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RTI2018-098577-B-C22

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DEVELOPMENT OF TENSORIAL SIGNAL PROCESSING AND MACHINE LEARNING TOOLS TAILORED T...

DEVELOPMENT OF TENSORIAL SIGNAL PROCESSING AND MACHINE LEARNING TOOLS TAILORED TO THE ANALYSIS OF URINE METABOLOMICS LA VOLATOLOMICA ES LA DISCIPLINA QUE ESTUDIA LA FRACCION VOLATIL DEL METABOLOMA, ES UN CAMPO DE INVESTIGACION EMERGENTE QUE SE CENTRA PRINCIPALMENTE EN EL ANALISIS DE COMPUESTOS ORGANICOS VOLATILES (COVS) Y GASES RELACIONADOS CON... ver más

01/01/2018

FUNDACIO INSTITUT...

89K€

Presupuesto del proyecto: 89K€

Líder del proyecto

FUNDACIO INSTITUT DE BIOENGINYERIA DE CATALUN... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2018-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

FUNDACIO INSTITUT DE BIOENGINYERIA DE CATALUN... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 89K€

Descripción del proyecto LA VOLATOLOMICA ES LA DISCIPLINA QUE ESTUDIA LA FRACCION VOLATIL DEL METABOLOMA, ES UN CAMPO DE INVESTIGACION EMERGENTE QUE SE CENTRA PRINCIPALMENTE EN EL ANALISIS DE COMPUESTOS ORGANICOS VOLATILES (COVS) Y GASES RELACIONADOS CON LA SALUD Y, EN ESTE SENTIDO, ES UNA DISCIPLINA PROMETEDORA POR SU CAPACIDAD PARA GENERAR TECNICAS DE DIAGNOSTICO NO INVASIVAS, EL OBJETIVO PRINCIPAL DE LA VOLATOLOMICA ES IDENTIFICAR Y POSTERIORMENTE DETECTAR PATRONES DE COV RELACIONADOS CON PROCESOS METABOLICOS EN SERES VIVOS, COMO EN MUCHAS OTRAS CIENCIAS OMICAS, LA VOLATOLOMICA TIENE UN FUERTE COMPONENTE DE PROCESADO DE DATOS, EL VOLATOLOMA SE PUEDE ANALIZAR MEDIANTE UNA SERIE DE TECNICAS CON DIFERENTE SOFISTICACION Y RENDIMIENTO: DESDE TECNICAS DE REFERENCIA BASADAS CROMATOGRAFIA Y ESPECTROMETRIA DE MASAS (GC/MS OR GCXGC/MS) HASTA INSTRUMENTACION MENOS COMPLEJA BASADA EN ESPECTROMETRIA DE MOVILIDAD DE IONES, LA APLICACION DE METODOS DE SELECCION DE CARACTERISTICAS EN UN MARCO DE APRENDIZAJE AUTOMATICO PARA LA IDENTIFICACION DE BIOMARCADORES, HUELLAS DACTILARES COVS Y LA APLICACION DE MODELOS PREDICTIVOS PARA EL DIAGNOSTICO Y EL PRONOSTICO ESTA TODAVIA EN SU INFANCIA, EN GENERAL, LOS CONJUNTOS DE DATOS EN ESTE AMBITO PADECEN DE UNA GRAN DIMENSIONALIDAD EN LAS CARACTERISTICAS, QUE NO ESTA COMPENSADA CON EL SUFICIENTE NUMERO DE MUESTRAS, ADEMAS DEPENDIENDO DE LA TECNICA INSTRUMENTAL UTLIZADA LOS DATOS EN CRUDO SE ORGANIZAN EN CUBOS DE DIMENSION 3 O 4, LO QUE SUGIERE EL USO DE TECNICAS DE DESCOMPOSICION TENSORIAL, POR OTRO LADO, LA ESPECTROMETRIA DE MOVILIDAD DE IONES TIENE PROBLEMAS DE FALTA DE SELECTIVIDAD Y NO LINEALIDADES (EL ESPECTRO DE MOVILIDAD CAMBIA CON LA CONCENTRACION),BASADO EN LOS PROYECTOS ANTERIORES SMART-IMS(TEC2011-26143) Y SIGVOL (TEC2014-59229-R), ESTA PROPUESTA TIENE COMO OBJETIVO DESARROLLAR UN FLUJO DE PROCESADO DE SEÑAL Y DATOS COMPLETO PARA LOS PROFESIONALES DE LA VOLATOLOMICA QUE CUBRA TODO EL FLUJO DE TRABAJO DESDE EL DISEÑO DEL PROTOCOLO DE ANALISIS DE MUESTRA HASTA MODELOS PREDICTIVOS ROBUSTOS PARA USO FUTURO EN CRIBADO DE PACIENTES, LA SOLUCION SOFTWARE DESARROLLADA CUBRIRA UNA VARIEDAD DE TECNICAS INSTRUMENTALES UTILIZADAS PARA EL ANALISIS DE MUESTRAS Y PROPORCIONARA LINEAS DE TRABAJO DEDICADAS A LAS TECNICAS DE REFERENCIA COMO CROMATOGRAFIA DE GASES ESPECTROMETRIA DE MASAS PERO TAMBIEN TECNICAS INSTRUMENTALES MENOS DESARROLLADAS COMO GC-IMS (CROMATOGRAFIA DE GASES- ESPECTROSCOPIA DE MOVILIDAD DE IONES), UNA NOVEDAD DE ESTE PROYECTO ES LA EXPLORACION DE LAS POSIBILIDADES DEL LAS DESCOMPOSICIONES TENSORIALES PARA EL PROCESADO Y DECONVOLUCION DE ESTE TIPO DE DATOS, EN EL FLUJO DE TRABAJO SE INCORPORARAN TECNICAS DE MACHINE LEARNING ESPECIALMENTE ADAPTADAS PARA LOS CONJUNTOS DE DATOS VOLATOLOMICOS (POCAS MUESTRAS Y MUCHA DIMENSIONALIDAD) ASI COMO LOS METODOS MAS RECIENTES SOBRE LA COMPENSACION DE EFECTOS DE LOTE, TAMBIEN INTEGRARA LAS TECNICAS DE VALIDACION MAS EXIGENTES, EVITANDO EL PROBLEMA DE LOS FALSOS DESCUBRIMIENTOS, LAS CAPACIDADES DE LAS HERRAMIENTAS DESARROLLADAS SE DEMOSTRARAN MEDIANTE EL ANALISIS DE CONJUNTOS DE DATOS METABOLOMICS DE ORINA ENCAMINADOS HACIA EL CRIBADO DEL CANCER COLORECTAL, SI BIEN SU POTENCIAL USO SE EXTIENDE A OTROS FLUIDOS FISIOLOGICOS, PROCESADO DE SEÑAL\APRENDIZAJE AUTOMÁTICO\METABOLÓMICA\ESPECTROSCOPÍA DE MOVILIDAD DE IONES\ORINA\BIOMARCADORES\CANCER COLORECTAL\CRIBADO\ESPECTROMETRÍA DE MASAS\CROMATOGRAFÍA

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