Descripción del proyecto
LAS ENFERMEDADES HUMANAS MAS COMUNES MUESTRAN UNA ETIOLOGIA COMPLEJA QUE IMPLICA INTERACCIONES ENTRE FACTORES GENETICOS Y AMBIENTALES, LOS ESTUDIOS DE ASOCIACION DEL GENOMA COMPLETO (GWAS) HAN DEMOSTRADO QUE MUCHAS VARIANTES GENETICAS ASOCIADAS A ENFEMEDADES COMPLEJAS OCURREN DENTRO DE POTENCIADORES TRANSCRIPCIONALES, SIN EMBARGO, LAS CONSECUENCIAS PATOLOGICAS DE LA MAYORIA DE ESTAS VARIANTES GENETICAS SON POCO CONOCIDAS, AQUI POSTULO QUE LA REDUNDANCIA DE POTENCIADORES TRANSCRIPCIONALES ES UNA PROPIEDAD GENERAL DE LAS REDES GENETICAS DE REGULACION QUE CONFIERE ROBUSTEZ TRANSCRIPCIONAL BAJO SITUACIONES DE ESTRES AMBIENTAL, ADEMAS PROPONGO QUE, DEBIDO A ESTA REDUNDANCIA, LOS EFECTOS PATOLOGICOS DE LAS VARIANTES GENETICAS LOCALIZADAS DENTRO DE POTENCIADORES TRANSCRIPCIONALES PUEDE QUE SE MANIFIESTEN PRINCIPALMENTE EN CONDICIONES DE PERTURBACION AMBIENTAL, PARA INVESTIGAR ESTAS HIPOTESIS, SE COMBINARAN MODELOS DE DIFERENCIACION (P,EJ, CRESTA NEURAL) DE CELULAS MADRE PLURIPOTENTES INDUCIDAS HUMANAS (HIPSC) Y DIVERSOS INSULTOS AMBIENTALES CON ESTRATEGIAS GENOMICAS Y DE INGENIERIA GENETICA, BREVEMENTE, UTILIZANDO LINEAS DE HIPSC DERIVADAS DE DONANTES SANOS, SE REALIZARAN ANALISIS ALELO-ESPECIFICOS DE DATOS GENOMICOS FUNCIONALES (ATAC-SEQ, RNA-SEQ), LO CUAL PERMITIRA USAR LA VARIACION GENETICA QUE DE FORMA NATURAL OCURRE EN HUMANOS COMO UN CRIBADO MUTAGENICO PARA IDENTIFICAR POTENCIADORES CUYA RELEVANCIA FUNCIONAL SE MANIFIESTA BAJO ESTRES AMBIENTAL, A CONTINUACION, LOS POTENCIADORES IDENTIFICADAS SERAN MODIFICADOS GENETICAMENTE PARA COMPROBAR SI SU DELECION COMPLETA O LA PRESENCIA DE VARIANTES GENETICAS DENTRO DE LAS MISMAS PUEDE CONDUCIR A UNA PERDIDA DE ROBUSTEZ EN LA EXPRESION GENICA EN CONDICIONES DE ESTRES AMBIENTAL,ESTE PROYECTO PUEDE PROPORCIONAR UNA ESTRATEGIA GENERAL PARA INVESTIGAR LAS CONSECUENCIAS FUNCIONALES DE LA VARIACION GENETICA NO CODIFICANTE Y, LO QUE ES MAS IMPORTANTE, PUEDE REVELAR UN NUEVO PARADIGMA ETIOLOGICO PARA LAS ENFERMEDADES HUMANAS, POTENCIADORES\ENFERMEDADES COMPLEJAS\REDUNDANCIA\ESTRÉS AMBIENTAL\HIPSC\GWAS\CRESTA NEURAL\MUSCULO LISO CEREBRAL