Descripción del proyecto
MUCHOS PROCESOS BIOTECNOLOGICOS UTILIZAN BACTERIAS, LA MANIPULACION GENETICA DE LAS BACTERIAS IMPLICADAS HA PERMITIDO MEJORAR LA EFICIENCIA DE MUCHOS DE ESTOS PROCESOS, O DESARROLLAR OTROS NUEVOS, PSEUDOMONAS PUTIDA KT2440 ES UNA BACTERIA NO PATOGENA, METABOLICAMENTE MUY VERSATIL, BIEN ESTUDIADA Y MUY UTILIZADA EN APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS COMO BIOTRANSFORMACIONES, BIORREMEDIACION, SINTESIS DE BIOPLASTICOS O BIOCOMBUSTIBLES, ETC, PARA MODIFICAR SU GENOMA Y OPTIMIZAR SU RENDIMIENTO EN APLICACIONES BIOTECNOLOGICAS ES IMPORTANTE CONOCER EN DETALLE COMO FUNCIONAN LAS REDES DE REGULACION GLOBAL QUE COORDINAN Y OPTIMIZAN LA EXPRESION DE SU GENOMA, Y QUE DETERMINAN MUCHOS ASPECTOS DE SU METABOLISMO Y SU FISIOLOGIA, ENTENDER EL FUNCIONAMIENTO DE UN MICROORGANISMO COMO UN SISTEMA INTEGRADO ES UNO DE LOS RETOS FUNDAMENTALES DE LA BIOLOGIA, Y ES LA MEJOR MANERA DE ABORDAR PROYECTOS DE INGENIERIA METABOLICA, LA MANIPULACION DE LOS CIRCUITOS REGULADORES DE P, PUTIDA AYUDARA A OBTENER ESTIRPES BACTERIANAS MAS PRODUCTIVAS Y UTILES, DISEÑADAS A MEDIDA PARA GENERAR PRODUCTOS DE INTERES O REALIZAR TAREAS CONCRETAS, ESTE PROYECTO SE CENTRA EN EL SISTEMA DE REGULACION GLOBAL FORMADO POR LAS PROTEINAS CRC Y HFQ, Y LOS RNAS PEQUEÑOS CRCZ Y CRCY, QUE CONTROLAN DIVERSOS ASPECTOS DEL METABOLISMO Y LA FISIOLOGIA DE P, PUTIDA, CRC Y HFQ INHIBEN LA TRADUCCION DE UN CONJUNTO IMPORTANTE DE MARNS, MIENTRAS QUE CRCZ/CRCY ANTAGONIZAN EL EFECTO DE ESTAS PROTEINAS, UN PAPEL CLAVE DE CRC/HFQ ES CONTROLAR LA ASIMILACION SECUENCIAL Y JERARQUICA DE LAS DIFERENTES FUENTES DE CARBONO DISPONIBLES EN EL MEDIO DE CRECIMIENTO, OPTIMIZANDO EL METABOLISMO Y LA TASA DE CRECIMIENTO, RECIENTEMENTE HEMOS OBSERVADO QUE P, PUTIDA CAMBIA LA CONFIGURACION DE SUS FLUJOS METABOLICOS VARIAS VECES DURANTE SU CRECIMIENTO EXPONENCIAL EN UN MEDIO COMPLEJO, MANTENIENDO SIN EMBARGO UNA TASA DE CRECIMIENTO ESTABLE, EL CAMBIO DE FLUJOS REFLEJA LA ADAPTACION DE LAS CELULAS AL CONSUMO SECUENCIAL Y JERARQUICO DE LAS FUENTES DE CARBONO DISPONIBLES, LAS PROTEINAS CRC/HFQ PARTICIPAN EN LA REGULACION DE ESTOS FLUJOS METABOLICOS, PERO SU INFLUENCIA REAL AUN NO SE ENTIENDE DEL TODO, ASPECTO QUE SE ANALIZARA A FONDO EN ESTE PROYECTO, LA PROTEINA HFQ PARECE REALIZAR ALGUNAS FUNCIONES REGULADORAS SIN LA AYUDA DE CRC, ANALIZAREMOS DOS EJEMPLOS DE ESTE TIPO, EN PRIMER LUGAR, PROPONEMOS ESTUDIAR EL MECANISMO QUE REGULA LA TRANSPOSICION DE LA SECUENCIA DE INSERCION ISPPU9 DE P, PUTIDA KT2440, Y EL PAPEL QUE HFQ PARECE JUGAR EN EL PROCESO, POSIBLEMENTE CONECTANDO LA FRECUENCIA DE TRANSPOSICION CON EL ESTADO FISIOLOGICO DE LA CELULA, LOS RESULTADOS AYUDARAN A ENTENDER EL COMPORTAMIENTO Y LA REGULACION DE ESTA SECUENCIA DE INSERCION, QUE PARECE TENER UNA ALTA SELECTIVIDAD DE DIANA Y PODRIA SER UTIL EN EL DESARROLLO FUTURO DE NUEVAS HERRAMIENTAS PARA LA MANIPULACION DEL GENOMA, FINALMENTE, PROPONEMOS ESTUDIAR EL PAPEL DE HFQ EN LA EXPRESION DE LA RUTA DE DEGRADACION DE ACETOINA, QUE PODRIA SER RELEVANTE PARA EL CRECIMIENTO DE P, PUTIDA EN LA RIZOSFERA, BACTERIAS\EXPRESIÓN GÉNICA\RNAS PEQUEÑOS\FLUJOS METABÓLICOS\INGENIERÍA METABÓLICA\REPRESIÓN CATABÓLICA\BIOTRANSFORMACIONES