Descripción del proyecto
ESTE PROYECTO COORDINADO SUPONE LA CONTINUACION DE LOS TRES ANTERIORES (BOS-2000-1123-C02, BOS-2003-05198-C02 Y CGL-2006-12714-C02) YA QUE RECOGE EL CONOCIMIENTO GENERADO EN ELLOS Y LO UTILIZA PARA PLANTEAR NUEVAS CUESTIONES RELACIONADAS CON LA BACTERIA HALOFILA EXTREMA SALINIBACTER RUBER, SISTEMA MODELO EN EL QUE HEMOS VENIDO TRABAJANDO ESTOS AÑOS, ESTAS CUESTIONES SE CENTRAN EN ENTENDER COMO SE DIVERSIFICA ESTA ESPECIE EN LA NATURALEZA Y CUAL ES LA MICROBIOTA DE LOS ECOSISTEMAS FRONTERA CON LOS QUE INTERACCIONA, PRETENDEMOS OBTENER ASI INFORMACION QUE SEA RELEVANTE NO SOLO PARA EL CONOCIMIENTO DE ESTA ESPECIE SINO PARA LA COMPRENSION DE LAS FUERZAS QUE MODELAN LA DINAMICA DE LOS GENOMAS BACTERIANOS Y SU INTERACCION CON EL MEDIO AMBIENTE, POR OTRA PARTE, LA CARACTERIZACION DE LOS AMBIENTES FRONTERA PERMITIRA OBTENER INFORMACION DE NUEVOS SISTEMAS PRACTICAMENTE INEXPLORADOS HASTA LA FECHA Y QUE ESTAN RESULTANDO SER FUENTE DE NUEVOS MICROORGANISMOS Y CAPACIDADES METABOLICAS, EL PROYECTO, ADEMAS, CUENTA CON UN ASPECTO DE DESARROLLO DE NUEVAS METODOLOGIAS Y SU APLICACION AL ESTUDIO DE CUESTIONES BASICAS DE ECOLOGIA Y TAXONOMIA MICROBIANAS,EL SUBPROYECTO 1 SE CENTRARA EN EL ESTUDIO DE LAS DIFERENCIAS GENOMICAS ENTRE DISTINTOS MIEMBROS DE LA ESPECIE S, RUBER, LA ESTABILIDAD TEMPORAL Y ESPACIAL DE ESAS DIFERENCIAS Y SU RELACION CON LAS COMUNIDADES DE VIRUS QUE HABITAN LAS SALINAS, ESTE ESTUDIO IMPLICA CONTINUAR CON LA CARACTERIZACION DEL METAGENOMA VIRICO DE LAS SALINAS Y CON EL AISLAMIENTO Y CARACTERIZACION DE VIRUS QUE INFECTEN A S, RUBER, PARA CONTRIBUIR AL CONOCIMIENTO DEL POOL DE DNA QUE ES SUSCEPTIBLE DE SER TRANSFERIDO ENTRE DISTINTOS ORGANISMOS DE LAS SALINAS Y QUE PUEDE CONTRIBUIR A SU DIVERSIFICACION GENOMICA, SE PRETENDE PONER A PUNTO TECNICAS DE CARACTERIZACION DE DNA PLASMIDICO Y DISUELTO PRESENTE EN LOS CRISTALIZADORES,EN EL SUBPROYECTO 2 SE PROPONE POR UN LADO EXPLORAR EL POTENCIAL DE LA NUEVA METODOLOGIA MALDI-TOF EN LA IDENTIFICACION DE ORGANISMOS DE ORIGEN AMBIENTAL, ASI COMO COMPRENDER LA MICRODIVERSIDAD ASOCIADA AL AMBIENTE, EN ESTE ASPECTO, SE PRETENDE DAR CONTINUIDAD ADEMAS A LOS ESTUDIOS YA COMENZADOS DE DIVERSIDAD BASADOS EN METABOLOMICA, POR OTRO LADO, SE PRETENDE ESTUDIAR LAS SEMEJANZAS Y DIFERENCIAS EN LA ESTRUCTURA DE COMUNIDADES Y DIVERSIDAD DE ORGANISMOS CULTIVABLES EN SEDIMENTOS ANAEROBICOS HALOFILOS EXTREMOS TANTO DE ORIGEN TALASOHALINO COMO ATALASOHALINO, UNA DE LAS FINALIDADES ULTIMAS ES PODER CONOCER ALGUNOS ASPECTOS GENOMICOS DE ARQUEAS ANAEROBIAS DE ESTOS SEDIMENTOS, ASI COMO CULTIVAR NUEVOS ORGANISMOS EXTREMOFILOS,LOS OBJETIVOS PLANTEADOS SON LOS SIGUIENTES:1, EXPLORACION DE NUEVAS METODOLOGIAS PIONERAS DE ALTO RENDIMIENTO (HIGH-THROUGHPUT) EN EL ESTUDIO DE LA IDENTIFICACION, BIOGEOGRAFIA Y MICRODIVERSIDAD DE ORGANISMOS DE LAS SALMUERAS,2, EXPLORACION DE LA DIVERSIDAD CULTIVABLE Y NO CULTIVABLE DE LOS SEDIMENTOS ANAEROBICOS EN SATURACION DE SAL,3, ESTUDIO DE LA DIVERSIFICACION DE S, RUBER A NIVEL GENOMICO,4, ESTUDIO DEL PAPEL DE LOS VIRUS EN LA DIVERSIFICACION DE S, RUBER,5, CARACTERIZACION DEL DNA EXTRACROMOSOMICO NO VIRICO (PLASMIDOS Y DNA DISUELTO) EN EL AMBIENTE DE S, RUBER Y EN SUS ECOSISTEMAS FRONTERAS, COMO POSIBLE POOL DE DNA TRANSFERIBLE, SALINIBACTER\HALOFAGO\SEDIMENTO HIPERSALINO\MICROEVOLUCION\MALDI-TOF\METAGENOMA