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High throughput analysis of the in vivo metabolite protein interactome in plants

In the last decade, new technologies have emerged to study protein-protein and protein-nucleic acid interactions under near-physiological conditions at large scale. In contrast, development of similar performing technologies for s... ver más

31/05/2016

VLAAMS INSTITUUT...

235K€

Presupuesto del proyecto: 235K€

Líder del proyecto

VIB VZW No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo FP7 notifico la concesión del proyecto el día 2016-05-31 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

VIB VZW No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Presupuesto del proyecto 235K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto In the last decade, new technologies have emerged to study protein-protein and protein-nucleic acid interactions under near-physiological conditions at large scale. In contrast, development of similar performing technologies for screening and discovery of in vivo metabolite/protein interactions has received little attention. Nonetheless, metabolites comprise a large and important fraction of the cellular molecules. Many can bind proteins as substrates, products, cofactors, and ligands, and thereby constitute metabolic networks or regulate a myriad of environmental and developmental responses, often at very low concentrations. Here, we will establish a performing method for the discovery of novel in vivo protein-metabolite interactions in the model plant Arabidopsis thaliana by adapting an available high throughput protein affinity purification/mass spectrometry platform used for detecting protein-protein interactions. Receptor proteins involved in jasmonate signalling will be used as the model systems to discover new metabolites that interact in vivo with proteins. Ultimately, the role of the identified metabolites and the relevance of their molecular interactions for the jasmonate signalling cascades that steer growth and metabolism will be investigated.

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