Descripción del proyecto
LA ULTIMA DECADA HA VISTO UN AUMENTO CRECIENTE DE LA EVIDENCIA SOBRE LA ENORME PARTICIPACION DE LA MICROBIOTA EN LOS PROCESOS BIOLOGICOS Y LAS ENFERMEDADES HUMANAS. DE TODO ESTE CUERPO DE INVESTIGACION SE CONCLUYE QUE EL MICROBIOMA INFLUYE EN LA SALUD HUMANA A TRAVES DEL ESTABLECIMIENTO DE INTERACCIONES MOLECULARES ENTRE METABOLITOS Y RECEPTORES HUESPED / BACTERIANOS, DANDO COMO RESULTADO UNA SIMBIOSIS HUESPED-MICROBIANA DE CARACTER PARASITARIO, COMENSAL O MUTUALISTA, MEDIADA A TRAVES DE PEQUEÑAS MOLECULAS QUE MODULAR LOS PROCESOS BIOLOGICOS Y LAS ENFERMEDADES DEL HOSPEDADOR. LOS METABOLITOS PUEDEN TENER DIFERENTES FUENTES: PUEDEN SER SINTETIZADOS DIRECTAMENTE POR CELULAS MICROBIANAS, RESULTAR DEL PROCESAMIENTO DE MOLECULAS INGERIDAS O DERIVARSE DE LA MODIFICACION MICROBIANA DE METABOLITOS DEL HOSPEDADOR. ESTOS DAN COMO RESULTADO CLASES DE COMPUESTOS MUY DIFERENTES, CON DIFERENTES ESPECIFICIDADES Y BIODISTRIBUCION.ESTE PROYECTO TIENE COMO OBJETIVO DESARROLLAR UNA PLATAFORMA COMPUTACIONAL PARA EL DISEÑO DE FARMACOS MIMETIZADORES DE METABOLITOS Y NUTRACEUTICOS, MEDIANTE EL USO DE UNA COMBINACION DE TRES METODOLOGIAS COMPUTACIONALES: QUIMIOINFORMATICA, BIOINFORMATICA E INTELIGENCIA ARTIFICIAL.EL PROYECTO COMPRENDERA, EN PRIMER LUGAR, LA CARACTERIZACION DEL METABOLOMA HUMANO DESDE UN PUNTO DE VISTA FISICOQUIMICO, ESTRUCTURAL, DE BIODISTRIBUCION Y DE DIANAS BIOLOGICAS. PARA ELLO, SE UTILIZARAN BASES DE DATOS DE METABOLITOS HUMANOS, COMO EL HUMAN METABOLOME DATABASE, JUNTO CON BASES DE DATOS QUIMIOGENOMICAS COMO CHEMBL, PUBCHEM, ETC.LUEGO, UTILIZARA LOS DATOS OMICOS PUBLICADOS (INCLUIDA LA GENOMICA Y LA METABOLOMICA), LAS ESTRUCTURAS CRISTALOGRAFICAS Y EL SCREENING VIRTUAL BASADO EN ESTRUCTURA, PARA IDENTIFICAR LAS INTERACCIONES METABOLITO-DIANA DE RELEVANCIA PARA LA ENFERMEDAD (P. EJ., ENFERMEDAD INFLAMATORIA INTESTINAL, DIABETES TIPO 2, ETC.), POR ANALISIS SISTEMATICO DE ASOCIACIONES LONGITUDINALES ENTRE EXPRESION GENICA DIFERENCIAL Y CONCENTRACIONES DIFERENCIALES DE METABOLITOS. AQUI, LOS DATOS DEL HUMAN METABOLOME PROJECT Y DE METABOLIGHTS SE UTILIZARAN PRINCIPALMENTE (AUNQUE NO DE FORMA EXCLUSIVA), JUNTO CON EL PROTEIN DATA BANK Y BASES DE DATOS DE GWAS COMO EL GWAS CATALOG.A PARTIR DE AQUI, SE ENTRENARAN MODELOS DE APRENDIZAJE PROFUNDO PARA EL DISEÑO GENERATIVO DE MOLECULAS QUE MIMETIZARAN METABOLITOS CON PROPIEDADES FISICOQUIMICAS, BIODISTRIBUCION Y ACTIVIDAD BIOLOGICA ESPECIFICAS. SE SELECCIONARAN ALGUNOS CASOS MAS RELEVANTES DE INTERACCION METABOLITO-OBJETIVO PARA APLICAR ESTA METODOLOGIA.LOS RESULTADOS SERAN VALIDADOS MEDIANTE EL ESTABLECIMIENTO DE COLABORACIONES CON GRUPOS EXPERIMENTALES EN LA ACADEMIA O EN LA INDUSTRIA. ICROBIOTA\NUTRACEUTICOS\DISEÑO DE FARMACOS\BIOINFORMATICA\INTELIGENCIA ARTIFICIAL\QUIMIOINFORMATICA\METABOLITOS