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PID2020-114060RR-C33

Financiado

INVESTIGANDO LOS MECANISMOS MOLECULARES DE LA EVOLUCION DE LA INFECCION CON VIRU...

INVESTIGANDO LOS MECANISMOS MOLECULARES DE LA EVOLUCION DE LA INFECCION CON VIRUS DE INFLUENZA AVIAR EN LAS AVES MEDIANTE UNA APROXIMACION MULTI-OMICA LAS INTERACCIONES HUESPED-PATOGENO SE HAN IDO CONFIGURANDO A LO LARGO DE MILLONES DE AÑOS DE EVOLUCION: LOS HUESPEDES DESARROLLAN MECANISMOS DE DEFENSA EFICACES CONTRA LOS PATOGENOS Y ESTOS SUPERAN ESTAS LINEAS DE DEFENSA, EN LOS... ver más

01/01/2020

INSTITUT DE RECERC...

166K€

Presupuesto del proyecto: 166K€

Líder del proyecto

INSTITUT DE RECERCA I TECNOLOGIA AGROALIMENTA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 520K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2020-01-01

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Participantes

INSTITUT DE RECERCA I TECNOL...

Lider

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Líder del proyecto

INSTITUT DE RECERCA I TECNOLOGIA AGROALIMENTA...

TRL 4-5 | 520K€

Presupuesto del proyecto 166K€

Descripción del proyecto LAS INTERACCIONES HUESPED-PATOGENO SE HAN IDO CONFIGURANDO A LO LARGO DE MILLONES DE AÑOS DE EVOLUCION: LOS HUESPEDES DESARROLLAN MECANISMOS DE DEFENSA EFICACES CONTRA LOS PATOGENOS Y ESTOS SUPERAN ESTAS LINEAS DE DEFENSA, EN LOS ULTIMOS AÑOS, SE HAN IMPLEMENTADO ESTRATEGIAS PARA INTEGRAR DATOS OMICOS PARA COMPRENDER LAS ENFERMEDADES INFECCIOSAS A NIVEL DE SISTEMAS Y AYUDARAN A DESARROLLAR MEJORES HERRAMIENTAS DE PREVENCION Y TRATAMIENTO PARA LUCHAR CONTRA LAS ENFERMEDADES INFECCIOSAS, LA INFLUENZA AVIAR ALTAMENTE PATOGENA ES UNA ENFERMEDAD INFECCIOSA CAUSADA POR EL VIRUS HPAIV QUE PUEDE SER LETAL PARA LAS ESPECIES DE AVES, AUNQUE SI OCURREN VARIACIONES ENTRE ESPECIES Y ENTRE INDIVIDUOS, EN UN PROYECTO ANTERIOR (RTA2015-00088-C03,03), SE OBTUVIERON RESULTADOS PRELIMINARES SOBRE LA EXPRESION GENICA DIFERENCIAL EN AVES RESISTENTES FRENTE A AVES SUSCEPTIBLES A HPAIV, EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES DEFINIR VIAS BIOLOGICAS CLAVE PARA PREDECIR LA MORTALIDAD TRAS LA INFECCION POR HPAIV EN EL HUESPED AVIAR MEDIANTE EL USO DE DIFERENTES HERRAMIENTAS ECONOMICAS, COMO LA TRANSCRIPTOMICA Y LA PROTEOMICA, QUE PUEDEN AYUDAR A OBTENER UNA COMPRENSION A NIVEL DE SISTEMAS DE UN PROCESO INFECCIOSO, PARA ELLO, SE REALIZARA UNA INFECCION EXPERIMENTAL CON UNA CEPA HPAIV H7N1 EN POLLOS CON EL FIN DE ESTUDIAR LA RESPUESTA TEMPRANA A LA INFECCION VIRAL, LOS POLLOS SERAN MONITOREADOS Y A LAS 12, 14, 48 Y 72 HORAS DESPUES DE LA INFECCION, SE SACRIFICARAN 20 AVES INFECTADAS Y SE RECOLECTARA UN CONJUNTO COMPLETO DE MUESTRAS QUE INCLUYEN SANGRE, HISOPOS TRAQUEALES Y CLOACALES Y ORGANOS INTERNOS, SEGUN DIFERENTES PARAMETROS COMO SIGNOS CLINICOS, HALLAZGOS MACRO Y MICROSCOPICOS ETC, LAS AVES INOCULADAS SE CLASIFICARAN COMO "SUSCEPTIBLES" O "RESISTENTES" A LA INFECCION POR HPAIV, SE ANALIZARAN LAS FIRMAS DEL TRANSCRIPTOMA DE SUERO SANGUINEO, PULMONES Y MUCOSA NASAL, SE IDENTIFICARAN CONJUNTOS DE GENES QUE MUESTRAN UNA EXPRESION DIFERENCIAL MAS ALTA ENTRE ANIMALES RESISTENTES Y SUSCEPTIBLES Y GRUPOS DE GENES DE CADA GRUPO EXPERIMENTAL CON PATRONES DE EXPRESION SIMILARES ENTRE TODOS LOS TEJIDOS Y PUNTOS DE TIEMPO MEDIANTE ANALISIS DE RED DE COEXPRESION DE GENES PONDERADOS (WGCNA), LA EXPRESION DIFERENCIAL DE LAS TRANSCRIPCIONES SELECCIONADAS SERA VALIDADA POR QPCR, ADEMAS, TAMBIEN SE REALIZARA UN ANALISIS PROTEOMICO EN SANGRE DE TODOS LOS ANIMALES PARA COMPARAR EL PROTEOMA RESISTENTE CON EL SUSCEPTIBLE, PARA LA PROTEOMICA, UNA CROMATOGRAFIA LIQUIDA DE FASE INVERSA-ESPECTROMETRIA DE MASAS EN TANDEM (RP-LC-MS / MS) PARA LA IDENTIFICACION, CUANTIFICACION Y ANALISIS COMPARATIVO DE PROTEINAS MEDIANTE LA ADQUISICION DEPENDIENTE DE LA INFORMACION (IDA) SEGUIDA DE SWATH (ADQUISICION INDEPENDIENTE DE DATOS EN VENTANAS SECUENCIALES DEL TOTAL ALTO -RESOLUCION DE ESPECTROS DE MASAS), FINALMENTE, LOS DATOS DEL ANALISIS TRANSCRIPTOMICO Y PROTEOMICO SE CORRELACIONARAN UTILIZANDO METODOS ESTADISTICOS CONVENCIONALES PARA OBTENER VIAS BIOLOGICAS PUTATIVAS O BIOMARCADORES DE RESISTENCIA/SUSCEPTIBILIDAD, SE REALIZARA UN SEGUNDO EXPERIMENTO PARA VALIDAR LOS RESULTADOS OBTENIDOS, SE UTILIZARAN DOS RAZAS DE POLLOS QUE SE INFECTARAN CON UNA CEPA HPAIV H7N1 Y SE CONTROLARAN CLINICAMENTE HASTA 15 DIAS DESPUES DE LA INFECCION, SE TOMARAN HISOPOS DE SANGRE, TRAQUEALES Y CLOACALES VARIOS DIAS DESPUES DE LA INFECCION, LOS GENES Y PROTEINAS QUE POR LOS RESULTADOS ANTERIORES SE CONSIDERABAN RELEVANTES PARA PREDECIR EL RESULTADO CLINICO SE VALIDARAN EN MUESTRAS DE AVES RESISTENTES/SUSCEPTIBLES, INFLUENZA AVIAR\TRANSCRIPTOMICA\PROTEOMICA\BIOMARCADOR\RESISTENCIA\EVOLUCION

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