Descripción del proyecto
ESTE PROYECTO SE CENTRA EN LA INTERACCION SIMBIOTICA QUE SE PRODUCE ENTRE DOS DE LAS ESTIRPES BACTERIANAS FIJADORAS DE NITROGENO MEJOR ESTUDIADAS HASTA LA FECHA, SINORHIZOBIUM FREDII HH103 Y RHIZOBIUM TROPICI CIAT 899, Y TRES LEGUMINOSAS HOSPEDADORAS DE GRAN INTERES ECONOMICO, COMERCIAL Y AGRICOLA, ADEMAS DE GRAN INTERES CIENTIFICO, COMO SON LA SOJA, LA JUDIA Y LA PLANTA MODELO PARA EL ESTUDIO DE LA SIMBIOSIS, LOTUS JAPONICUS,SE ESTUDIARAN EN PROFUNDIDAD DIFERENTES MOLECULAS SEÑAL PRODUCIDAS POR ESTOS RIZOBIOS Y QUE SON ACTUALMENTE DESCONOCIDAS, ENTRE ELLAS ENCONTRAMOS EL LIPOPOLISACARIDO, MOLECULA DE VITAL IMPORTANCIA PARA LA INTERACCION BACTERIANA CON EL HOSPEDADOR EUCARIOTA Y PARA EL MANTENIMIENTO DE LA ESTABILIDAD DE LA PARED CELULAR BACTERIANA, MIENTRAS QUE LA ESTRUCTURA DEL LPS DE S, FREDII HH103 SE HA DETERMINADO EN LOS ULTIMOS AÑOS POR NUESTRO GRUPO DE INVESTIGACION, SE INTENTARA DETERMINAR LA ESTRUCTURA DEL LPS DE R, TROPICI CIAT 899, DE LA QUE ACTUALMENTE SOLO SE CONOCE LA ESTRUCTURA DEL ANTIGENO O, EN PARALELO, SE ESTUDIARA EL EFECTO DE MUTACIONES EN DIFERENTES GENES DE BIOSINTESIS EN LA ESTRUCTURA DEL LPS EN AMBAS BACTERIAS, JUNTO CON EL LPS, ESTUDIAREMOS LA FUNCION Y EL PAPEL EN LA SIMBIOSIS DE UN TRANSPORTADOR POTENCIALMENTE INVOLUCRADO EN EL TRANSPORTE DE FLAVONOIDES AL INTERIOR DE LA BACTERIA, LO QUE PODRIA AFECTAR A LA ESPECIFICIDAD DE LA SIMBIOSIS, TAMBIEN SE ESTUDIARAN NUEVOS GENES RELACIONADOS CON LA FIJACION BIOLOGICA DEL NITROGENO QUE, SORPRENDENTEMENTE, SON INDUCIBLES POR FLAVONOIDES INDUCTORES ADEMAS DE POR CONCENTRACIONES BAJAS DE OXIGENO, POR LO QUE PODRIAN ESTAR SOMETIDOS A UNA REGULACION COMPLETAMENTE DISTINTA A LA HABITUAL, FINALMENTE SE DETERMINARA EL PAPEL EN LA INTERACCION SIMBIOTICA DE UN NUEVO POSIBLE EFECTOR DE TIPO TALE (TRANSCRIPTIONAL ACTIVATOR-LIKE EFFECTOR), SECRETADO A TRAVES DEL SISTEMA DE SECRECION DE TIPO 3 (T3SS) Y QUE, POR HOMOLOGIA CON EFECTORES SIMILARES DE LOS FITOPATOGENOS XANTHOMONAS O RALSTONIA, PODRIA ESTAR INVOLUCRADO EN LA INDUCCION DE LA TRANSCRIPCION DIRECTA DE GENES EN EL HOSPEDADOR, LOS EFECTORES DE TIPO TALE DETERMINAN LA CAPACIDAD DE INDUCIR ENFERMEDAD EN ESTOS FITOPATOGENOS Y ACTUALMENTE SE ESTAN UTILIZANDO COMO HERRAMIENTA BIOTECNOLOGICA PARA LA EDICION GENOMICA DE EUCARIOTAS (TECNOLOGIA TALEN),POR OTRO LADO, SE ESTUDIARA DE MANERA GLOBAL POR PRIMERA VEZ, LA EXPRESION GENICA TANTO DEL HUESPED COMO DEL HOSPEDADOR DURANTE DIFERENTES ETAPAS DEL PROCESO SIMBIOTICO MEDIANTE RNASEQ DUAL, EL OBJETIVO DE ESTOS ESTUDIOS ES DETERMINAR LAS DIFERENTES RUTAS DE SEÑALIZACION QUE FAVORECEN O BLOQUEAN COMPLETAMENTE LA NODULACION EN LAS TRES LEGUMINOSAS DE INTERES COMERCIAL O CIENTIFICO MENCIONADAS ANTERIORMENTE, EN ESTOS ESTUDIOS SE INCLUIRAN DIFERENTES MUTANTES EN GENES RESPONSABLES DE LA REGULACION LA PRODUCCION DE DISTINTAS SEÑALES MOLECULARES ESENCIALES PARA LA SIMBIOSIS Y QUE HEMOS VISTO QUE DETERMINAN LA ESPECIFICIDAD DE NODULACION O TIENEN UN PAPEL RELEVANTE EN LA EFICIENCIA DE LA FIJACION DEL NITROGENO, ESTOS ESTUDIOS SE COMPLEMENTARAN CON EL SEGUIMIENTO DEL PROCESO DE INFECCION MEDIANTE MICROSCOPIA DE EPIFLUORESCENCIA O CONFOCAL, MEDIANTE LA CUANTIFICACION DE LA EXPRESION DE GENES DE LA PLANTA HOSPEDADORA RELACIONADOS CON LA SIMBIOSIS Y LA CUANTIFICACION DE LA SINTESIS DE DIFERENTES HORMONAS QUE ESTAN ASOCIADAS A ESTOS PROCESOS, ESTA APROXIMACION PERMITIRA INCREMENTAR NOTABLEMENTE EL CONOCIMIENTO DE LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE OPERAN EN LA SIMBIOSIS RIZOBIO-LEGUMINOSA, SIMBIOSIS RIZOBIO-LEGUMINOSA\RHIZOBIUM TROPICI CIAT 899\SINORHIZOBIUM FREDII HH103\SOJA\FRIJOL\LOTUS\RNASEQ DUAL\LIPOPOLISACARIDO (LPS)\SEÑALES MOLECULARES\EFECTORES T3SS