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PID2020-115051RB-I00

Financiado

IDENTIFICACION DE LOS SUBTIPOS METABOLICOS DE CANCER COLORRECTAL PARA EL DESARRO...

IDENTIFICACION DE LOS SUBTIPOS METABOLICOS DE CANCER COLORRECTAL PARA EL DESARROLLO DE MEDICINA PERSONALIZADA EL CANCER COLORRECTAL (CCR) ES EL TERCER TIPO DE CANCER MAS COMUN Y EL SEGUNDO EN MORTALIDAD, DESGRACIADAMENTE, LA QUIMIOTERAPIA ACTUAL CONTRA EL CCR, COMO FOLFOX, TIENE UNA EFECTIVIDAD LIMITADA A CAUSA DE LA ADQUISICION DE QUIMIO... ver más

01/01/2020

351K€

Presupuesto del proyecto: 351K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 328

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2020-01-01

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Participantes

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE BARCELONA

Total investigadores 328

Presupuesto del proyecto 351K€

Descripción del proyecto EL CANCER COLORRECTAL (CCR) ES EL TERCER TIPO DE CANCER MAS COMUN Y EL SEGUNDO EN MORTALIDAD, DESGRACIADAMENTE, LA QUIMIOTERAPIA ACTUAL CONTRA EL CCR, COMO FOLFOX, TIENE UNA EFECTIVIDAD LIMITADA A CAUSA DE LA ADQUISICION DE QUIMIORRESISTENCIA, Y SU ELEVADA HETEROGENEIDAD LIMITA GRAVEMENTE EL DESARROLLO DE TERAPIAS MAS EFICACES, EN ESTE SENTIDO SE HAN PROPUESTO NUEVOS CRITERIOS DE CLASIFICACION DEL CCR BASADOS EN PATRONES DE EXPRESION GENICA COMO EL CONSENSUS MOLECULAR SUBTYPES (CMS), BASADO EN SEIS METODOS DE CLASIFICACION PRE-EXISTENTES, SIN EMBARGO, NINGUNO DE ESTOS SEIS METODOS CONSIDERA LOS PATRONES METABOLICOS, A PESAR DEL PAPEL CLAVE DE LA REPROGRAMACION METABOLICA EN CANCER, ADEMAS, RECIENTEMENTE SE HA PUESTO DE MANIFIESTO EL PAPEL DEL METABOLISMO EN LA ADQUISICION DE QUIMIORRESISTENCIA, POR LO QUE ATACAR TAL ADAPTACION METABOLICA OFRECE NUEVAS OPORTUNIDADES TERAPEUTICAS, EL DESARROLLO DE CRITERIOS DE CLASIFICACION PARA CCR BASADOS EN EL METABOLISMO ESTA EN UNA FASE INCIPIENTE, SOLO RECIENTEMENTE SE HA DESARROLLADO ALGUN ESTUDIO PRELIMINAR QUE CLASIFICA EL CCR EN BASE A UN PEQUEÑO PANEL DE GENES METABOLICOS, SIN EMBARGO, LOS PATRONES BASADOS EN LA EXPRESION DE UN PEQUEÑO SUBCONJUNTO DE GENES METABOLICOS NO ABORDAN EL CONJUNTO DEL FENOTIPO METABOLICO QUE SURGE DE LA INTERACCION COMPLEJA ENTRE LA EXPRESION GENICA Y LOS METABOLITOS, AFORTUNADAMENTE, SE PUEDE ESTUDIAR ESTE FENOTIPO CON HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES COMO LOS MODELOS METABOLICOS DE ESCALA GENOMICA (GSMM), QUE PUEDEN INTEGRAR MULTIPLES DATOS OMICOS PARA CALCULAR LA DISTRIBUCION DE FLUJOS METABOLICOS, ASI, EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS UTILIZAR GSMMS PARA ANALIZAR EL FENOTIPO METABOLICO DE UNA GRAN COHORTE DE MUESTRAS DE CCR DE PACIENTES UTILIZANDO DATOS GENOMICOS DISPONIBLES EN BASES DE DATOS PUBLICAS, Y ASI IDENTIFICAR LOS PRINCIPALES SUBTIPOS METABOLICOS DE CCR, ADEMAS, EN BASE A NUESTROS TRABAJOS PREVIOS, HIPOTETIZAMOS QUE CADA SUBTIPO METABOLICO SUPERARA EL ESTRES INDUCIDO POR FARMACOS MEDIANTE ADAPTACIONES METABOLICAS ESPECIFICAS, PARA DEMOSTRARLO, CARACTERIZAREMOS LA ADAPTACION METABOLICA A FOLFOX EXPERIMENTADA POR LINEAS CELULARES DE CCR REPRESENTATIVAS DE CADA SUBTIPO METABOLICO, A CONTINUACION, IDENTIFICAREMOS QUE INHIBIDORES METABOLICOS EXISTENTES EVITAN LA ADQUISICION DE RESISTENCIA EN CADA SUBTIPO METABOLICO (DRUG REPOSITIONING), COMBINANDO DOS APROXIMACIONES: 1) UN CRIBADO DE FARMACOS UTILIZANDO LOS GSMMS, Y 2) UN CRIBADO DE GENES FUNCIONALES BASADO EN EL SILENCIAMIENTO DE GENES METABOLICOS MEDIANTE CRISPR EN CCR TRATADO CON FOLFOX, EL PRIMER CRIBADO EVALUARA SISTEMATICAMENTE IN SILICO Y EN CADA GRUPO LOS INHIBIDORES METABOLICOS EXISTENTES Y LOS CLASIFICARA EN FUNCION DE SU CAPACIDAD PARA REVERTIR LA ADAPTACION METABOLICA INDUCIDA POR FOLFOX, POR OTRO LADO, EL CRIBADO DE GENES BASADO EN CRISPR IDENTIFICARA LOS GENES METABOLICOS QUE PROMUEVEN LA SUPERVIVENCIA A FOLFOX DE LAS CELULAS DE CADA GRUPO, POR ULTIMO Y PARA CADA GRUPO METABOLICO, LAS DIANAS COINCIDENTES EN AMBOS CRIBADOS SE ADMINISTRARAN EN COMBINACION CON FOLFOX A LINEAS CELULARES Y A ORGANOIDES DERIVADOS DE PACIENTES DE CADA SUBTIPO, PARA FINALMENTE VALIDAR LA COMBINACION MAS PROMETEDORA EN MODELOS ANIMALES, EN CONCLUSION, NUESTRO PROYECTO PERMITIRA DESARROLLAR UN NUEVO METODO DE CLASIFICACION DE PACIENTES CON CCR, PERMITIENDO EL DISEÑO DE TERAPIAS PERSONALIZADAS PARA SUPERAR LA RESISTENCIA A FOLFOX Y ASI MEJORAR LA EFECTIVIDAD DE LOS TRATAMIENTOS E INCREMENTAR LA SUPERVIVENCIA DE LOS PACIENTES, CANCER COLORRECTAL (CCR)\SUBTIPOS METABOLICOS DE CCR\MODELOS METABOLICOS DE ESCALA GENOMICA (\QUIMIOTERAPIA\TERAPIA COMBINADA\GENOMICA FUNCIONAL\BIOLOGIA COMPUTACIONAL\ESTRATIFICACION\MEDICINA PERSONALIZADA

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