DISECCIONANDO LA PARTICIPACION DE MBD4 EN LA ADAPTACION AL AUMENTO DE LA TEMPERA...
DISECCIONANDO LA PARTICIPACION DE MBD4 EN LA ADAPTACION AL AUMENTO DE LA TEMPERATURA Y LA INTERACCION CON PATOGENOS EN CULTIVOS DE ESPECIES DE SOLANACEAS
LOS LECTORES EPIGENETICOS DE CROMATINA SON PROTEINAS ESPECIALIZADAS QUE CONTIENEN DOMINIOS CAPACES DE IDENTIFICAR E INTERPRETAR ETIQUETAS QUIMICAS EN EL ADN (POR EJEMPLO, METILACION DE CITOSINA) Y MODIFICACIONES DE HISTONAS (METIL...
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Descripción del proyecto
LOS LECTORES EPIGENETICOS DE CROMATINA SON PROTEINAS ESPECIALIZADAS QUE CONTIENEN DOMINIOS CAPACES DE IDENTIFICAR E INTERPRETAR ETIQUETAS QUIMICAS EN EL ADN (POR EJEMPLO, METILACION DE CITOSINA) Y MODIFICACIONES DE HISTONAS (METILACION, ACETILACION, UBIQUITINACION, FOSFORILACION). RECIENTEMENTE, HEMOS DEMOSTRADO QUE UN GEN DE LA COLZA OLEAGINOSA (BRASSICA NAPUS L.) Y SU CONTRAPARTE DE ARABIDOPSIS SE CORRELACIONAN CON LA DETECCION DE ALTA TEMPERATURA Y LOS CAMBIOS FISIOLOGICOS RELACIONADOS PROVOCADOS EN LA PLANTA POR ESTA CONDICION AMBIENTAL. EL GEN ES EL HOMOLOGO VEGETAL DE MECP2 LLAMADO MBD4, UN MIEMBRO DE LA FAMILIA DEL DOMINIO DE UNION A CPG METILADAS (MBD) DE MAMIFEROS ESENCIAL EN EL SISTEMA NERVIOSO Y CUYAS MUTACIONES CAUSAN EL SINDROME DE RETT. TENEMOS PRUEBAS CONVINCENTES DE QUE EL GEN MBD4 ES UN REGULADOR TRANSCRIPCIONAL FUNDAMENTAL RELACIONADO CON LA TEMPERATURA Y LA RESPUESTA DE TRANSICION DE FASE EN ARABIDOPSIS Y COLZA. EN EL SUBPROYECTO ACTUAL, TENEMOS LA INTENCION DE REDISEÑAR ESTE FACTOR EPIGENETICO PARA MEJORAR LA ADAPTACION DE LOS CULTIVOS AL CAMBIO CLIMATICO Y AMPLIAR NUESTRO CONOCIMIENTO SOBRE LOS LECTORES DE CROMATINA MBD EN DOS CULTIVOS RELACIONADOS Y ECONOMICAMENTE RELEVANTES COMO LA PATATA Y EL TOMATE EN CIRCUNSTANCIAS AMBIENTALES Y BIOLOGICAS SUBOPTIMAS, TALES COMO TEMPERATURAS MAS CALIDAS, SEQUIA E INFECCIONES POR PATOGENOS. PLANEAMOS OBTENER RESULTADOS IMPORTANTES EN EL CONTEXTO DEL CAMBIO CLIMATICO, COMO MARCADORES PARA MEJORAMIENTO Y HERRAMIENTAS BIOTECNOLOGICAS NECESARIAS PARA ADAPTAR Y CREAR CULTIVOS MAS RESISTENTES. EL PROYECTO CARACTERIZARA EL PAPEL DEL LECTOR DE CROMATINA MBD4 EN PATATA Y TOMATE DESDE UN PUNTO DE VISTA MOLECULAR, FISIOLOGICO Y PRACTICO. PARA HACERLO, IMPLEMENTAREMOS TECNICAS Y ENFOQUES DE BIOLOGIA MOLECULAR NOVEDOSOS Y DE VANGUARDIA EN LA INVESTIGACION DE CULTIVOS COMO DAP-SEQ Y CHIP-SEQ TRANSITORIO. USANDO LA TECNOLOGIA CRISPR CAS9, EDITAREMOS GENES CANDIDATOS SIMILARES A MBD EN PATATA Y TOMATE GENERANDO NUEVAS APROXIMACIONES BIOTECNOLOGICAS PARA ENCONTRAR OBJETIVOS POSTERIORES Y REALIZAR UN ANALISIS FUNCIONAL. ASIMISMO, UNA NOVEDAD ESENCIAL DEL PROYECTO ES EL USO EXTENSIVO DE NUEVOS DISPOSITIVOS DE FENOTIPADO Y EL USO COORDINADO DE DATOS MASIVOS OBTENIDOS MEDIANTE MODELADO Y METAANALISIS COMPUTACIONAL PARA CUBRIR Y MAXIMIZAR LOS RESULTADOS OBTENIDOS. TAMBIEN SE INVESTIGARAN LOS ASPECTOS COMPENSATORIOS EN CULTIVOS, RELATIVAMENTE DESCONOCIDOS, ENTRE LA REPRODUCCION, LA FASE DE TRANSICION Y LA DEFENSA CONTRA PATOGENOS EN ENTORNOS CAMBIANTES. DEBEMOS ENFATIZAR EL ESCASO CONOCIMIENTO SOBRE EL PAPEL DE LOS LECTORES DE CROMATINA Y LAS MARCAS Y MODIFICACIONES EPIGENETICAS RELACIONADAS EN TALES ESTRESES COMBINADOS EN LOS CULTIVOS.EL SUBPROYECTO ESTA IMBUIDO EN EL PROYECTO CONJUNTO EPIGENSOLOPADAPT. SE TRATA DE GRUPOS DE DOS INSTITUCIONES DIFERENTES (CNINIA-CSIC Y UPM), CON BUENA COMPLEMENTARIEDAD EN CUANTO A SU EXPERIENCIA Y HABILIDADES; AMBOS SUBPROYECTOS ESTAN BASTANTE COORDINADOS, CON MIEMBROS DEL EQUIPO DE CADA SUBPROYECTO PARTICIPANDO EN ALGUNOS OBJETIVOS COMUNES. EN RESUMEN, NUESTRO PROYECTO TIENE UNA SOLIDA BASE CIENTIFICA Y AYUDARA A LA AGRICULTURA Y A LA COMUNIDAD DE INVESTIGACION DE CULTIVOS Y BIOLOGIA VEGETAL DEL PAIS, MEJORANDO DE VARIAS MANERAS NUESTRO CONOCIMIENTO BASICO Y BRINDANDO OPCIONES PARA ENFRENTAR EL CAMBIO CLIMATICO DESDE LA PERSPECTIVA DE LA AGRICULTURA.
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