Descripción del proyecto
LA IMPRONTA GENOMICA ES UN PROCESO EPIGENETICAMENTE REGULADO, QUE PRODUCE UNA EXPRESION ESPECIFICA DEPENDIENTE DEL ORIGEN PARENTAL DE CADA ALELO EN PEQUEÑO NUMERO DE GENES, LA EXPRESION ALELICA DE LOS TRANSCRITOS IMPRONTADOS SE ENCUENTRA REGULADA POR LA INTERACCION DE REGIONES DIFERENCIALMENTE METILADAS (DMRS), MODIFICACIONES DE HISTONAS ESPECIFICAS DE ALELO, RNAS GRANDES NO CODIFICANTES (NCRNAS) E INTERACCION DE ORDEN SUPERIOR DE LA CROMATINA, MUCHOS AVANCES EN NUESTRO CONOCIMIENTO SOBRE LAS INTERACCIONES ENTRE LOS ESTADOS DE LA CROMATINA, LA FUNCION DEL GENOMA Y LAS ENFERMEDADES HUMANAS SE ORIGINAN A PARTIR DE ESTUDIOS DE LA IMPRONTA GENOMICA, DESTACANDO LOS BENEFICIOS DE LA COMPRENSION DE ESTE FENOMENO NO MENDELIANO, EN ESTA SOLICITUD, SE PROPONE LA UTILIZACION DE LAS ULTIMAS TECNOLOGIAS DE METHYL-SEQ PARA DETERMINAR EL METILOMA DE TROPECTODERMO Y LA MASA CELULAR INTERNA DE EMBRIONES HUMANOS TEMPRANOS, ESTA FASE DEL DESARROLLO SE PRODUCE INMEDIATAMENTE DESPUES DE LA REPROGRAMACION DE TODO EL GENOMA EN EL CIGOTO Y LA ACTIVACION DE LA TRANSCRIPCION EMBRIONARIA, PERIODO EN EL CUAL LA METILACION ASOCIADA A LA IMPRONTA GENOMICA SE ENCUENTRA PROTEGIDA Y MANTENIDA, RECIENTEMENTE HEMOS IDENTIFICADO UNA NUEVA CLASE DE GENES IMPRONTADOS ESPECIFICOS DE PLACENTA Y NUESTRA HIPOTESIS ES QUE MEDIANTE LA DETERMINACION DE LOS PERFILES DE METILACION EN EMBRIONES HUMANOS TEMPRANOS Y COMPARANDOLA CON NUESTRO CONJUNTO DE DATOS METHYL-SEQ EXISTENTES PARA PLACENTA, SEREMOS CAPACES DE IDENTIFICAR MUCHOS MAS GENES SUJETOS A ESTA FORMA DE REGULACION EPIGENETICA, PARA DETERMINAR SI LOS MECANISMOS EXISTENTES QUE GARANTIZAN EL MANTENIMIENTO DE LA METILACION ASOCIADA A IMPRONTA GENOMICA TAMBIEN ACTUAN EN EL MECANISMO DE IMPRONTA GENOMICA ESPECIFICA DE PLACENTA, REALIZAREMOS UN CHIP-SEQ PARA IDENTIFICAR LOS POTENCIALES SITIOS DE UNION PARA ZFP57, UN FACTOR ESENCIAL EN EL MECANISMO DE IMPRONTA GENOMICA PARA EL QUE HEMOS IDENTIFICADO UN PROMOTOR Y UN TRANSCRITO ESPECIFICOS DE PLACENTA, EN CELULAS HES Y LA LINIA CELULAR DE PLACENTA TCL1, PARA DETERMINAR SI LA UNION DE ZFP57 ES SUFICIENTE PARA PROTEGER LA METILACION DERIVADA DE OVOCITO DE LA REPROGRAMACION ZIGOTICA, CREAREMOS FUSIONES TALE-ZFP57 DIRIGIDAS A REGIONES DE METILACION GERMINAL QUE SE ENCUENTRAN NORMALMENTE SUJETAS A DESMETILACION EN EL EMBRION MURINO EN DESARROLLO, DESDE QUE SE HA DEMOSTRADO QUE LOS GENES IMPRONTADOS EN PLACENTA REGULAN EL CRECIMIENTO FETAL, HEMOS DESARROLLADO LA HIPOTESIS DE QUE ALGUNOS DE LOS TRANSCRITOS IDENTIFICADOS POR PRIMERA VEZ EN ESTE ESTUDIO PODRIAN SER IMPORTANTES PARA EL CRECIMIENTO FETAL, POR LO TANTO, PROPONEMOS LA CUANTIFICACION TANTO DE LA METILACION DEL DNA COMO DE LOS NIVELES DE EXPRESION DE TODOS LOS GENES IMPRONTADOS ESPECIFICOS DE PLACENTA EN NUESTRA GRAN COHORTE DE BIOPSIAS PLACENTARIAS DE EMBARAZOS COMPLICADOS (RESTRICCION DEL CRECIMIENTO INTRAUTERINO, PREECLAMPSIA Y PREMATURIDAD SEVERA), ADEMAS, DEBIDO A QUE HA SIDO DESCRITO QUE LA PLACENTA ES VULNERABLE A ABERRACIONES EPIGENETICAS DURANTE LA UTILIZACION DE TECNICAS DE REPRODUCCION ASISTIDA (ART) DETERMINAREMOS SI LA IMPRONTA GENOMICA ESPECIFICA DE PLACENTA ES PROPENSA A LA VARIABILIDAD EPIGENETICA DURANTE LOS CICLOS DE ART, POR ULTIMO, LAS CONSECUENCIAS MOLECULARES DE LA ALTERACION EN LA EXPRESION IMPRONTADA DE CUALQUIER GEN ALTERADO, SE ABORDARA UTILIZANDO DELECIONES MEDIADAS POR CRSIPR EN LINEAS CELULARES DE PLACENTA, CONCENTRANDOLOS INICIALMENTE EN LIN28B, UN PROCESADOR DE MIRORNA PATERNALMENTE EXPRESADO, EPIGENETICA\METILACION DEL DNA\IMPRONTA GENOMICA\ZFP57\CRECIMIENTO FETAL\EDICION DEL GENOMA