Descripción del proyecto
LAS TECNICAS DE GENOTIPADO MASIVO DE SNPS HAN PROPORCIONADO UNA HERRAMIENTA MUY UTIL PARA LA MEJORA GENETICA ANIMAL, SIN EMBARGO, SU APLICACABILIDAD NO ES CLARA EN POBLACIONES CON IMPLANTACION ESCASA DE LA INSEMINACION ARTICIAL Y ESCASEZ DE INDIVIDUOS ESTIMADOS CON ALTA PRECISION, COMO LAS POBLACIONES ESPAÑOLAS DE VACUNO DE CARNE, Y POR LO TANTO DEBE SER EVALUADO ESPECIFICAMENTE,EN PRIMER LUGAR, EL PROYECTO ACTUALIZARA LOS PARAMETROS DEMOGRAFICOS Y POBLACIONALES DE LAS SIETE POBLACIONES DE VACUNO DE CARNE AUTOCTONO MAS RELEVANTES EN ESPAÑA (ASTURIANA DE LOS VALLES, AVILEÑA NEGRA IBERICA, BRUNA DELS PIRINEUS, MORUCHA, RETINTA, RUBIA GALLEGA, PIRENAICA), POSTERIORMENTE, SE GENOTIPARAN 25 TRIADAS DE MACHO, HEMBRA E INDIVIDUO POR POBLACION CON UN CHIP DE 600K, CON ESTA INFORMACION SE ESTUDIARA EL DESEQUILIBRIO DE LIGAMIENTO Y SE INFERIRAN LAS ZONAS DEL GENOMA INVOLUCRADAS EN PROCESOS DE SELECCION, ASI COMO EL GRADO DE DIFERENCIACION ENTRE POBLACIONES MEDIANTE DISTANCIAS GENETICAS Y TECNICAS DE COALESCENCIA, A CONTINUACION, Y CONDICIONADO A LA INFORMACION PROPORCIONADA POR LOS SNP, SE REALIZARA UNA SIMULACION SOBRE LA GENEALOGIA DISPONIBLE EN CADA POBLACION, PARA ELLO, SE GENERARA UNA POBLACION BASE MEDIANTE UN MODELO DE SELECCION-MUTACION-DERIVA Y SE EXPANDIRA MEDIANTE GOTEO DE GENES A TRAVES DE LA GENEALOGIA DISPONIBLE, CON ESTA SIMULACION SE COMPARARA LA CAPACIDAD PREDICTIVA DE LOS VALORES MEJORANTES EN FUNCION DE A) NUMERO DE GENES CAUSALES, B) DENSIDAD DE LOS MARCADORES, C) NUMERO DE INDIVIDUOS GENOTIPADOS, D) PROCEDIMIENTO DE SELECCION DE LOS INDIVIDUOS GENOTIPADOS, E) HEREDABILIDAD DE LOS CARACTERES Y F) NUMERO DE INDIVIDUOS CON FENOTIPO,FINALMENTE, DADO QUE LAS POBLACIONES DE VACUNO DE CARNE AUTOCTONO ESPAÑOL SON PEQUEÑAS Y CERCANAS EVOLUTIVAMENTE, SE ESTUDIARA LA POSIBILIDAD DE LA IMPLANTACION DE UNA EVALUACION CONJUNTA O DEL USO DE UNA METAPOBLACION QUE INTEGRE INDIVIDUOS DE TODAS LAS POBLACIONES, EVALUANDO SU CAPACIDAD PREDICTIVA EN LOS VALORES MEJORANTES DE LAS POBLACIONES ORIGINALES,