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BFU2014-58289-P

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ANALISIS GENOMICOS, PROTEOMICOS Y GENETICOS DE LA RED REGULADORA DEL DESARROLLO...

ANALISIS GENOMICOS, PROTEOMICOS Y GENETICOS DE LA RED REGULADORA DEL DESARROLLO FLORAL EN ARABIDOPSIS EL OBJETIVO GLOBAL DE NUESTRO GRUPO ES EL ESTUDIO Y LA CARACTERIZACION DE LAS REDES DE REGULACION GENICA QUE EJECUTAN LOS PROCESOS DE DESARROLLO EN PLANTAS, EMPLEAMOS EL DESARROLLO DE LA FLOR EN ARABIDOPSIS COMO NUESTRO SISTEMA M... ver más

01/01/2014

CENTRE RECERCA EN...

230K€

Presupuesto del proyecto: 230K€

Líder del proyecto

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas organismos publicos

TRL 4-5 | 50K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2014-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas organismos publicos

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 230K€

Descripción del proyecto EL OBJETIVO GLOBAL DE NUESTRO GRUPO ES EL ESTUDIO Y LA CARACTERIZACION DE LAS REDES DE REGULACION GENICA QUE EJECUTAN LOS PROCESOS DE DESARROLLO EN PLANTAS, EMPLEAMOS EL DESARROLLO DE LA FLOR EN ARABIDOPSIS COMO NUESTRO SISTEMA MODELO Y SUJETO EXPERIMENTAL, AL SER EL INICIO Y DESARROLLO DE LA FLOR UN EXCELENTE PARADIGMA PARA ESTUDIOS DE BIOLOGIA DEL DESARROLLO EN PLANTAS, MEDIANTE EL ANALISIS DE DATOS CORRELACIONADOS DE UNION IN VIVO DE FACTORES DE TRANSCRIPCION AL GENOMA (CHIP-SEQ) Y TRANSCRIPTOMICOS, HEMOS CARACTERIZADO LA RED REGULADORA DEL FACTOR APETALA1, Y DE OTROS FACTORES REGULADORES DEL DESARROLLO EN PLANTAS, SIN EMBARGO, ESTA CARACTERIZACION GLOBAL Y DINAMICA DEL PROCESO DE DESARROLLO ESTA BASADA PRINCIPLAMENTE EN EVALUAR LA EXPRESION GENICA EN TERMINOS DE TRANSCRIPTOMA, Y POR TANTO NO INCORPORANDO EL IMPORTANTE PAPEL DESEMPEÑADO POR PROCESOS REGULADORES QUE OCURREN DESPUES DE LA SINTESIS DE LOS TRANSCRITOS, EL TRABAJO PROPUESTO COMBINA METODOS GENOMICOS Y PROTEOMICOS PARA AVANZAR HACIA EL CONOCIMIENTO COMPLETO DE LA RED REGULADORA DEL DESARROLLO FLORAL EN ARABIDOPSIS (COMO "PROXY" DE LAS PLANTAS CON FLOR); PARA ENTENDER LA INFORMACION FUNCIONAL Y ESTRUCTURAL CODIFICADA EN EL GENOMA DE ARABIDOPSIS, EN CONCRETO EL PEPTIDOMA; Y PARA ASIGNAR FUNCIONES A GENES TODAVIA NO CARACTERIZADOS, OBJETIVOS ESPECIFICOS PARA ESTE PROYECTO SON: (1) CARACTERIZACION DE LA EXPRESION DEL GENOMA A LO LARGO DEL PROCESO DE DESARROLLO DE LA FLOR EN TERMINOS DE PROTEOMA (Y MODIFICACIONES DEL MISMO), Y SU CORRELACION CON EXPRESION TRANSCRIPCIONAL PARA DESCUBRIR NUEVOS MECANISMOS DE REGULACION; (2) CARACTERIZACION DEL PEPTIDOMA DE ARABIDOPSIS (SORFS Y SECUENCIAS CODIFICANTES "ESCONDIDAS" EN EL GENOMA DE ARABIDOPSIS), Y SU PAPEL EN EL DESARROLLO DE LA FLOR; (3) MECANISMOS MOLECULARES DE LA ACCION DE CUC1 (OTRO REGULADOR CRUCIAL EN EL PROCESO DE DESARROLLO DE LA FLOR, QUE PARTICIPA EN LA SEPARACION ENTRE LOS DISTINTOS MERISTEMOS Y ORGANOS); (4) ANALISIS GENETICO Y FUNCIONAL DE NUEVOS GENES DIANA DE AP1, HAY UN GRAN INTERES EN LA CARACTERIZACION DE REDES GENICAS REGULADORAS Y EN LAS ACTIVIDADES DE FACTORES DE TRANSCRIPCION SOBRE EL GENOMA DE ORGANISMOS EUCARIOTICOS (EL AREA DE ESTA PROPUESTA), PUES SON ESENCIALES PARA COMPRENDER, Y EVENTUALMENTE MANIPULAR, LAS BASES DEL DESARROLLO Y LA FISIOLOGIA DE LAS PLANTAS, ADEMAS, RESULTADOS RECIENTES OBTENIDOS CON DIVERSOS ORGANISMOS EUCARIOTAS INDICAN LA EXISTENCIA DE UNA FRACCION DEL PROTEOMA, MUY SUSTANCIAL PERO ESENCIALMENTE DESCONOCIDA, COMPUESTA FUNDAMENTALMENTE POR PEPTIDOS Y PROTEINAS PEQUEÑAS, Y CUYAS FUNCIONES ESTAN POR DESCUBRIR, ESTE PROYECTO ESTA BASADO EN LA INVESTIGACION QUE HEMOS LLEVADO A CABO EN LOS ULTIMOS AÑOS, PERO SE EXPANDE A NUEVAS AREAS USANDO LOS MAS RECIENTES AVANCES EN GENOMICA Y PROTEOMICA, PARA RESOLVER IMPORTANTES CUESTIONES EN ESTE AREA DE INVESTIGACION (DESARROLLO DE LA FLOR) Y EN LA BIOLOGIA DE PLANTAS EN GENERAL, LOS RESULTADOS DE NUESTRO GRUPO EN ESTA LINEA DE INVESTIGACION SE HAN PUBLICADO EN REVISTAS DE ALTO INDICE DE IMPACTO (SCIENCE, GENOME BIOLOGY), ARABIDOPSIS\DESARROLLO FLORAL\REDES GÉNICAS REGULADORAS\GENÓMICA\PROTEÓMICA\PEPTIDOMA\CHIP-SEQ\RNA-SEQ\SORFS

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