECOSISTEMAS MICROBIANOS, ELEGIMOS ENTRAR EN ESTE CAMPO EXPLORANDO EL POTENCIAL ANALITICO INCREMENTADO DE LA METAGENOMICA DIRIGIDA, SE ANALIZARAN DOS MICROBIOMAS MUY DIFERENTES: LOS MICROORGANISMOS ENDOFITOS DE TRIGO Y EL INTESTINO HUMANO, LAS BACTERIAS ENDOFITAS DEL TRIGO ESTABLECEN POSIBLEMENTE UNA RELACION SIMBIOTICA CON SU HOSPEDADOR, EXPLORAREMOS SI LOS ENDOFITOS CONTIENEN GENES BENEFICIOSOS PARA LAS PLANTAS, SI ESTOS RESIDEN EN ELEMENTOS GENETICOS MOVILES (MGES), Y SI LOS ENDOFITOS SE TRANSMITEN A TRAVES DE LA SEMILLA GENERACIONALMENTE, CONSTRUIREMOS CEPAS SUPER-BENEFICIOSAS COMBINANDO GENES BENEFICIOSOS CONTENIDOS EN MGES, TAMBIEN ANALIZAREMOS COMO LOS PRODUCTOS PRINCIPALES DE LA FERMENTACION BACTERIANA AFECTAN AL HIGADO, ESPECIFICAMENTE A LA PROGRESION DESDE EL HIGADO GRASO NO ALCOHOLICO A LA ESTEATOHEPATITIS NO ALCOHOLICA, NUESTRA HIPOTESIS ES QUE UN DESBALANCE ENTRE LOS MICROORGANISMOS PRODUCTORES DE ALCOHOL Y DE ACIDO ES LA RAIZ DE ESTA ENFERMEDAD, GENERAREMOS UNA BASE DE DATOS DE GENES INVOLUCRADOS EN LAS REACCIONES FINALES DE LA FERMENTACION Y ANALIZAREMOS COMO ESTOS VARIAN EN LA SALUD Y LA ENFERMEDAD, Y SI ESTAN CONTENIDOS EN MGES, TODO ESTO NOS LLEVA AL WP4, EN EL QUE PROPONEMOS INTERVENIR EN LOS MICROBIOMAS ANALIZADOS PARA LLEVARLOS A UN DESENLACE BENEFICIOSO, LO HAREMOS UTILIZANDO JUICIOSAMENTE LA CONJUGACION DIRIGIDA, UTILIZAREMOS SISTEMAS SINTETICOS DE ADHESION QUE RECONOZCAN ANTIGENOS ESPECIFICOS EN BACTERIAS RECEPTORAS, GUIANDO A LOS PLASMIDOS CONJUGATIVOS HACIA LOS RECEPTORES SELECCIONADOS, CON MINIMOS EFECTOS COLATERALES, FINALMENTE, EL WP5 DA UN SALTO ADELANTE Y PREPARA EL TERRENO PARA MEDIDAS DE CONTROL MAS SOFISTICADAS QUE PUEDAN SER APLICADAS EN EL FUTURO A LOS MICROBIOMAS, CON ESTE FIN, DESARROLLAREMOS UN SISTEMA DE COMPUTACION BACTERIANA MULTICELULAR, CONSTRUIREMOS UN CONJUNTO LOGICO PROGRAMABLE DE DOS ENTRADAS CAPAZ DE IMPLEMENTAR CUALQUIER CUALQUIER FUNCION CON DOS ENTRADAS EN UNA POBLACION BACTERIANA, EN RESUMEN, EL CONTROL DE LAS COMUNIDADES MICROBIANAS DURANTE EL SIGLO XXI TENDRA UN IMPACTO EQUIVALENTE A LA DOMESTICACION DE PLANTAS Y ANIMALES HACE DOCE MILENIOS, ESPERAMOS QUE LA INVESTIGACION PROPUESTA EN PACY CONTRIBUYA SIGNIFICATIVAMENTE A ESTE FIN, POR ESO ESCOGIMOS EL ACRONIMO PACY: DESARROLLARSE RAPIDAMENTE O CON ACCION RAPIDA; EMOCIONANTE, PLASMIDO\TRANSFERENCIA GENETICA HORIZONTAL\COMPUTACION BACTERIANA\METAGENOMICA\INTERVENCIONES EN EL MICROBIOMA\SISTEMA DE SECRECION TIPO VI\BIOLOGIA SINTETICA\RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS\ENFERMEDAD DEL HIGADO GRASO NO ALCOHOLIC\ENDOFITAS DEL TRIGO

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