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SOLUCIONES INNOVADORAS E INTEGRADAS PARA EL CONTROL DE LA PARATUBERCULOSIS BOVINA BASADAS EN GENOMICA, TRANSCRIPTOMICA Y DIGITAL PCR (DDPCR)
LA DETECCION DE LA PARATUBERCULOSIS (PTB) SUBCLINICA SIGUE SIENDO UN RETO IMPORTANTE POR LO QUE ES NECESARIO DESARROLLAR NUEVAS HERRAMIENTAS DIAGNOSTICAS QUE PERMITAN DETECTAR A LOS ANIMALES INFECTADOS EN ESTADIOS TEMPRANOS DE LA...
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Descripción del proyecto
LA DETECCION DE LA PARATUBERCULOSIS (PTB) SUBCLINICA SIGUE SIENDO UN RETO IMPORTANTE POR LO QUE ES NECESARIO DESARROLLAR NUEVAS HERRAMIENTAS DIAGNOSTICAS QUE PERMITAN DETECTAR A LOS ANIMALES INFECTADOS EN ESTADIOS TEMPRANOS DE LA INFECCION Y ASI PODER CONTROLAR LA TRASMISION DE LA ENFERMEDAD, EN EL PRESENTE SUBPROYECTO, SE REALIZARA ANALISIS TRANSCRIPTOMICO DE MICRO-RNAS (MIRNAS) EN MUESTRA DE SANGRE PARA IDENTIFICAR BIOMARCADORES (MI-RNAS) QUE FACILITEN LA DETECCION DE LOS ANIMALES INFECTADOS EN ESTADIOS TEMPRANOS DE LA INFECCION, LOS BIOMARCADORES, ADEMAS DE CAPACIDAD DIAGNOSTICA PUEDEN FUNCIONAR COMO AGENTES TERAPEUTICOS, POR LO QUE LA ACTIVIDAD ANTIMICROBIANA DE ALGUNOS DE LOS MIRNAS Y PROTEINAS IDENTIFICADOS EN EL PROYECTO PARA-CON SE TESTARA EN MACROFAGOS BOVINOS INFECTADOS CON MYCOBACTERIUM AVIUM SUBSP, PARATUBERCULOSIS (MAP), ADEMAS, SE ESTUDIARA LA CAPACIDAD DE LA TECNOLOGIA DE REACCION EN CADENA DE LA POLIMERASA DIGITAL (DDPCR) PARA DETECTAR ESTADIOS CONCRETOS DE LA INFECCION AL CUANTIFICAR DE MANERA ABSOLUTA EL NUMERO DE COPIAS GENETICAS DE MAP EN MUESTRAS DE HECES Y DE SUERO/PLASMA DE ANIMALES INFECTADOS, POR OTRO LADO, UNA ESTRATEGIA DE CONTROL DE LA PTB AMPLIAMENTE ACEPTADA ES LA QUE SE BASA EN LA SELECCION GENETICA DE ANIMALES CON RESISTENCIA NATURAL A LA PTB, DIVERSOS ESTUDIOS HAN SUGERIDO QUE LA SUSCEPTIBILIDAD A LA INFECCION POR MAP ESTARIA CONTROLADA POR UN AMPLIO NUMERO DE GENES, POR ELLO, EN NUESTRO SUBPROYECTO SE BUSCARAN LOCUS (QUANTITATIVE TRAIT LOCI, QTL) ASOCIADOS A DIFERENCIAS EN LA SUSCEPTIBILIDAD GENETICA A LA PTB EMPLEANDO UN ANALISIS DE ASOCIACION COMPLETA DE GENOMA (GENOME-WIDE ASSOCIATION, GWAS) QUE PERMITE ANALIZAR LA VARIACION GENETICA DEL GENOMA COMPLETO DEL HOSPEDADOR, COMO LAS VARIACIONES GENETICAS ASOCIADAS A ENFERMEDADES COMPLEJAS COMO LA PTB SE SUELEN LOCALIZAR EN REGIONES REGULADORAS NO CODIFICANTES DE LOS GENES Y PRODUCEN EFECTOS EN LA INTENSIDAD O EN EL MOMENTO EN EL QUE ESTOS SE EXPRESAN, EN EL PRESENTE SUBPROYECTO SE TRATARA DE IDENTIFICAR POLIMORFISMOS DE NUCLEOTIDO SIMPLE (SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS, SNPS) REGULATORIOS (RSNPS) ASOCIADOS A LA SUSCEPTIBILIDAD/RESISTENCIA A LA PTB EMPLEANDO UN ANALISIS GENOMICO-TRANSCRIPTOMICO COMBINADO, NUESTRA META ES CONSEGUIR QUE LOS MARCADORES GENETICOS ASOCIADOS A LA PTB QUE SE IDENTIFIQUEN Y VALIDEN EN EL PRESENTE PROYECTO SEAN INCLUIDOS EN EL PROGRAMA DE SELECCION GENETICA DE LA RAZA HOLSTEIN EN ESPAÑA DE MANERA QUE PERMITAN SELECCIONAR ANIMALES RESISTENTES A ESTA ENFERMEDAD, MYCOBACTERIUM AVIUM SUBSP. PARATUBERCULO\PARATUBERCULOSIS BOVINA\BIOMARCADORES\GENÓMICA\TRANSCRIPTÓMICA\PROTEÓMICA\ANÁLISIS DE ASOCIACIÓN COMPLETA DE GENOM\MIRNAS\DIGITAL PCR
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