Descripción del proyecto
LAS CONDICIONES CLIMATICAS UNICAS DE LA CUENCA MEDITERRANEA PERMITEN EL CULTIVO DE FRUTALES SUBTROPICALES COMO EL AGUACATE, EL MANGO Y LA CHIRIMOYA. ESTAS ESPECIES SON DE GRAN INTERES EN ESPAÑA, YA QUE SOMOS EL PRINCIPAL PRODUCTOR DE AGUACATE Y MANGO EN EUROPA, Y DE CHIRIMOYA EN EL MUNDO. ESTOS CULTIVOS AUMENTAN SU PRODUCCION CADA AÑO Y SE EXPANDEN EN MAS PAISES DE LA REGION MEDITERRANEA, LO QUE SE TRADUCE EN UN IMPACTO ECONOMICO SIGNIFICATIVO. POR UN LADO, LA PRODUCCION LOCAL DE ESTAS FRUTAS REDUCE LA HUELLA DE CARBONO EN COMPARACION CON LAS IMPORTADAS A EUROPA DESDE MILES DE KILOMETROS. ADEMAS, LA PRODUCCION LOCAL ASEGURA QUE LA FRUTA LLEGUE AL CLIENTE FINAL EN CONDICIONES OPTIMAS DE MADURACION, EVITANDO TONELADAS DE DESPERDICIO DE ALIMENTOS. POR OTRO LADO, LAS SEVERAS SEQUIAS EN NUESTRA REGION, GENERAN PREOCUPACION SOBRE LA SOSTENIBILIDAD DE ESTOS CULTIVOS. OTRO DE LOS PRINCIPALES DESAFIOS EN ESTOS CULTIVOS ES LA LIMITACION DE LA DIVERSIDAD, YA QUE PRACTICAMENTE SON CULTIVOS MONOVARIETALES. SIN EMBARGO, A PESAR DE LA GRAN IMPORTANCIA DE ESTAS ESPECIES, HASTA HACE POCO TIEMPO CARECIAN DE RECURSOS GENOMICOS Y BIOINFORMATICOS PARA ESTUDIARLAS Y MEJORARLAS. EN 2021 Y 2022 SE SECUENCIARON LAS SECUENCIAS DEL GENOMA DE MANGO Y AGUACATE RESPECTIVAMENTE, Y EN 2023 PUBLICAMOS EL GENOMA DE CHIRIMOYA EN NUESTRO GRUPO. EL INSTITUTO DE HORTICULTURA MEDITERRANEA Y SUBTROPICAL "LA MAYORA" (IHSM) CUENTA CON UNA IMPORTANTE COLECCION DE VARIEDADES DE MANGO (81), AGUACATE (133), CHIRIMOYA (334) Y OTROS CULTIVOS FRUTALES SUBTROPICALES. ESTA COLECCION ES UNICA EN EUROPA, DONDE LOS INVESTIGADORES DEL IHSM LIDERAN EL ESTUDIO DE ESTOS CULTIVOS. NUESTRO GRUPO TIENE MAS DE 20 AÑOS DE EXPERIENCIA ESTUDIANDO ESTAS ESPECIES. ADEMAS, COLABORAMOS CON UNA AMPLIA RED DE INVESTIGADORES INTERNACIONALES Y RECIENTEMENTE HE LIDERADO EL DESARROLLO DE LOS PRINCIPALES PORTALES GENOMICOS INTERNACIONALES CON HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS PARA ESTAS ESPECIES (MANGOBASE, AVOBASE, Y IHSM SUBTROPICALS DB). AHORA, LA PRIORIDAD ES QUE ESTOS PORTALES GENOMICOS SE CONSOLIDEN COMO LOS PRINCIPALES REFERENTES INTERNACIONALES, ATENDIENDO A LAS NECESIDADES PRIORITARIAS DE ESTOS CULTIVOS. PARA LOGRAR ESTO, EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES DESARROLLAR HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS ADICIONALES E INTEGRAR MARCADORES MOLECULARES Y DATOS DE VARIACION DE GRUPOS DE INVESTIGACION DE TODO EL MUNDO. RECOPILAREMOS Y ANALIZAREMOS LA SECUENCIA COMPLETA DE LOS GENOMAS (WGS) DE UNA SELECCION DE 50 ENTRADAS DE LA COLECCION DEL IHSM. ADEMAS, RECOPILAREMOS WGS DE REPOSITORIOS PUBLICOS Y TAMBIEN ESPERAMOS RECIBIR CIENTOS DE MUESTRAS DE GRUPOS DE INVESTIGACION COLABORADORES DE AUSTRALIA Y EE.UU. TAMBIEN, DISEÑAREMOS HERRAMIENTAS PARA EXPLORAR NUESTRA COLECCION DE GERMOPLASMA E INTEGRAR DATOS DE PASAPORTE Y FENOTIPADO, QUE SERAN UTILES PARA ENCONTRAR LOS INDIVIDUOS MAS ADECUADOS PARA CADA DISEÑO EXPERIMENTAL. ESTO SERA DE GRAN UTILIDAD PARA MEJORAR ESTAS ESPECIES A NIVEL MUNDIAL Y NOS SERA DE GRAN AYUDA PARA MEJORAR PORTAINJERTOS TOLERANTES A LA SALINIDAD, LA SEQUIA Y OTROS ESTRESES ABIOTICOS Y BIOTICOS, Y PARA IDENTIFICAR ACCESIONES MAS PRODUCTIVAS, CON CARACTERISTICAS AGRONOMICAS INTERESANTES. CULTIVOS SUBTROPICALES\MARCADORES MOLECULARES\BANCO DE GERMOPLASMA\HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS\MEJORA GENETICA\GENOMICA\DIVERSIDAD GENETICA