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PID2021-126543OB-C21

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PROCESADO DE SEÑAL Y APRENDIZAJE AUTOMATICO PARA CROMATOGRAFIA DE GASES - ESPECT...

PROCESADO DE SEÑAL Y APRENDIZAJE AUTOMATICO PARA CROMATOGRAFIA DE GASES - ESPECTROMETRIA DE MOVILIDAD DE IONES: DE LA SEÑAL EN CRUDO A LOS BIOMARCADORES VOLATILES PARA CANCER LA VOLATILOMICA SE REFIERE AL ESTUDIO DE LA PORCION VOLATIL DEL METABOLOMA. ES UN AREA DE INVESTIGACION EMERGENTE, CENTRADA PRINCIPALMENTE EN GASES Y COMPUESTOS ORGANICOS VOLATILES (COV) RELACIONADOS CON LA SALUD, CON LA PROMESA D... ver más

01/01/2021

FUNDACIO INSTITUT...

200K€

Presupuesto del proyecto: 200K€

Líder del proyecto

FUNDACIO INSTITUT DE BIOENGINYERIA DE CATALUN... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

FUNDACIO INSTITUT DE BIOENGINYERIA DE CATALUN... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 200K€

Descripción del proyecto LA VOLATILOMICA SE REFIERE AL ESTUDIO DE LA PORCION VOLATIL DEL METABOLOMA. ES UN AREA DE INVESTIGACION EMERGENTE, CENTRADA PRINCIPALMENTE EN GASES Y COMPUESTOS ORGANICOS VOLATILES (COV) RELACIONADOS CON LA SALUD, CON LA PROMESA DE PROPORCIONAR HERRAMIENTAS DE DIAGNOSTICO Y DETECCION NO INVASIVAS. EL OBJETIVO PRINCIPAL DE LA VOLATOLOMICA ES DETECTAR Y LUEGO RECONOCER PATRONES DE COV RELACIONADOS CON LOS PROCESOS METABOLICOS EN LOS SERES VIVOS. COMO EN MUCHAS OTRAS CIENCIAS OMICAS, LA VOLATILOMICA TIENE UN FUERTE COMPONENTE DE PROCESAMIENTO DE DATOS. LA INSTRUMENTACION ANALITICA ACTUAL PROPORCIONA UNA GRAN CANTIDAD DE DATOS COMPLEJOS EN BRUTO CON ABUNDANTES PROBLEMAS INSTRUMENTALES QUE IMPIDEN UNA FACIL INTERPRETACION. EN LOS ULTIMOS AÑOS, EL GRUPO IBEC HA TRABAJADO EN SOLUCIONES DE PROCESAMIENTO DE SEÑALES Y DATOS PARA EL ANALISIS DE ESPECTROS DE MOVILIDAD IONICA (IMS). EN COMPARACION CON LOS ESPECTROMETROS DE MASAS CONVENCIONALES, LA MOVILIDAD IONICA ES UNA ALTERNATIVA MAS BARATA CON POTENCIAL DE MINIATURIZACION, QUE PROPORCIONA UN ANALISIS RAPIDO Y TIENE UNA SENSIBILIDAD EXTREMA PARA ALGUNAS FAMILIAS QUIMICAS. POR EL CONTRARIO, IMS TIENE UNA RESOLUCION MAS BAJA, UN RANGO DINAMICO LINEAL LIMITADO Y ES MUY SENSIBLE A LOS EFECTOS DE LA MATRIZ. ADEMAS, LA APLICACION DE METODOS DE APRENDIZAJE AUTOMATICO PARA LA IDENTIFICACION DE BIOMARCADORES, LA TOMA DE HUELLAS DIGITALES DE COV Y LA APLICACION DE MODELOS PREDICTIVOS PARA EL DIAGNOSTICO Y EL PRONOSTICO AUN SE ENCUENTRAN EN SU INFANCIA. ESTE PROYECTO SE BASA EN LA EXPERIENCIA ADQUIRIDA EN EL PROYECTO ANTERIOR TENSOMICS (RTI2018-098577-B-C22). EN ESTE PROYECTO, DESARROLLAMOS UN FLUJO DE TRABAJO COMPLETO PARA EL ANALISIS NO DIRIGIDO DE DATOS DE GAS CHROMATOGRAPHY-IMS, INCLUYENDO EL PROCESAMIENTO DE SEÑALES Y EL APRENDIZAJE AUTOMATICO PARA LA PREDICCION DE CLASES . MAS ALLA DE ESO, ADQUIRIMOS UN INSTRUMENTO GC-IMS Y DESARROLLAMOS PROTOCOLOS DE OPERACION ESTANDARIZADOS OPTIMIZADOS PARA ANALISIS DE ORINA, QUE PERMITEN LA DETECCION DE ALREDEDOR DE 200 COMPUESTOS VOLATILES POR MUESTRA. A PESAR DE LOS AVANCES, LA DIFICULTAD PARA LA IDENTIFICACION QUIMICA MEDIANTE IMS, PONE SERIAS DIFICULTADES EN LA TRADUCCION DE LOS RESULTADOS OBTENIDOS A LA PRACTICA BIOMEDICA. ESTE PROYECTO PROPONE UN ENFOQUE COMPLEMENTARIO BASADO EN UN ENFOQUE DIRIGIDO. COMENZAMOS POR CONSTRUIR UNA BIBLIOTECA EXTENSA DE METABOLITOS VOLATILES CLAVE CUYA PRESENCIA SE HA DESCRITO PREVIAMENTE EN LA ORINA Y QUE PERTENECEN A PROCESOS METABOLICOS ESENCIALES. AQUI OPTIMIZAREMOS EL FLUJO DE TRABAJO DE PROCESAMIENTO DE SEÑALES HACIA LA DETECCION Y CUANTIFICACION OPTIMAS DE LOS ELEMENTOS DE LA BIBLIOTECA, CUYA IDENTIDAD QUIMICA ES BIEN CONOCIDA A PRIORI. CARACTERIZAREMOS EL COMPORTAMIENTO METROLOGICO EN CUANTO A LA CUANTIFICACION DE ESTOS COMPUESTOS UTILIZANDO FACTORES DE CALIDAD COMO EL LIMITE DE DETECCION Y LA INCERTIDUMBRE DE MEDIDA. SI SE ENCUENTRA INFORMACION DISCRIMINATORIA RELEVANTE EN LOS COMPUESTOS DE LA BIBLIOTECA, EL CONOCIMIENTO DE LA IDENTIDAD QUIMICA PERMITIRA UN MAYOR ESCRUTINIO EN OTRAS PLATAFORMAS ANALITICAS Y UNA POSIBLE INTERPRETACION A NIVEL METABOLICO. EN LA PARTE FINAL DEL PROYECTO, LA INTEGRACION DE DATOS DE LOS RESULTADOS OBTENIDOS EN LAS MISMAS MUESTRAS MEDIANTE LAS DIFERENTES TECNICAS ANALITICAS PROPORCIONARA INFORMACION MAS RICA Y NUEVAS RUTAS PARA LA ANOTACION DE METABOLITOS. PRENDIZAJE AUTOMATICO\BIOMARCADORES VOLATILES\ESPECTROMETRIA DE MASAS\ESPECTROMETRIA DE MOVILIDAD IONICA\CROMATOGRAFIA DE GASES\IDENTIFICACION DE BIOMARCADORES\AGRUPAMIENTO DE PICOS\DETECCION DE PICOS\CANCER\DESCUBRIMIENTO BIOMARCADORES

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