SELECCION NATURAL EN GENOMAS COMPLETOS DE ESPECIES DE MAMIFEROS Y DROSOPHILA. UN...
SELECCION NATURAL EN GENOMAS COMPLETOS DE ESPECIES DE MAMIFEROS Y DROSOPHILA. UNA APROXIMACION DESDE LA BIOLOGIA DE SISTEMAS
EL ANALISIS DE LOS ESTUDIOS DE VARIACION GENETICA LLEVADOS A ESCALA GENOMICA CARECE EN LA ACTUALIDAD DE UNA PERSPECTIVA BIOLOGICA DE SISTEMAS, LAS HERRAMIENTAS UTILIZADAS Y EL MARCO TEORICO ACTUAL PARA LA TESTACION DE LOS DESVIOS...
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Descripción del proyecto
EL ANALISIS DE LOS ESTUDIOS DE VARIACION GENETICA LLEVADOS A ESCALA GENOMICA CARECE EN LA ACTUALIDAD DE UNA PERSPECTIVA BIOLOGICA DE SISTEMAS, LAS HERRAMIENTAS UTILIZADAS Y EL MARCO TEORICO ACTUAL PARA LA TESTACION DE LOS DESVIOS DE LA NEUTRALIDAD SELECTIVA SON EN SU MAYORIA DESARROLLOS ESTADISTICOS PRE-GENOMICOS, A LA VEZ QUE LOS RESULTADOS CONTINUAN SIENDO ANALIZADOS DESDE LA PERSPECTIVA INDIVIDUAL DE LOS GENES QUE COMPONEN EL GENOMA CODIFICANTE DE UNA ESPECIE, ESTO HA LLEVADO A LA FALTA DE SIGNIFICACION ESTADISTICA DE LAS CLASES FUNCIONALES DE LOS GENES SELECCIONADOS POSITIVAMENTE EN DISTINTAS ESPECIES DE MAMIFEROS Y DROSOPHILAS, LA ALTERNATIVA EN LOS ULTIMOS 2 AÑOS HA SIDO LA BUSQUEDA DE LA FIRMAS SELECTIVAS POR GRUPOS DE ESPECIES CON LA CONSECUENTE INCAPACIDAD DE DEFINIR DIFERENCIAS ADAPTATIVAS ENTRE ESPECIES,EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTE PROYECTO ES PONER A PRUEBA LA HIPOTESIS GENERAL QUE LOS SISTEMAS BIOLOGICOS DEFINIDOS COMO EL CONJUNTO DE GENES QUE CARACTERIZAN FUNCIONES BIOLOGICAS DESDE UN PUNTO DE VISTA GENOMICO, YA SEAN GRUPOS DE GENES DEFINIDOS POR SUS ONTOLOGIAS, POR LA PERTENENCIA A RUTAS METABOLICAS COMUNES, POR SUS INTERACCIONES CON PROTEINAS DEL INTERACTOMA, Y POR SU GRADO DE COEXPRESION GENICA Y REGULACION FORMAN UNIDADES INTEGRADAS SUCEPTIBLES DE MOSTRAR VARIACION HEREDABLE EN EL EXITO REPRODUCTIVO, ES DECIR UNIDADES DE UN RANGO SUPERIOR A LOS GENES INDIVIDUALES SUCEPTIBLES DE MOSTRAR ADAPTACIONES, DE ACUERDO A ESTA HIPOTESIS ESPERAMOS ENCONTRAR DENTRO DE ESTOS SISTEMAS BIOLOGICOS GRUPOS DE GENES QUE MUESTREN: 1- FIJACION DE VARIANTES GENETICAS NO-SINONIMAS A TASAS SIGNIFICATIVAMENTE MAYORES EN DISTINTAS ESPECIES, 2- DISTRIBUCION DE LA DIVERGENCIA POBLACIONAL SIGNIFICATIVA ASOCIADA A GRUPOS DE GENES Y 3- COLOCALIZACION ADAPTATIVA DE CONJUNTOS DE GENES EN CROMOSOMAS, ESTE PROGRAMA DE TRABAJO TIENE POR LO TANTO UNA COMPONENTE DE EVOLUCION Y BIOINFORMATICA EN AREAS DE GENOMICA COMPARATIVA Y GENETICA DE POBLACIONES, DE CORROBORARSE ESTE MARCO TEORICO ESPERAMOS ENCONTRAR UNA SOLUCION A LA FALTA DE SIGNIFICACION ESTADISTICA DE LOS GRUPOS FUNCIONALES BIOLOGICAS QUE SE ALEJAN DE LA NEUTRALIDAD SELECTIVA MOSTRANDO EVIDENCIAS SIGNIFICATIVAS DE ADAPTACION Y DE SELECCION PURIFICADORA EN ESTUDIOS GENOMICOS, EL RESULTADO SERA UNA CARACTERIZACION ESTADISTICA DEL CONJUNTO DE GENES QUE COMO SISTEMA DE FUNCIONES BIOLOGICAS CONFORMAN EL PAISAJE ADAPTATIVO DE DIFERENTES ESPECIES DE MAMIFEROS Y DROSOPHILAS, EL DESARROLLO DE LAS HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS Y ESTADISTICAS NECESARIAS PARA EL ANALISIS DE ESTE PROYECTO SERAN CONSTRUIDAS PARA EL USO PUBLICO DE LOS USUARIOS INTERESADOS EN ESTE TIPO DE ANALISIS DE GENOMICA EVOLUTIVA, GENOMICA COMPARATIVA\GENOMICA FUNCIONAL\FILOGENIA\BIOLOGIA EVOLUTIVA\NATURAL SELECTION\BIOINFORMATICA\BIOLOGIA DE SISTEMAS
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