Descripción del proyecto
AVANCES EN MICROSCOPIA DIGITAL ABREN ENORMES POSIBILIDADES PARA EL DESARROLLO DE HERRAMIENTAS DE INTELIGENCIA ARTIFICIAL (IA) Y LA EVALUACION DE NUEVOS Y EFICIENTES SISTEMAS DE IMAGEN. EL DESAFIO ES USAR DE MANERA EFICIENTE ESTAS TECNOLOGIAS EMERGENTES, TANTO DE HARDWARE COMO DE SOFTWARE, PARA PROCESAR TODOS LOS DATOS DISPONIBLES. ASI, LA MICROSCOPIA DIGITAL CONSISTE EN EL DISEÑO CONJUNTO DE SOFTWARE Y HARDWARE, OPTIMIZANDO EL FLUJO DE TRABAJO DESDE LA ADQUISICION HASTA EL ANALISIS. UNA DE LAS MUCHAS APLICACIONES DE LA MICROSCOPIA DIGITAL EN BIOLOGIA ES LA IDENTIFICACION DE FITOPLANCTON (GRUPOS DE AGUA DULCE: DIATOMEAS Y CIANOBACTERIAS).LA IDENTIFICACION Y CUANTIFICACION PRECISA DE FITOPLANCTON SON TAREAS FUNDAMENTALES PARA LA GESTION DE CUENCAS HIDROGRAFICAS, LA PRODUCCION DE AGUA POTABLE, EL USO RECREATIVO DEL AGUA Y SU REUTILIZACION. EN LA PRACTICA RUTINARIA ESTO SE HACE MANUALMENTE CON EL MICROSCOPIO, LO CUAL ES COSTOSO, EN TIEMPO Y RECURSOS. SE NECESITAN METODOS DE IDENTIFICACION Y CUANTIFICACION AUTOMATICA, RAPIDOS Y FIABLES. ES FUNDAMENTAL IMPLEMENTAR LA MEDICION AUTOMATICA A TRAVES DE SENSORES U OTRAS HERRAMIENTAS ANALITICAS PARA HABILITAR SISTEMAS DE ALARMA TEMPRANA PARA GESTION DE RECURSOS HIDRICOS.HAREMOS UN ENFOQUE DE MICROSCOPIA "COMBINADO" BASADO EN UN SISTEMA IN SITU DE BAJO COSTE PARA LA ADQUISICION AUTOMATICA DE IMAGENES FLUORESCENTES Y DE CAMPO CLARO. ADEMAS, SE UTILIZARAN METODOS DE IA DE VANGUARDIA BASADOS EN APRENDIZAJE PROFUNDO PARA IDENTIFICAR Y CARACTERIZAR ESTRUCTURAS DE INTERES PARA LA APLICACION EN CUESTION, INTEGRADO TODO ELLO EN UNA PLATAFORMA.ESTE PROYECTO CONTRIBUYE A LOS DESAFIOS DE LA TRANSICION ECOLOGICA Y DIGITAL. LA DIGITALIZACION DEMOCRATIZA LA INVESTIGACION BASADA EN COLECCIONES Y ES FUNDAMENTAL PARA ESTABLECER Y ANALIZAR LINEAS DE BASE BIOLOGICAS PARA EVALUAR LOS EFECTOS DEL CAMBIO CLIMATICO, LOS CAMBIOS EN EL USO DE LA TIERRA, LAS INVASIONES DE ESPECIES Y LA EXTINCION ACTUAL DE ESPECIES. MUCHOS DESAFIOS DE IDENTIFICACION TAXONOMICA, PARTICULARMENTE PARA GRUPOS TAXONOMICOS BIEN CONOCIDOS, PODRIAN SIMPLIFICARSE EN GRAN MEDIDA MEDIANTE LA AUTOMATIZACION. EL USO GENERALIZADO DE TECNICAS DE IA PARA IDENTIFICAR ESPECIMENES Y GRUPOS OBJETIVO QUE NECESITAN ATENCION, COMBINADO CON LA CAPACITACION DE TAXONOMOS EXPERTOS, MEJORARIA LA UTILIDAD DE LA RECOLECCION PARA LA INVESTIGACION, LA ENSEÑANZA Y LA GESTION. EL ESCENARIO IDEAL SERIA PROPORCIONAR A LOS INVESTIGADORES PLATAFORMAS COLABORATIVAS EN LINEA QUE INCLUYAN COLECCIONES DIGITALIZADAS, ASI COMO HERRAMIENTAS DE IA CAPACES DE IDENTIFICAR Y CLASIFICAR TAXONES. ESTA PLATAFORMA EN LINEA PODRIA MEJORARSE CON HERRAMIENTAS DE PROCESAMIENTO ADICIONALES QUE HAGAN USO DE DATOS Y METADATOS COMPLEMENTARIOS.NUESTRA PROPUESTA SE CENTRARA EN LOS TAXONES DE AGUA DULCE, CON EL PROPOSITO DE DESARROLLAR UN CENTRO TAXONOMICO INTEGRAL MEDIANTE EL USO DE HERRAMIENTAS BASADAS EN IA Y SISTEMAS TECNOLOGICOS AVANZADOS. LOS OBJETIVOS SON:A) DESARROLLAR UNA PLATAFORMA WEB DE CODIGO ABIERTO QUE INTEGRE HERRAMIENTAS DE IA PARA LA IDENTIFICACION DE FITOPLANCTON Y AYUDAR A LOS BIOLOGOS A CREAR BASES DE CONOCIMIENTO Y GUIAS DE CAMPO; B) IMPLEMENTAR UN DISPOSITIVO DE BAJO COSTE PARA LA ADQUISICION DE IMAGENES PARA EL MONITOREO IN SITU CON COMPUTACION DE BORDE; C) DESARROLLAR CONJUNTOS DE DATOS FACILMENTE ACCESIBLES Y UTILIZABLES Y D) DIFUNDIR Y DIVULGAR A DIFERENTES NIVELES, INCLUIDAS ACCIONES PARA EVALUAR LA PLATAFORMA, ASI COMO CIENCIA CIUDADANA Y TRANSFERENCIA DE CONOCIMIENTO.