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SLAMseq

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SLAMseq Temporal resolution in gene expression profiling across multiple platforms Current gene expression profiling by massive parallel RNA sequencing provides insight into relative abundance of RNA molecules but fails to resolve the underlying principles in gene regulation that are reflected in the intracellul... ver más

30/06/2020

IMBA

150K€

Presupuesto del proyecto: 150K€

Líder del proyecto

INSTITUT FUER MOLEKULARE BIOTECHNOLOGIE GMBH No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Ver 2 Participantes

Financiación concedida El organismo H2020 notifico la concesión del proyecto el día 2020-06-30

ERC-2018-PoC: ERC Proof of Concept Grant

I+D

Cerrada hace 7 años

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2 Participantes

IMBA

150.00K€ | Lider

INDRA SISTEMAS

3.63M€ | Participante

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Duración del proyecto: 22 meses Fecha Inicio: 2018-08-28
Fecha Fin: 2020-06-30

Líder del proyecto

INSTITUT FUER MOLEKULARE BIOTECHNOLOGIE GMBH No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Presupuesto del proyecto 150K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto Current gene expression profiling by massive parallel RNA sequencing provides insight into relative abundance of RNA molecules but fails to resolve the underlying principles in gene regulation that are reflected in the intracellular kinetics of RNA biogenesis, processing and turnover. In the ERC-StG 'miRLIFE', we have developed a novel technology – SLAMseq – that uncovers a chemically modified nucleoside analog by sequencing. When coupled to metabolic RNA labeling and targeted RNA sequencing, SLAMseq provides unprecedented insights into the intracellular kinetics of gene expression in a rapid, scalable and cost-effective manner. Preliminary data show that the SLAMseq technology can be used to modify other nucleoside analogs and be applied for non-targeted RNA seq protocols. In this PoC, we aim to validate and prove this broader applicability of SLAMseq in order to enable and commercialize genome-wide, time-resolved transcriptomics. In this way, metabolic RNA sequencing will revolutionise biomedical research by providing experimental access to the molecular basis of human malignancies and treatments thereof.

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