Plataforma de genómica para secuenciación de célula única y masiva
La actuación propone la adquisición de un equipamiento integrado de genómica, cuyos principales componentes serían un sistema para secuenciación a partir de célula única y una plataforma de secuenciación masiva (NGS, Next Generati...
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Descripción del proyecto
La actuación propone la adquisición de un equipamiento integrado de genómica, cuyos principales componentes serían un sistema para secuenciación a partir de célula única y una plataforma de secuenciación masiva (NGS, Next Generation Sequencing), Respecto al primero, se trata de un sistema robusto y automatizado de selección y preparación de células, que permite su posterior secuenciación, No hay un instrumento de similares características en la Región de Murcia, y su adquisición posibilitaría la apertura y potenciación de líneas relacionadas con la investigación en cáncer, En concreto, el grupo de Inmunidad, inflamación y cáncer (E0A8-05) podría implantar la secuenciación a partir de una sola célula en xenotrasplantes derivados de pacientes de melanoma y glioblastoma, para identificar biomarcadores con aplicación en quimioterapia, El grupo de Hematología y oncología clínico experimental (E037-06) relanzaría sus estudios de leucemia linfocítica crónica en los que demanda secuenciación a partir de célula única, para investigar la heterogeneidad celular en neoplasias de este tipo, Por otra parte, la adquisición de un secuenciador masivo de tamaño intermedio (lecturas de 2 x300 pb hasta 15 Gb y 25-50 millones de lecturas) permitirá dar soporte a un gran número de grupos de investigación en secuenciación de pequeños genomas de virus, bacterias y hongos, secuenciación dirigida a regiones concretas de genomas de gran tamaño y en el resto de aplicaciones genéricas de NGS,
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