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PID2019-110344RB-I00

Financiado

NUEVA APROXIMACION COMPUTACIONAL PARA PREDECIR LETALIDAD SINTETICA EN CANCER

DOS GENES SON LETALES SINTETICOS SI LA INACTIVACION DE CADA UNO DE ELLOS POR SEPARADO NO COMPROMETE EL DESARROLLO CELULAR, PERO LA INACTIVACION DE AMBOS PROVOCA LA MUERTE CELULAR, ESTE CONCEPTO ES PROMETEDOR EN LA INVESTIGACION DE... ver más

01/01/2019

UPNA

91K€

Presupuesto del proyecto: 91K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE NAVARRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 848

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2019-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE NAVARRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 848

Presupuesto del proyecto 91K€

Descripción del proyecto DOS GENES SON LETALES SINTETICOS SI LA INACTIVACION DE CADA UNO DE ELLOS POR SEPARADO NO COMPROMETE EL DESARROLLO CELULAR, PERO LA INACTIVACION DE AMBOS PROVOCA LA MUERTE CELULAR, ESTE CONCEPTO ES PROMETEDOR EN LA INVESTIGACION DEL CANCER, PUESTO QUE ABRE NUEVAS POSIBILIDADES PARA DESARROLLAR ESTRATEGIAS TERAPEUTICAS MAS SELECTIVAS Y EFECTIVAS, LA BUSQUEDA DE LETALES SINTETICOS ES COMPLICADA: UNA BUSQUEDA EXHAUSTIVA DE TODAS LAS POSIBLES PAREJAS DE GENES REQUIERE MAS DE 200 MILLONES DE EXPERIMENTOS DE SILENCIAMIENTO GENICO, ADEMAS, CON CONTADAS EXCEPCIONES, LA LETALIDAD SINTETICA DEPENDE DEL CONTEXTO, ES DECIR, DOS GENES PUEDEN SER LETALES SINTETICOS EN UNA LINEA CELULAR, LETALES ABSOLUTOS EN OTRA Y NO EXPRESARSE EN ABSOLUTO EN UNA TERCERA, ES DECIR, ES NECESARIO CONTEXTUALIZAR EL AMBITO EN EL QUE SE PREDICE LA LETALIDAD SINTETICA Y PARA ELLO EL USO DE HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES ES ABSOLUTAMENTE NECESARIO,SYNLETHAL ES UN PROYECTO DE INVESTIGACION QUE TIENE COMO OBJETIVO DESARROLLAR UNA HERRAMIENTA NOVEDOSA Y ROBUSTA DE MEDICINA DE SISTEMAS PARA PREDECIR Y EXPLOTAR EL CONCEPTO DE LETALIDAD SINTETICA EN CANCER, NUESTRA APROXIMACION INTEGRARA METODOS EMPIRICOS DE PREDICCION, UTILIZANDO DATOS DE SILENCIAMIENTO GENICO A GRAN ESCALA Y DATOS OMICOS HETEROGENEOS, CON METODOS TEORICOS BASADOS EN REDES Y EL CONCEPTO DE GENETIC MINIMAL CUT SETS (GMCSS), EL CONCEPTO DE GMCSS FUE DESARROLLADO PREVIAMENTE PARA REDES METABOLICAS EN EL MARCO DE METARGETS, PROYECTO FINANCIADO EN LA CONVOCATORIA ANTERIOR DE ESTE PROGRAMA INVESTIGACION, SYNLETHAL TIENE EL AMBICIOSO OBJETIVO DE EXTENDER EL CONCEPTO DE GMCSS PARA REDES REGULATORIAS Y DE SEÑALIZACION, LO QUE NOS PERMITIRA COMPRENDER Y CONTEXTUALIZAR LAS PREDICCIONES DE LETALIDAD SINTETICA LLEVADA A CABO POR METODOS EMPIRICOS DE UNA FORMA MAS GLOBAL,NUESTRA APROXIMACION SERA APLICADA PARA IDENTIFICAR NUEVAS DIANAS TERAPEUTICAS Y MARCADORES DE RESPUESTA EN DISTINTOS TUMORES HEMATOLOGICOS: LEUCEMIA MIELOIDE AGUDA, LEUCEMIA LINFOBLASTICA AGUDA Y MIELOMA MULTIPLE, SIGUIENDO EL TRABAJO EXPERIMENTAL INICIADO EN EL MARCO DE METARGETS, SE LLEVARA A CABO UNA VALIDACION EXPERIMENTAL IN-VITRO DE LOS RESULTADOS MAS PROMETEDORES, ADEMAS, LAS HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES DESARROLLADAS EN EL MARCO DE SYNLETHAL SERAN INTEGRADAS EN UNA APLICACION WEB CON EL FIN DE PERMITIR A LA COMUNIDAD CIENTIFICA LLEVAR A CABO ANALISIS A MEDIDA EN OTRO TIPO DE TUMORES, CANCER\LETALIDAD SINTETICA\BIOMARCADORES\MEDICINA PERSONALIZADA\TUMORES HEMATOLOGICOS\MEDICINA DE SISTEMAS\DATOS OMICOS

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