Sistema de secuenciación masiva de ADN para análisis genómico y transcriptómico...
Sistema de secuenciación masiva de ADN para análisis genómico y transcriptómico que favorezca el desarrollo de una Agricultura Sostenible
Se plantea la solicitud de un equipo secuenciación automática de DNA de segunda generación, El grupo solicitante integra tanto a investigadores jóvenes como senior que desarrollan líneas de investigación de reciente creación o con...
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Descripción del proyecto
Se plantea la solicitud de un equipo secuenciación automática de DNA de segunda generación, El grupo solicitante integra tanto a investigadores jóvenes como senior que desarrollan líneas de investigación de reciente creación o consolidadas en dos de los tres departamentos del IAS-CSIC, La propuesta tiene un claro carácter multidisciplinar con líneas de investigación diferentes que incluyen el desarrollo de variedades resistentes a estreses bióticos y abióticos; desarrollo de marcadores asociados a variedades, resistencia, aptitudes agronómicas o industriales; genómica funcional aplicada a la mejora genética, ecología microbiana y patología vegetal; ecología microbiana molecular en agricultura, Entre las aplicaciones concretas que se prevén llevar a cabo destacan:-Secuenciación de genomas de microorganimos, de plantas y organismos eucariotas a partir de genomas conocidos o cercanos, -Genotipado, detección y caracterización de variantes raras y mutaciones en variedades de plantas y microorganismos,-Secuenciación de transcriptomas y estudios de expresión comparativos para el estudio de interacciones compatibles-incompatibles planta-microorganismo,y genes implicados en respuestas de defensa a estreses bióticos y abióticos, -Analisis metagenómico y metatrascriptómico de diversidad de la microbiota asociada a los cultivos agrícolas de interés, -Efecto de los sistemas de manejo y de las enfermedades en las poblaciones microbianas beneficiosas y patógenos de cultivos,
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