Descripción del proyecto
LOS LECTORES DE CROMATINA SON PROTEINAS ESPECIALIZADAS QUE CONTIENEN DOMINIOS CAPACES DE IDENTIFICAR E INTERPRETAR MODIFICACIONES QUIMICAS EN EL DNA (CITOSINAS METILADAS) Y EN LAS HISTONAS (METILACION, ACETILACION, UBIQUITINACION, FOSFORILACION). RECIENTEMENTE, HEMOS DEMOSTRADO QUE UN GEN DE LA COLZA (OSR, BRASSICA NAPUS L.) Y SU HOMOLOGO DE ARABIDOPSIS, CORRELACIONAN CON ALTAS TEMPERATURAS Y CON LOS CAMBIOS FISIOLOGICOS RELACIONADOS PROVOCADOS EN LA PLANTA POR ESTE ESTRES MEDIOAMBIENTAL. EL GEN ES EL HOMOLOGO DE MECP2 DE MAMIFEROS, DENOMINADO MBD4, UN MIEMBRO DE LA FAMILIA DE PROTEINAS MBD, PORTADORAS DEL DOMINIO DE UNION A CPG METILADAS, QUE ES ESENCIAL EN EL SISTEMA NERVIOSO, Y CUYAS MUTACIONES CAUSAN EL SINDROME DE RETT. DISPONEMOS DE EVIDENCIAS CONVINCENTES DE QUE EL GEN MBD4 ES UN REGULADOR TRANSCRIPCIONAL RELACIONADO CON LA TEMPERATURA Y LA RESPUESTA DE TRANSICION DE FASE EN ARABIDOPSIS Y OSR. EN EL CONTEXTO DEL SUBPROYECTO 1 DE EPIGENCROPADAPT, CARACTERIZAREMOS EN PROFUNDIDAD LOS MUTANTES DE MBD4 CRISPR CAS9 DE OSR BAJO CONDICIONES DE ALTAS TEMPERATURAS Y SEQUIA. ESTE OBJETIVO ESPECIFICO TAMBIEN INTENTARA APORTAR LUZ SOBRE LOS MECANISMOS Y EL MODO DE ACCION DE LAS PROTEINAS LECTORES DE MBD EN ESTE CULTIVO PREMIUM DE SEMILLAS OLEAGINOSAS, UTILIZANDO ENFOQUES DE SECUENCIACION MASIVA COMO RNA-SEQ, DAP-SEQ Y CHIP-SEQ. PARA ELLO, HAREMOS USO DE LA TECNOLOGIA CRISPR CAS9 PARA OBTENER MUTANTES EN DIFERENTES FONDOS GENETICOS, INCLUIDAS VARIEDADES ELITE DE OSR, BAJO DEMANDA. ADEMAS, TODAS LAS NUEVAS VARIEDADES SE CARACTERIZARAN MOLECULARMENTE MEDIANTE RNA-SEQ, CHIP-SEQ O TECNICAS ALTERNATIVAS. TAMBIEN DENTRO DE LAS TAREAS CONTEMPLADAS EN ESTE SUBPROYECTO SE CARACTERIZARAN FENOLOGICAMENTE LOS DIFERENTES MUTANTES CRISPR DE MBD4 GENERADOS EN OSR CULTIVDOS EN CONDICIONES NO OPTIMAS (TEMPERATURA AMBIENTE CALIDA Y CONDICIONES DE SEQUIA) UTILIZANDO TECNOLOGIAS DE FENOTIPADO DE ULTIMA GENERACION (CAMARAS INFRARROJAS Y CCT, POROMETRIA DE FLUJO CAPILAR, FOTOSINTESIS, Y CRECIMIENTO EN TIEMPO REAL), APROVECHANDO PARA ELLO LAS INSTALACIONES Y DISPOSITIVOS DISPONIBLES EN EL CBGP. FINALMENTE, AMBOS EQUIPOS INVOLUCRADOS EN EPIGENCROPADAPT COLABORARAN ESTRECHAMENTE PARA REVELAR LAS BASES DEL DESARROLLO, LA REPRODUCCION Y EL BALANCE EN LS RESPUESTAS DE DEFENSA DE LAS PLANTAS QUE DEPENDEN DE LECTORES DE CROMATINA Y DE MARCAS EPIGENETICAS. PARA ELLO ESTUDIAREMOS LA INTERACCION DEL PATOGENO DEL TOMATE PSEUDOMONAS SYRINGAE PV. TOMATE DC3000, MUTANTES DE MBDS DESARROLLADOS EN ESTA ESPECIE DE SOLANACEA, Y ESTRESES ABIOTICOS. EL SUBPROYECTO 1 EN EPIGENCROPADAPT SE CENTRA EN CULTIVOS DE OSR ECONOMICAMENTE IMPORTANTES Y CUMPLE CON LOS REQUISITOS FORMALES PREVIOS DE INTERES SOCIAL Y MEJORA DE LA CALIDAD Y EXCELENCIA EN LA UE, PARA AUMENTAR LA EFICIENCIA DE LA PRODUCCION PRIMARIA Y HACER FRENTE AL CAMBIO CLIMATICO, AL TIEMPO QUE GARANTIZA LA SOSTENIBILIDAD Y LA RESILIENCIA DE LA AGRICULTURA. ESTE TRABAJO TENDRA UN IMPACTO DIRECTO EN LA PRODUCCION DE CULTIVOS Y LA NUTRICION HUMANA. EL PROYECTO TIENE COMO OBJETIVO APOYAR LA IDEA DE DESARROLLAR UNA BIOECONOMIA BASADA EN UNA ECONOMIA CIRCULAR, DONDE EL CONOCIMIENTO BASADO EN PLANTAS, EL MATERIAL VEGETAL Y LOS RECURSOS FITOGENETICOS SE UTILIZAN PARA MEJORAR LA AGRICULTURA, CONTRIBUYENDO ASI A LA REUTILIZACION DE LOS RECURSOS BIOLOGICOS. AMBIO CLIMATICO\ALTA TEMPERATURA AMBIENTE\ADAPTACION\TIEMPO DE FLORACION\COLZA\MBD4\CROMATINA