PEPTIDOS MOVILES COMO REGULADORES DEL DESARROLLO Y LA FLORACION DEL ALTRAMUZ (LU...
PEPTIDOS MOVILES COMO REGULADORES DEL DESARROLLO Y LA FLORACION DEL ALTRAMUZ (LUPINUS ALBUS)
LOS PEPTIDOS, MOLECULAS COMPUESTAS DE 2 A 100 AMINOACIDOS, HAN SIDO IDENTIFICADOS RECIENTEMENTE COMO FACTORES REGULADORES CAPACES DE CONTROLAR MUCHOS PROCESOS DEL DESARROLLO EN DIFERENTES ORGANISMOS. EN LAS PLANTAS, LA ANOTACION D...
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Descripción del proyecto
LOS PEPTIDOS, MOLECULAS COMPUESTAS DE 2 A 100 AMINOACIDOS, HAN SIDO IDENTIFICADOS RECIENTEMENTE COMO FACTORES REGULADORES CAPACES DE CONTROLAR MUCHOS PROCESOS DEL DESARROLLO EN DIFERENTES ORGANISMOS. EN LAS PLANTAS, LA ANOTACION DE MARCOS DE ABIERTOS LECTURA CORTOS (SMALL OPEN READING FRAMES; SORF) EN GENOMAS SECUENCIADOS HA REVELADO LA EXISTENCIA DE MILES DE PEPTIDOS POTENCIALMENTE FUNCIONALES, LO QUE AÑADE UN NUEVO NIVEL DE COMPLEJIDAD A LA REGULACION DEL DESARROLLO. ENTRE LAS ESPECIES LEGUMINOSAS ENCONTRAMOS ALGUNOS DE LOS CULTIVOS MAS RELEVANTES EN TERMINOS AGRONOMICOS Y CON UN GRAN POTENCIAL PARA FOMENTAR UN DESARROLLO SOSTENIBLE: SU CULTIVO ENRIQUECE EL SUELO, YA QUE SON CAPACES DE FIJAR NITROGENO ATMOSFERICO, Y SUS SEMILLAS TIENEN UN ALTO CONTENIDO PROTEICO, SIENDO UNA FUENTE MUY RICA PARA LA ELABORACION DE PRODUCTOS PARA CONSUMO ANIMAL Y HUMANO. EL TIEMPO DE FLORACION ES UN FACTOR CLAVE QUE INFLUYE EN EL RENDIMIENTO Y LA PRODUCTIVIDAD DE LOS CULTIVOS. EL TIEMPO DE FLORACION EN ESPECIES LEGUMINOSAS, COMO EN MUCHAS OTRAS PLANTAS, ESTA CONTROLADO POR UNA COMPLEJA RED DE FACTORES REGULADORES QUE INTEGRAN LAS SEÑALES AMBIENTALES E LAS ENDOGENAS PARA DESENCADENAR EL CAMBIO DE FASE EN EL MOMENTO ADECUADO. EL CONTROL GENETICO DEL TIEMPO DE FLORACION HA SIDO AMPLIAMENTE ESTUDIADO EN ARABIDOPSIS, ASI COMO EN VARIAS ESPECIES DE LEGUMINOSAS. ESOS ESTUDIOS MOSTRARON QUE EL FOTOPERIODO Y LA VERNALIZACION SON DOS DE LAS SEÑALES CLAVE QUE MODULAN LA FLORACION.EL OBJETIVO DEL PROYECTO LUPIN PEPCODE ES LA IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION FUNCIONAL DE NUEVOS PEPTIDOS MOVILES PRESENTES EN EL FLOEMA IMPLICADOS EN LA REGULACION DE RASGOS CLAVE DEL DESARROLLO, COMO LA FLORACION Y LA ARQUITECTURA DE LA PLANTA, EN LUPINUS ALBUS (ALTRAMUZ BLANCO) Y ARABIDOPSIS. EL ALTRAMUZ BLANCO ES UNA LEGUMINOSA INFRAUTILIZADA EN EUROPA PERO CON UN GRAN POTENCIAL COMO CULTIVO PROTEICO. SU USO EN ROTACION CON CEREALES MEJORA LA CALIDAD Y EL RENDIMIENTO DEL SUELO. SIN EMBARGO, EL CULTIVO DEL ALTRAMUZ BLANCO SE HA VISTO OBSTACULIZADA POR LA FALTA DE INFORMACION SOBRE EL CONTROL GENETICO DE LOS RASGOS DE INTERES EN ESTA ESPECIE, IMPIDIENDO ASI LA APLICACION DE TECNICAS DE MEJORA MODERNAS. EN ESTE MARCO, ES DE GRAN INTERES DESCUBRIR FACTORES REGULADORES DE LA FLORACION O RASGOS RELACIONADOS, COMO LA ARQUITECTURA DE LA PLANTA, EN EL ALTRAMUZ. EL PROYECTO ABORDA ESTA TAREA MEDIANTE UN ENFOQUE MULTIDISCIPLINARIO QUE INTEGRA DATOS DEL ANALISIS BIOINFORMATICO DE SECUENCIAS GENOMICAS, EVIDENCIAS EXPERIMENTALES DE PRESENCIA DE PEPTIDOS EN EL FLOEMA Y LA CARACTERIZACION FUNCIONAL DE LOS PEPTIDOS IDENTIFICADOS. LA IDENTIFICACION MEDIANTE ANALISIS PROTOMICOS DE PEPTIDOS EN EXUDADOS FLOEMATICOS EN DIFERENTES ETAPAS DEL DESARROLLO Y EN PRESENCIA O AUSENCIA DE VERNALIZACION PROPORCIONARA UNA LISTA DE POSIBLES PEPTIDOS DE SEÑALIZACION. EL USO DE TECNICAS BIOINFORMATICAS BASADAS EN MACHINE LEARNING PARA PREDECIR SECUENCIAS CON POTENCIAL PARA CODIFICAR PEPTIDOS FUNCIONALES EN EL GENOMA DEL ALTRAMUZ BLANCO PROPORCIONA ROBUSTEZ AL ANALISIS PROTEOMICO. ASIMISMO, ENSAYOS DE TIPOS RIBOSEQ PROPORCIONARAN PRUEBAS ADICIONALES DE TRADUCCION ACTIVA DE SECUENCIAS. LA INTEGRACION DE TODOS ESTOS DATOS NOS PERMITIRA DE FORMA ROBUSTA LOS MEJORES PEPTIDOS CANDIDATOS PARA SU CARACTERIZACION FUNCIONAL. EN EL PASO FINAL, LOS PEPTIDOS SELECCIONADOS SE CARACTERIZARAN FUNCIONALMENTE, REVELANDO CUALQUIER POSIBLE VINCULO CON EL CONTROL DE LA RESPUESTA DE FLORACION EN ARABIDOPSIS Y/O EN EL ALTRAMUZ BLANCO. LORACION\MEJORA\SOSTENIBILIDAD\CULTIVO PROTEICO\LEGUMBRES\ARQUITECTURA DE LA PLANTA\DESARROLLO DE PLANTAS\ALTRAMUZ\FLOEMA\PEPTIDOS SEÑALIZADORES
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