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PID2019-105216GB-I00

Financiado

IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION FUNCIONAL DE LAS MINIPROTEINAS DE STAPHYLOCOCCU...

LA POPULARIZACION DE LA SECUENCIACION MASIVA DE ADN HA CONTRIBUIDO A LA RESOLUCION DE UN INMENSO NUMERO DE GENOMAS TANTO EN EUCARIOTAS COMO EN PROCARIOTAS, PARA QUE ESTA INFORMACION RESULTE UTIL, LOS GENOMAS DEBEN ESTAR ANOTADOS C... ver más

01/01/2019

CSIC

169K€

Presupuesto del proyecto: 169K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2019-01-01

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Participantes

CSIC

Lider

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA...

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 169K€

Descripción del proyecto LA POPULARIZACION DE LA SECUENCIACION MASIVA DE ADN HA CONTRIBUIDO A LA RESOLUCION DE UN INMENSO NUMERO DE GENOMAS TANTO EN EUCARIOTAS COMO EN PROCARIOTAS, PARA QUE ESTA INFORMACION RESULTE UTIL, LOS GENOMAS DEBEN ESTAR ANOTADOS CON PRECISION, SIN EMBARGO, MILES DE PEQUEÑOS ORFS (SMORFS) QUE CODIFICAN PEQUEÑAS PROTEINAS CONOCIDAS COMO MINI-PROTEINAS (SMPS) NO ESTAN ANOTADOS EN LOS GENOMAS DEBIDO A QUE DE LOS ALGORITMOS BIOINFORMATICOS UTILIZAN A MENUDO LIMITES MUY ESTRICTOS PARA ESTABLECER EL TAMAÑO MINIMO DE UN POSIBLE MARCO DE LECTURA ABIERTO (ORF) Y, ADEMAS, EXCLUYEN LA POSIBILIDAD DE QUE EXISTAN ORFS SOLAPANTES, ESTE HECHO HA IMPEDIDO QUE LAS SMPS SEAN TENIDAS EN CUENTA EN LOS ESTUDIOS BIOLOGICOS LLEVADOS A CABO HASTA EL MOMENTO, LO QUE SUPONE UNA GRAN LIMITACION EN LA COMPRESION DE LOS MECANISMOS MOLECULARES FUNDAMENTALES, EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS REALIZAR LA IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION FUNCIONAL DE LAS SMPS DE STAPHYLOCOCCUS AURUES, UNO DE LOS PATOGENOS MAS RELEVANTES A NIVEL MUNDIAL, PARA ELLO, APLICAREMOS UN ENFOQUE PROTEOGENOMICO GLOBAL QUE UTILIZA LAS ULTIMAS TECNICAS BIOINFORMATICAS, TRANSCRIPTOMICAS Y PROTEOMICAS DEDICADAS A DESCIFRAR SIN SESGOS EL CATALOGO COMPLETO DE PROTEINAS TRADUCIDAS IN VIVO, ESTE ENFOQUE INCLUYE EL ANALISIS DEL PERFIL DE RIBOSOMAS UNIDOS A LOS MRNAS (RIBO-SEQ) Y LA IDENTIFICACION DE LAS PROTEINAS MEDIANTE PROTEOMICA DE ALTA RESOLUCION COMBINADA CON BASES DE DATOS ESPECIALIZADAS, ES ESPERABLE QUE ALGUNAS DE LAS SMPS ESTAN CODIFICADAS EN PEQUEÑOS RNAS (SRNAS) O REGIONES DE LOS MRNAS PREVIAMENTE ANOTADAS COMO NO-CODIFICANTES, ALGUNAS DE LAS SMPS IDENTIFICAS SERAN SELECCIONAS DE ACUERDO A SU POSIBLE RELEVANCIA BIOLOGICA Y SERAN MARCADAS GENETICAMENTE PARA IDENTIFICAR SU LOCALIZACION SUBCELULAR Y LOS REGULADORES QUE CONTROLAN SU EXPRESION, ADEMAS, SE CONSTRUIRAN CEPAS DE S, AUREUS QUE CAREZCAN O SOBREEXPRESEN ESTAS SMPS PARA REALIZAR ANALISIS FENOTIPICOS, AQUELLAS SMPS QUE AFECTEN A FENOTIPOS RELEVANTES COMO EL CRECIMIENTO BACTERIANO, LA VIRULENCIA, LA FORMACION DE BIOFILM O LA RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS SERAN SELECCIONADAS PARA ESTUDIOS ADICIONALES, FINALMENTE, SE UTILIZARAN LAS SMPS COMO DIANAS PARA EL DISEÑO DE PEPTIDOS SINTETICOS QUE INCLUYAN LAS REGIONES FUNCIONALES DE LAS SMPS CON EL FIN DE IDENTIFICAR POSIBLES COMPUESTOS CON ACTIVIDADES ANTIMICROBIANAS,EN RESUMEN, LA FINALIDAD DE ESTE PROYECTO ES, POR UN LADO, MEJORAR LAS ANOTACIONES DE LOS GENOMAS DE S, AUREUS MEDIANTE LA INCLUSION DE LAS SMPS EXPRESADAS IN VIVO, POR OTRO, LA CARACTERIZACION FUNCIONAL DE LAS SMPS, QUE ADEMAS DE CONTRIBUIR CON EL AVANCE EN EL CONOCIMIENTO DE LOS MECANISMOS MOLECULARES, PERMITIRA LA IDENTIFICACION DE NUEVAS DIANAS PARA EL DESARROLLO DE AGENTES ANTIMICROBIANOS, ANTI-BIOFILM O ANTI-VIRULENCIA, CONSIDERANDO QUE EL INCREMENTO DE LA RESISTENCIA A LOS ANTIMICROBIANOS ES UNA DE LAS GRANDES AMENAZAS A LA SALUD PUBLICA, LA IDENTIFICACION DE PEPTIDOS QUE PODRIAN CONTRIBUIR EN LA PREVENCION O EL TRATAMIENTO DE LAS INFECCIONES ASOCIADAS A BACTERIAS MULTI-RESISTENTES PODRIA TENER UNA GRAN REPERCUSION SOCIAL, STAPHYLOCOCCUS AUREUS\PATOGENOS BACTERIANOS\MINI-PROTEINAS\NUEVAS FUNCIONES MOLECULARES\VIRULENCIA\RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS

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