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BIO2015-66203-P

Financiado
REGULACION DEL METABOLISMO DE PSEUDOMONAS PUTIDA POR LAS PROTEINAS CRC Y HFQ, Y...
REGULACION DEL METABOLISMO DE PSEUDOMONAS PUTIDA POR LAS PROTEINAS CRC Y HFQ, Y LOS RNAS PEQUEÑOS CRCZ Y CRCY LAS BACTERIAS SON LA BASE DE MUCHOS PROCESOS BIOTECNOLOGICOS, Y SU MANIPULACION GENETICA HA PERMITIDO MEJORAR LA EFICIENCIA DE MUCHOS DE ESTOS PROCESOS, O DESARROLLAR OTROS NUEVOS, PSEUDOMONAS PUTIDA KT2440 ES UNA BACTERIA NO PATO... LAS BACTERIAS SON LA BASE DE MUCHOS PROCESOS BIOTECNOLOGICOS, Y SU MANIPULACION GENETICA HA PERMITIDO MEJORAR LA EFICIENCIA DE MUCHOS DE ESTOS PROCESOS, O DESARROLLAR OTROS NUEVOS, PSEUDOMONAS PUTIDA KT2440 ES UNA BACTERIA NO PATOGENA, METABOLICAMENTE MUY VERSATIL, FACIL DE MANIPULAR GENETICAMENTE, Y MUY UTILIZADA EN BIOTECNOLOGIA, PARA MODIFICAR SU GENOMA Y OPTIMIZAR SU RENDIMIENTO EN APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS ES IMPORTANTE CONOCER EN DETALLE LAS REDES DE REGULACION GLOBAL QUE COORDINAN Y OPTIMIZAN LA EXPRESION DE SUS DISTINTOS GENES, Y QUE DETERMINAN MUCHOS ASPECTOS DE SU METABOLISMO Y SU FISIOLOGIA, ESTE PROYECTO PROPONE ESTUDIAR TRES ASPECTOS COMPLEMENTARIOS DEL SISTEMA REGULADOR FORMADO POR LAS PROTEINAS CRC Y HFQ, Y LOS RNAS PEQUEÑOS CRCZ Y CRCY, SE TRATA DE UNO DE LOS PRINCIPALES SISTEMAS REGULADORES QUE CONTROLAN EL METABOLISMO Y LA FISIOLOGIA DE PSEUDOMONAS PUTIDA, CRC Y HFQ INHIBEN LA TRADUCCION DE UN CONJUNTO IMPORTANTE DE MRNAS DE LA CELULA, MIENTRAS QUE CRCZ Y CRCY ANTAGONIZAN EL EFECTO DE CRC Y HFQ, POSIBLEMENTE SECUESTRANDOLAS, EL PRIMER OBJETIVO DEL PROYECTO DERIVA DE LA RECIENTE APARICION DE LA PROTEINA HFQ COMO UN NUEVO COMPONENTE ESENCIAL DE ESTE SISTEMA REGULADOR, Y PRETENDE ANALIZAR CUAL ES EL PAPEL RELATIVO DE LAS PROTEINAS CRC Y HFQ EN LA REGULACION DE LA EXPRESION DEL GENOMA, AUNQUE EN OTRAS BACTERIAS HFQ FACILITA EL APAREAMIENTO ENTRE RNAS PEQUEÑOS Y SUS MRNA DIANA, EN ESTE CASO FUNCIONA POR UN MECANISMO DIFERENTE, POSIBLEMENTE GRACIAS A LA INTERVENCION DE CRC, MEDIANTE RNA-SEQ, PROTEOMICA, Y DIVERSAS TECNICAS MOLECULARES, PRETENDEMOS DETERMINAR QUE GENES ESTAN REGULADOS POR LA ACCION CONJUNTA DE LAS PROTEINAS CRC Y HFQ, Y CUALES ESTAN REGULADOS SOLO POR HFQ, O SOLO POR CRC, ESPERAMOS QUE LOS RESULTADOS CLARIFIQUEN COMO CONTRIBUYE CRC A LA FUNCION DE HFQ, ALGO QUE AUN NO SE ENTIENDE BIEN, EL SEGUNDO OBJETIVO PRETENDE ENTENDER COMO SE REGULAN LOS NIVELES DE LOS RNAS PEQUEÑOS CRCZ Y CRCY, Y OBTENER EVIDENCIAS QUE PERMITAN DILUCIDAR HASTA QUE PUNTO ES CORRECTO EL MODELO ACTUALMENTE EN VIGOR QUE SUGIERE QUE CRCZ Y CRCY ANTAGONIZAN EL EFECTO DE LAS PROTEINAS HFQ Y CRC UNIENDOSE A ELLAS (AL MENOS, A HFQ), SECUESTRANDOLAS E IMPIDIENDO QUE ACTUEN SOBRE SUS MRNAS DIANA, EL TERCER OBJETIVO DERIVA DE UN TRABAJO QUE HEMOS REALIZADO RECIENTEMENTE QUE MUESTRA COMO P, PUTIDA VA CONSUMIENDO PROGRESIVAMENTE, DE FORMA SECUENCIAL Y JERARQUICA, LOS DISTINTOS AMINOACIDOS, AZUCARES Y ACIDOS ORGANICOS PRESENTES EN UN MEDIO RICO A MEDIDA QUE CRECE, Y LA INFLUENCIA DEL SISTEMA CRC/HFQ EN ESTE PROCESO, PROPONEMOS UTILIZAR ESTOS DATOS PARA MODELIZAR LOS CAMBIOS QUE SE PRODUCEN EN LOS FLUJOS METABOLICOS DE LA CELULA A MEDIDA QUE VA CONSUMIENDO DE FORMA SECUENCIAL LOS RECURSOS DISPONIBLES EN UN MEDIO RICO, Y COMO CRC/HFQ MODULAN ESTOS FLUJOS, ESTO SE REALIZARA UTILIZANDO UN MODELO METABOLICO IN SILICO DESARROLLADO POR J, NOGALES (CIB-CSIC, MADRID), EN CONJUNTO, LOS RESULTADOS PERMITIRAN ENTENDER MEJOR LA FISIOLOGIA DE P, PUTIDA CUANDO CRECE EN ESTE TIPO DE MEDIOS NO DEFINIDOS, AMPLIAMENTE UTILIZADOS, Y FACILITARA LA UTILIZACION DE ESTA BACTERIA MODELO EN APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS, EXPRESIÓN GÉNICA\RNAS PEQUEÑOS\FLUJOS METABÓLICOS\REPRESIÓN CATABÓLICA\BIOTECNOLOGÍA\BACTERIAS ver más
01/01/2015
CSIC
225K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2015-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 225K€
Líder del proyecto
AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Perfil tecnológico TRL 2-3 552M