CNS2023-144592
Financiado
METATRANSCRIPTOMICA PARA DETERMINAR INTERACCIONES BRACHYSPIRA-HOSPEDADOR EN ESPI...
METATRANSCRIPTOMICA PARA DETERMINAR INTERACCIONES BRACHYSPIRA-HOSPEDADOR EN ESPIROQUETOSIS INTESTINAL HUMANA
LA ESPIROQUETOSIS INTESTINAL HUMANA (EI) ES UNA CONDICION QUE SE CARACTERIZA POR LA COLONIZACION DE LA MUCOSA INTESTINAL POR PARTE DE ESPIROQUETAS DEL GENERO BRACHYSPIRA. LOS SINTOMAS DE LA ESPIROQUETOSIS INTESTINAL SON VARIADOS,...
LA ESPIROQUETOSIS INTESTINAL HUMANA (EI) ES UNA CONDICION QUE SE CARACTERIZA POR LA COLONIZACION DE LA MUCOSA INTESTINAL POR PARTE DE ESPIROQUETAS DEL GENERO BRACHYSPIRA. LOS SINTOMAS DE LA ESPIROQUETOSIS INTESTINAL SON VARIADOS, EN ALGUNOS CASOS SIENDO LA COLONIZACION COMPLETAMENTE ASINTOMATICA MIENTRAS QUE EN OTROS SE ASOCIA A SINTOMAS COMO DOLOR ABDOMINAL O DIARREA RECURRENTE.EN LOS ULTIMOS AÑOS SE HA DESCRITO LA ASOCIACION DE LA ESPIROQUETOSIS INTESTINAL HUMANA CON OTRAS PATOLOGIAS GASTROINTESTINALES, COMO EL SINDROME DEL INTESTINO IRRITABLE (SII), ESPECIALMENTE CON EL SUBTIPO ASOCIADO A DIARREA (SII-D), CON HASTA EL 40% DE PACIENTES DE SII-D PRESENTANDO EVIDENCIAS DE INFECCION POR BRACHYSPIRA. ADEMAS, OTROS ESTUDIOS SUGIEREN ASOCIACION CON EL DESARROLLO DE POLIPOS SESILES SERRADOS. SIN EMBARGO, OTROS ESTUDIOS CONTRADICEN ESTA ULTIMA ASOCIACION. LA DETECCION DE BRACHYSPIRA EN MUESTRAS HUMANAS NO ES TRIVIAL. METODOS MOLECULARES COMO LA SECUENCIACION DE AMPLICONES 16S DE MUESTRAS FECALES NO SON EFICIENTES PARA BRACHYSPIRA, Y SE NECESITAN CEBADORES ESPECIFICOS PARA PODER DETECTAR ESTA BACTERIA MEDIANTE PCR. ESTE HECHO, SUMADO A LA VARIABILIDAD DE SINTOMAS Y EL HECHO DE QUE MUCHAS VECES LA COLONIZACION RESULTE ASINTOMATICA, HACE QUE LA ESTIMACION DE PREVALENCIA DE LA EI SEA PROBABLEMENTE MENOR QUE LA REAL. POR ULTIMO, SE CONOCE POCO ACERCA DE LOS ASPECTOS A NIVEL MOLECULAR DE LA COLONIZACION POR BRACHYSPIRA. LA MAYORIA DE ESTUDIOS MOLECULARES SE HAN LLEVADO A CABO EN ANIMALES, SOBRE TODO EN CERDOS, DONDE LA INFECCION POR BRACHYSPIRA CAUSA DISENTERIA PORCINA. DE ESTA FORMA, LA INTERACCION ENTRE BRACHYSPIRA, LA MUCOSA INTESTINAL HUMANA Y EL SISTEMA INMUNE ES EN GRAN PARTE DESCONOCIDA. POR ELLO, EN ESTE PROYECTO VAMOS REALIZAR UN ESTUDIO CLINICO PROSPECTIVO, OBSERVACIONAL Y MONOCENTRICO EN COLABORACION CON GASTROENTEROLOGOS DEL HOSPITAL ARNAU DE VILANOVA, EN EL QUE RECOGEREMOS BIOPSIAS INTESTINALES DE PACIENTES DIAGNOSTICADOS DE SII-D, DONDE LA PREVALENCIA ESPERADA DE ESTA BACTERIA SE ESTIMA EN UN 40%. LAS MUESTRAS SE RECOGERAN DURANTE COLONOSCOPIAS PLANIFICADAS EN ESTOS PACIENTES. NUESTRO OBJETIVO ES ALCANZAR LA RECOGIDA DE MUESTRAS DE HASTA 150 PACIENTES, PARA OBTENER ENTRE 30 Y 70 MUESTRAS POSITIVAS PARA BRACHYSPIRA DE ACUERDO CON LA PREVALENCIA ESPERADA DEL 40%. ADEMAS, SE RECOGERAN DATOS RELATIVOS A LA HISTORIA CLINICA DE LOS PACIENTES, RELACIONADOS CON SU SINTOMATOLOGIA GASTROINTESTINAL. LAS BIOPSIAS RECOGIDAS SERAN TRASLADADAS A NUESTRO LABORATORIO DONDE PROCEDEREMOS A EXTRAER ARN Y ADN DE LAS MISMAS. LAS MUESTRAS DE ADN SERAN UTILIZADAS PARA DETERMINAR, MEDIANTE PCR CUANTITATIVA, LA PRESENCIA DE BRACHYSPIRA. UNA VEZ DETERMINADA LA PRESENCIA DE BRACHYSPIRA, SE SELECCIONARA UN MAXIMO DE 30 MUESTRAS POSITIVAS Y 30 NEGATIVAS, DE LAS CUALES SE SECUENCIARA EL ARN, PARA OBTENER LOS PATRONES DE EXPRESION DE MICROBIOTA (INCLUYENDO BRACHYSPIRA) Y HOSPEDADOR. EL ANALISIS DE ESTAS MUESTRAS DETERMINARA LOS GENES EXPRESADOS POR BRACHYSPIRA Y PERMITIRA ASOCIARLOS TANTO A LA GRAVEDAD DE LOS SINTOMAS COMO A LA RESPUESTA ESPECIFICA DEL HOSPEDADOR. PARA COMPLETAR EL ANALISIS, SE COMPLEMENTARA CON UN META-ANALISIS DE DATOS PUBLICOS DE METATRANSCRIPTOMICA EN LOS QUE SE HAYA DETECTADO LA PRESENCIA DE BRACHYSPIRA. METATRANSCRIPTOMICA\INTERACCIONES MICROBIO-HOSPEDADOR\SINDROME DE COLON IRRITABLE\BRACHYSPIRA\ESPIROQUETOSIS INTESTINAL HUMANA
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Línea de financiación: concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2023-01-01
Presupuesto
El presupuesto total del proyecto asciende a
200K€
Líder del proyecto
Fundación de la Comunidad Valenciana Centro d...
Desarrollar una investigacion de vanguardia en el campo de la biologia y servir de apoyo logistica y tecnico a la medicina asistencias en ho...
Perfil tecnológico
TRL
4-5
7M
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