Descripción del proyecto
EN LA RESISTENCIA BASAL DE ARABIDOPSIS THALIANA (ARABIDOPSIS) FRENTE A PATOGENOS BIOTROFOS HAY UNA SEÑAL FUNDAMENTAL: EL ACIDO SALICILICO (SA), A PARTIR DE UN RASTREO GENETICO EN ARABIDOPSIS, HEMOS IDENTIFICADO CATORCE GRUPOS DE COMPLEMENTACION QUE NO SON CAPACES DE RESPONDER AL SA, NPR1 ES UNO DE ESTOS GENES, Y EL ESTUDIO DE LA SERIE ALELICA DE NPR1 NOS HA LLEVADO A ESTUDIAR LAS FUNCIONES EN DEFENSA DE SUS PARALOGOS, OTRO GEN DESCRITO ES NRB4, EL CUAL ES EL PARALOGO DE UNA SUBUNIDAD DEL COMPLEJO MEDIATOR QUE REGULA LA TRANSCRIPCION, LOS ALELOS NULOS DE NRB4 ESTAN SEVERAMENTE AFECTADOS EN EL DESARROLLO, POR LO QUE, O BIEN LA PERCEPCION DEL SA ES ESENCIAL PARA EL DESARROLLO, O NRB4 TIENE FUNCIONES ADICIONALES, EL PRIMER OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES ESTUDIAR EL PAPEL DE LA FAMILIA DE NPRS, ADEMAS DE NPR1, EL RESTO DE PARALOGOS TIENEN UNA FUNCION PEQUEÑA, PERO SIGNIFICATIVA, EN LA PERCEPCION DEL SA, NPR2 DEBE TENER UNA FUNCION ADICIONAL EN DESARROLLO, YA QUE ALGUNOS DOBLES MUTANTES ENTRE NPR2 Y OTROS PARALOGOS NO SON VIABLES, EL SEGUNDO OBJETIVO ES CARACTERIZAR LAS FUNCIONES DE NRB4 Y DESCRIBIR LAS PROTEINAS REGULADAS POR O QUE INTERACCIONAN CON NRB4, EN BASE A SU HOMOLOGIA, NRB4 PROBABLEMENTE REGULA LA TRANSCRIPCION SIN UNIRSE AL DNA, A PARTIR DE GENOTIPOS CON DIFERENTES VERSIONES DE NRB4 Y UTILIZANDO INMUNOPRECIPITACION DE CROMATINA, DATOS TRANSCRIPTOMICOS, Y OTRAS TECNICAS, DEFINIREMOS LOS GENES QUE ESTAN REGULADOS DIRECTAMENTE POR NRB4, POR OTRA PARTE, SEGUIREMOS ANALIZANDO LAS PROTEINAS QUE INTERACCIONAN CON NRB4, YA QUE EN UN RASTREO EN EL SISTEMA DE DOBLE HIBRIDO DE LEVADURA HEMOS ENCONTRADO UNA SERIE DE INTERACTORES QUE AHORA HAY QUE CORROBORAR IN PLANTA, DOS DE ESTOS INTERACTORES PERTENECEN A LA MISMA FAMILIA Y UNEN SA, EL TERCER OBJETIVO ES CONTINUAR EN LA CARACTERIZACION Y CLONACION DEL RESTO DE MUTACIONES (DOCE GRUPOS DE COMPLEMENTACION), HEMOS SECUENCIADO POBLACIONES DE MAPEO DE TODOS LOS GRUPOS DE COMPLEMENTACION, Y TAMBIEN DE ALELOS ADICIONALES DE DOS DE LOS MUTANTES, ADEMAS DE CLONAR Y ESTUDIAR LOS GENES RESPONSABLES DE LAS MUTACIONES, CARACTERIZAREMOS EL COMPORTAMIENTO DE LOS MUTANTES EN DEFENSA Y EN RESPUESTA A SA, ES IMPORTANTE DESTACAR QUE LA SELECCION DE LOS MUTANTES SE HA EFECTUADO EN BASE AL MENOR CRECIMIENTO QUE PRODUCE LA RESPUESTA AL SA EN PLANTAS SILVESTRES, POR LO QUE CABE LA POSIBILIDAD QUE ALGUNO DE LOS MUTANTES CREZCA DE FORMA NORMAL EN PRESENCIA DE SA PERO PRODUZCA DEFENSAS EN RESPUESTA AL SA, SI BIEN ES POCO PROBABLE HASTA AHORA NINGUNA DE LAS PLANTAS ANALIZADAS SEPARA ESTOS DOS FENOTIPOS- UN GENOTIPO QUE SE COMPORTASE ASI TENDRIA UN ALTO VALOR BIOTECNOLOGICO, ÁCIDO SALICÍLICO\ ARABIDOPSIS\ BTH\ RESISTENCIA