Descripción del proyecto
LA SIMBIOSIS FIJADORA DE N2 ENTRE RIZOBIOS Y LEGUMINOSAS ES DE INDUDABLE IMPORTANCIA PARA UNA AGRICULTURA SOSTENIBLE Y POR EL COMPLEJO DIALOGO MOLECULAR QUE SE ESTABLECE ENTRE LOS SIMBIONTES Y QUE COMPARTE ALGUNAS CARACTERISTICAS CON EL EXISTENTE ENTRE VARIAS BACTERIAS PATOGENAS DE PLANTAS Y DE MAMIFEROS Y SUS HOSPEDADORES. NUESTRO GRUPO TRABAJA CON LA BACTERIA SINORHIZOBIUM FREDII HH103, SIMBIONTE DE AMPLIO RANGO DE HOSPEDADOR QUE INCLUYE A LA SOJA, DE GRAN INTERES AGRONOMICO, Y LEGUMINOSAS FORMADORAS DE DISTINTOS TIPOS DE NODULOS. SU AMPLIO RANGO DE NODULACION LA DIFERENCIA DE RIZOBIOS BIEN ESTUDIADOS COMO S. MELILOTI, POR LO QUE S. FREDII HH103 ES MUY INTERESANTE PARA ESTUDIAR LA SIMBIOSIS RIZOBIO-LEGUMINOSA. GRACIAS A NUESTROS PROYECTOS ANTERIORES, S. FREDII HH103 ES UNO DE LOS RIZOBIOS MEJOR CONOCIDOS, PERO AUN QUEDAN MUCHOS GENES DE RELEVANCIA SIMBIOTICA POR CARACTERIZAR. LA SECUENCIACION Y ANOTACION MANUAL DEL GENOMIO DE HH103 Y ESTUDIOS TRANSCRIPTOMICOS DEL EFECTO DE FLAVONOIDES SOBRE LA EXPRESION GENICA REALIZADOS EN LA ESTIRPE SILVESTRE Y EN MUTANTES EN DIVERSOS GENES REGULADORES NOS HAN PERMITIDO IDENTIFICAR GENES MUY PROBABLEMENTE IMPLICADOS EN SIMBIOSIS QUE HASTA EL MOMENTO NO SE HAN ESTUDIADO NI EN S. FREDII NI, LA MAYORIA, EN NINGUN RIZOBIO. POR ELLO, SU ESTUDIO TRASCIENDE LA SIMBIOSIS DE S. FREDII CON SUS PLANTAS HOSPEDADORAS YA QUE PUEDE PERMITIR LA IDENTIFICACION DE NUEVOS DETERMINANTES MOLECULARES DE INTERES GENERAL EN EL CAMPO DE LA SIMBIOSIS RIZOBIO-LEGUMINOSA.LOS GENES IDENTIFICADOS SE DIVIDEN EN TRES GRUPOS: DEPENDIENTES DE NOD BOXES (REGULADOS POR NODD1), DEPENDIENTES DE TTS BOXES (REGULADOS POR TTSI; ENTRE ELLOS, POSIBLES NUEVOS EFECTORES SECRETADOS MEDIANTE UN SISTEMA DE TIPO TRES) Y AQUELLOS DE LOS QUE SE DESCONOCE COMO SON REGULADOS PERO QUE EN SU MAYORIA DEPENDEN DE NODD1. ALGUNOS DE LOS GENES DETECTADOS PUEDEN EXPLICAR EL EFECTO QUE EN HH103 TIENEN LOS FLAVONOIDES EN PRODUCCION DE EXOPOLISACARIDO Y FORMACION DE BIOPELICULAS (NEGATIVO) Y MOVILIDAD EN SUPERFICIE (POSITIVO). EL OBJETIVO GENERAL DEL PROYECTO ES CARACTERIZAR EL COMPLEJO REGULON GENICO DEPENDIENTE DE FLAVONOIDES EN S. FREDII HH103, INTEGRANDO EL PAPEL DE LOS REGULADORES NODD1, NODD2, TTSI, NOLR Y SYRM, ASI COMO DILUCIDAR EL PAPEL SIMBIOTICO DE LOS NUEVOS GENES CARACTERIZADOS Y AUMENTAR NUESTRO CONOCIMIENTO SOBRE LOS DETERMINANTES MOLECULARES QUE PERMITEN A ESTA BACTERIA ESTABLECER SIMBIOSIS CON NUMEROSAS LEGUMINOSAS, INCLUYENDO DIFERENTES ESPECIES DE LA LEGUMINOSA MODELO LOTUS Y LINEAS SALVAJES (DISPONIBLES) Y COMERCIALES DE SOJA. NUESTRO DESCUBRIMIENTO DE QUE LA INACTIVACION DE NOLR O DE NODD2 CAMBIA EL MODO DE INFECCION DE HH103 EN LOTUS BURTTII (DE CRACK ENTRY AL MAS EVOLUCIONADO TUBO DE INFECCION) Y LA CAPACITA PARA NODULAR EN LOTUS JAPONICUS HACE ESTOS ESTUDIOS ESPECIALMENTE INTERESANTES. SE PROPONE EL SIGUIENTE PLAN DE TRABAJO:I. CARACTERIZAR EL REGULON SIMBIOTICO DE S. FREDII HH103 QUE INTEGRA LA ACTIVIDAD DE LOS GENES NODD1, NODD2, NOLR, SYRM Y TTSI. ESTUDIO DE NUEVOS GENES RIZOBIANOS RELEVANTES EN LA SIMBIOSIS.II. ESTUDIAR LA INTERACCION DE S. FREDII HH103 CON LA LEGUMINOSA MODELO LOTUS Y DISTINTAS LINEAS DE SOJAS SALVAJES.III. INICIAR ESTUDIOS SOBRE APLICACIONES PRACTICAS DE S. FREDII HH103. DESARROLLO DE INOCULANTES PARA SOJA EN COLABORACION CON LA EMPRESA RIZOBACTER. ESTUDIO DE LA APLICACION DE S. FREDII HH103 COMO BACTERIA PROMOTORA DEL CRECIMIENTO VEGETAL JUNTO CON AZOSPIRILLUM EN COLABORACION CON LA EMPRESA ZENAGRO. . FREDII HH103\PGPR\INOCULANTE\LOTUS\SOJA\NODULACIÓN\GENES REGULADORES\T3SS\CAJAS NOD\FLAVONOIDES