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PCI2022-135089-2

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MICROBIOME AND GENOMIC ANALYSIS IN APPLE GERMPLASM TOWARDS BROADENING GENETIC RE...
MICROBIOME AND GENOMIC ANALYSIS IN APPLE GERMPLASM TOWARDS BROADENING GENETIC RESOURCES TO BREED FOR RESILIENT VARIETIES LA BAJA AGROBIODIVERSIDAD EN LOS CULTIVOS Y SU CAPACIDAD REDUCIDA PARA RESPONDER A LOS RETOS RELACIONADOS CON EL CAMBIO CLIMATICO SON EFECTOS PERJUDICIALES DE LA ACTUAL AGRICULTURA DE ALTOS INSUMOS. LAS EXPLOTACIONES COMERCIALES D... LA BAJA AGROBIODIVERSIDAD EN LOS CULTIVOS Y SU CAPACIDAD REDUCIDA PARA RESPONDER A LOS RETOS RELACIONADOS CON EL CAMBIO CLIMATICO SON EFECTOS PERJUDICIALES DE LA ACTUAL AGRICULTURA DE ALTOS INSUMOS. LAS EXPLOTACIONES COMERCIALES DE MANZANOS SON UN EXCELENTE EJEMPLO DE PRACTICAS INTENSIVAS DE PESTICIDAS Y RIEGO QUE CONTRARRESTAN LAS AMBICIONES DE LA UE DE REDUCIR LOS INSUMOS Y REVERTIR LA DEGRADACION DE LA AGROBIODIVERSIDAD PARA 2030. EN ESTE CONTEXTO, DEBEN DISEÑARSE NUEVAS PRACTICAS DE MEJORA GENETICA Y MANEJO PARA ROMPER ESTE CIRCULO VICIOSO Y PERMITIR EL DESARROLLO DE AGROECOSISTEMAS DIVERSOS Y RESILIENTES. EL MICROBIOMA ASOCIADO A LAS PLANTAS ES CONOCIDO DESDE HACE TIEMPO POR SUS CONTRIBUCIONES AL RENDIMIENTO DE LOS CULTIVOS, SIN EMBARGO, LAS PRACTICAS AGRICOLAS Y LA MEJORA GENETICA HAN PRESTADO POCA ATENCION A SU UTILIZACION. APPLEBIOME INVESTIGA LA ACCION COMBINADA DE LA GENETICA DEL HUESPED Y DEL MICROBIOMA BAJO PRACTICAS DE MANEJO DE ALTOS Y BAJOS INSUMOS PARA IMPULSAR LA OBTENCION DE VARIEDADES RESILIENTES. APPLEBIOME CUENTA CON UNA COLECCION EXCEPCIONAL DE GERMOPLASMA REPRESENTATIVA DE LA AMPLIA DIVERSIDAD GENETICA DEL MANZANO EN EUROPA: «LA APPLE REFPOP». ESTA COLECCION SE DISEÑO Y ESTABLECIO COMO RESULTADO DEL PROYECTO DE LA UE FRUITBREEDOMICS Y CONSTA DE 534 GENOTIPOS (ACCESIONES Y PROGENIES) PLANTADOS EN 2016, SIGUIENDO EL MISMO DISEÑO EXPERIMENTAL EN SEIS REGIONES DE EUROPA (BELGICA, FRANCIA, ITALIA, POLONIA, ESPAÑA, Y SUIZA); CON UN SUBCONJUNTO DE INDIVIDUOS CULTIVADO CON BAJOS INSUMOS. LA REFPOP, GENOTIPADA CON UN CHIP DE SNP DE ALTA DENSIDAD, SE HA UTILIZADO CON EXITO PARA PREDICCION GENOMICA DE CARACTERES CUANTITATIVOS CONSIDERANDO LA INTERACCION GENOTIPO X AMBIENTE (GXE). APPLEBIOME AGREGA EL COMPONENTE DEL MANEJO EN LA EVALUACION DE LOS MECANISMOS GENETICOS PARA LA RESPUESTA ESTRES. PRIMERO, EN CADA UBICACION, ADQUIRIREMOS DATOS AGRONOMICOS Y DE ENFERMEDADES (JUNTO CON DATOS CLIMATICOS) PARA CADA UNO DE LOS DOS SISTEMAS DE MANEJO: INPUT ALTO VS BAJO DE PESTICIDA O AGUA. ANALISIS DE ASOCIACION (GWAS) Y MODELOS DE PREDICCION GENOMICA (I) IDENTIFICARAN LAS REGIONES GENOMICAS QUE CONTRIBUYEN A LA RESPUESTA A ESTRES Y (II) ESTIMARAN LA CAPACIDAD PREDICTIVA GENOMICA DE LOS CARACTERES BAJO ESTRES AMBIENTAL. EN SEGUNDO LUGAR, ANALIZAREMOS EL MICROBIOMA DE LA FILOSFERA EN LA APPLE REFPOP EN CADA SITIO Y PARA CADA PRACTICA DE MANEJO, ASI COMO EN EXPLOTACIONES COMERCIALES. ANALIZAREMOS LAS SECUENCIAS MICROBIANAS PARA DETERMINAR PARAMETROS DE DIVERSIDAD Y LOS TAXONES CLAVE REGULADOS POR EL HUESPED E INVOLUCRADOS EN LA RESILIENCIA. LUEGO ANALIZAREMOS MODELOS PREDICTIVOS DE GWAS Y APRENDIZAJE PROFUNDO (DL) PARA IDENTIFICAR NUEVOS LOCI Y GENES QUE REGULAN LA RESPUESTA AL ESTRES MEDIADA POR MICROBIOMAS. EVALUAREMOS LOS MARCADORES MOLECULARES Y LOS MODELOS RESULTANTES JUNTO CON LOS MEJORADORES PARA DETERMINAR LA IDONEIDAD DE SU USO EN LOS ESQUEMAS DE MEJORA. FINALMENTE, EL CONOCIMIENTO ADQUIRIDO SE DIFUNDIRA ENTRE LAS PARTES INTERESADAS Y SE CREARAN FOROS DE DISCUSION PARA SOPESAR LAS VENTAJAS, DESVENTAJAS Y RETOS Y GARANTIZAR LA TRANSFERENCIA DE LOS RESULTADOS DEL PROYECTO. A TRAVES DE ESTRECHAS COLABORACIONES CON LA INDUSTRIA DE LA CADENA PRODUCCION DE MANZANAS Y DE ACTIVIDADES DE DIFUSION Y EXPLOTACION, APPLEBIOME PROMOVERA EL DESARROLLO DE NUEVAS VARIEDADES QUE PUEDAN RESPONDER MEJOR A LOS RETOS RELACIONADAS CON EL CAMBIO CLIMATICO Y ALLANARAN EL CAMINO HACIA NUEVOS SISTEMAS DE CULTIVO Y DE MEJORA BASADOS EN LA AGROBIODIVERSIDAD ver más
01/01/2022
INSTITUT DE RECERC...
53K€

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2022-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 53K€
Líder del proyecto
INSTITUT DE RECERCA I TECNOLOGIA AGROALIMENTA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Perfil tecnológico TRL 4-5 520K