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PLANT RESPONSE to friend or foe a CELL type specific nuclear proteomics appro...

PLANT RESPONSE to friend or foe a CELL type specific nuclear proteomics approach Plants respond to and must distinguish between beneficial and pathogenic bacteria (‘friend and foe’) surrounding them. Bacteria may manipulate the plant’s immune system to allow colonialization or can be resistant to plant defence... ver más

31/05/2023

MPG

163K€

Presupuesto del proyecto: 163K€

Líder del proyecto

MAXPLANCKGESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSE... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo H2020 notifico la concesión del proyecto el día 2023-05-31

MSCA-IF-2020: Individual Fellowships

I+D

Cerrada hace 4 años

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1 Participantes

MPG

162.81K€ | Lider

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Duración del proyecto: 26 meses Fecha Inicio: 2021-03-18
Fecha Fin: 2023-05-31

Líder del proyecto

MAXPLANCKGESELLSCHAFT ZUR FORDERUNG DER WISSE... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Presupuesto del proyecto 163K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto Plants respond to and must distinguish between beneficial and pathogenic bacteria (‘friend and foe’) surrounding them. Bacteria may manipulate the plant’s immune system to allow colonialization or can be resistant to plant defence responses such as the biosynthesis of specialized metabolites. It has been increasingly shown that plant responses occur in a cell type specific manner but single cell research has not yet been extensively explored in plant. Here, I propose to apply a state of the art in vivo protein proximity labelling technique to investigate responses to beneficial and pathogenic bacteria in the Arabidopsis thaliana root including the cell type specific level. The first objective of the proposed research is to determine if and to which extent there are differential plant responses to pathogenic and beneficial bacteria with Plant Growth Promoting effects (PGPB), which processes or specialized metabolites are involved in these responses and which regulatory proteins control these responses. This will be achieved through a multi-omics approach for which I will generate nuclear proteome data through protein proximity labelling, RNA-seq and metabolite data from A. thaliana seedlings exposed to a pathogen versus a PGPB. The second objective of this research will be to investigate the response regulation to a PGPB and a pathogen in specific root cell types by generating cell type specific nuclear proteome data. As the third objective I will determine the role of specific regulatory protein candidates from objectives 1 and 2 and their target cell type specific processes such as specialized metabolism or root development through individual gene by gene experiments. The proposed research will provide new insights into how plant responses to ‘friend or foe’ are regulated in different cell types. The generated datasets will be valuable for the community and provide a starting point for my own future independent research career.

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