INICIACION INTERNA DE LA TRADUCCION EN EUCARIOTAS: MECANISMOS Y APLICACIONES
LOS SITIOS DE ENTRADA INTERNA DEL RIBOSOMA (IRES) SON REGIONES DEL RNA QUE ADOPTAN ESTRUCTURAS COMPLEJAS Y QUE ACTUAN EN CIS RECLUTANDO LA MAQUINARIA DE TRADUCCION EN LAS CERCANIAS DE UN TRIPLETE DE INICIACION INTERNO, GENERALMENT...
LOS SITIOS DE ENTRADA INTERNA DEL RIBOSOMA (IRES) SON REGIONES DEL RNA QUE ADOPTAN ESTRUCTURAS COMPLEJAS Y QUE ACTUAN EN CIS RECLUTANDO LA MAQUINARIA DE TRADUCCION EN LAS CERCANIAS DE UN TRIPLETE DE INICIACION INTERNO, GENERALMENTE CON LA PARTICIPACION DE PROTEINAS DE UNION A RNA, LA INICIACION INTERNA DE LA TRADUCCION ES UN MECANISMO ALTERNATIVO DE INICIAR LA SINTESIS DE PROTEINAS DESCUBIERTO EN PICORNAVIRUS, PERO QUE TAMBIEN OCURRE EN RNAS DE OTROS VIRUS COMO HEPATITIS C, Y EN ALGUNOS MRNA CELULARES QUE CODIFICAN FACTORES DE SUPERVIVENCIA, LA COMPARACION DE ELEMENTOS IRES ALEJADOS GENETICAMENTE MUESTRA GRANDES DIFERENCIAS EN LA EFICIENCIA DE TRADUCCION, ASI COMO EN LOS FACTORES NECESARIOS PARA SU ACTIVIDAD, ESTAS DIFERENCIAS PUEDEN JUSTIFICARSE POR SU DIFERENTE COMPOSICION DE NUCLEOTIDOS, SU ORGANIZACION ESTRUCTURAL, LA INTERACCION CON FACTORES ESPECIFICOS INVOLUCRADOS EN EL RECONOCIMIENTO DE LA SUBUNIDAD 40S, ASI COMO SU CAPACIDAD PARA COMPETIR CON LA INICIACION DEPENDIENTE DE CAP, EL PRINCIPAL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO CONSISTE EN DESCIFRAR LOS PRINCIPIOS MOLECULARES DEL MECANISMO DE ACCION DE IRES DE VIRUS RNA QUE PROMUEVEN LA INICIACION INTERNA DE LA TRADUCCION, ENTENDER DICHO MECANISMO ES FUNDAMENTAL PARA ESTABLECER LAS REGLAS BASICAS DE LA ARQUITECTURA DE ELEMENTOS IRES MODELO QUE SERVIRAN PARA PODER PREDECIR DE MANERA FIABLE LA PRESENCIA DE IRES EN UN MRNA, ALGO QUE ACTUALMENTE ESTA FUERA DE NUESTRO ALCANCE, PARA LOGRAR ESTE OBJETIVO PROPONEMOS LLEVAR A CABO UN ANALISIS ESTRUCTURAL Y FUNCIONAL DE ELEMENTOS IRES DE VIRUS RNA QUE AYUDEN A GENERAR MODELOS TERCIARIOS DE MOTIVOS CONSERVADOS EN NUEVOS ELEMENTOS REGULADORES DE LA TRADUCCION, IDENTIFICAR FACTORES CELULARES AUXILIARES IMPLICADOS EN LA ACTIVIDAD IRES, Y FINALMENTE, APLICAR DICHO CONOCIMIENTO AL DESARROLLO DE NUEVOS VECTORES DE EXPRESION POLICISTRONICOS, EL DESARROLLO DE ESTOS OBJETIVOS CONCRETOS SE LLEVARA A CABO A TRAVES DE UN ABORDAJE MULTIDICISPLINAR QUE COMBINARA ANALISIS DE ACCESSIBILIDAD AL RNA CON DETERMINACION DE EFICIENCIA DE TRADUCCION, MUTAGENESIS DIRIGIDA, ANALISIS BIOINFORMATICO Y DE RESONANCIA MAGNETICA NUCLEAR, RIBOPROTEOMICA, Y SILENCIAMIENTO GENICO, A LARGO PLAZO, LA COMPARACION DE FACTORES NECESARIOS PARA LA INICIACION INTERNA JUNTO CON EL DESCIFRAMIENTO DEL PAPEL DESEMPEÑADO POR DIVERSOS MOTIVOS ESTRUCTURALES PERMITIRA ENTENDER DE QUE SE COMPONE UN IRES Y POR LO TANTO, PREDECIR DE FORMA CERTERA LA PRESENCIA DE ELEMENTOS IRES EN MRNAS EUCARIOTICOS, IRES /picornavirus/ virus RNA/ traduccióver más
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