Descripción del proyecto
LA POLIPLOIDIA HA JUGADO UN PAPEL ESENCIAL EN LA EVOLUCION DE LAS PLANTAS CON FLORES, Y EN ESPECIAL EN ALGUNOS GRUPOS AMPLIOS, COMO LAS GRAMINEAS, DE ENORME IMPORTANCIA ECOLOGICA Y ECONOMICA, LA MAYOR PARTE DE LAS GRAMINEAS QUE PUEBLAN LA TIERRA SON POLIPLOIDES, ESTAS PLANTAS SON SUJETOS EXPERIMENTALES DIFICILES DE ANALIZAR PARA PODER ESTUDIAR CON ELLOS LOS PROCESOS EVOLUTIVOS DEBIDO A SUS ENORMES Y COMPLEJOS GENOMAS Y A QUE GENERALMENTE SUS PROGENITORES ANCESTRALES SON DESCONOCIDOS, POR ELLO, HEMOS ENFOCADO NUESTRA INVESTIGACION EN EL COMPLEJO BRACHYPODIUM HYBRIDUM, UN SISTEMA DE PLANTAS MODELO MANEJABLE, FORMADO POR ESPECIES ANUALES SILVESTRES CON EXTRAORDINARIAS CARACTERISTICAS BIOLOGICAS Y GENOMICAS, QUE INCLUYE TANTO ESPECIES PROGENITORAS DIPLOIDES COMO SUS DERIVADOS ALOPOLIPLOIDES, PARA ESTUDIAR LA POLIPLOIDIA, HOY EN DIA ESTA AMPLIAMENTE ACEPTADO QUE LAS PLANTAS ALOPOLIPLOIDES ACTUALES SE HAN ORIGINADO RECURRENTEMENTE, PERO MUY POCOS CASOS HAN SIDO DOCUMENTADOS EMPLEANDO FORMACIONES NATURALES MULTIPLES DE LA MISMA ESPECIE, NUESTRO GRUPO DE INVESTIGACION HA DEMOSTRADO LOS ORIGENES RECURRENTES Y POR CRUZAMIENTOS RECIPROCOS DE LA MISMA ESPECIE ALOPOLIPLOIDE B, HYBRIDUM EN DISTINTOS MOMENTOS EVOLUTIVOS EN LA NATURALEZA, Y HEMOS RECREADO TAMBIEN ALOPOLIPLOIDES SINTETICOS EN EL LABORATORIO, GENERANDO CON ELLO UN ESCENARIO EVOLUTIVO A LO LARGO DEL TIEMPO QUE SIRVE PARA PROBAR HIPOTESIS ALTERNATIVAS SOBRE EVENTOS FUNDADORES O DE POST-POLIPLOIDIZACION QUE PUEDAN HABER CAUSADO EL ORIGEN Y LA ADAPTACION FUNCIONAL DE CADA ALOPOLIPLOIDE, EN ESTE PROYECTO INVESTIGAREMOS POR PRIMERA VEZ LOS ORIGENES MULTIPLES DE ESTOS ALOPOLIPLOIDES USANDO UNA APROXIMACION PANGENOMICA Y DESARROLLANDO PRUEBAS DE HIPOTESIS SOBRE SI LA VARIACION DE LA ESPECIE ALOPOLIPLOIDE Y DE SUS GENES ESPECIFICOS Y REDES REGULADORAS SON PARTE O NO DE LA VARIACION EXISTENTE EN SUS ESPECIES PROGENITORAS DIPLOIDES, ANALIZAREMOS ESTAS HIPOTESIS A LO LARGO DE UNA ESCALA TEMPORAL, PROBANDO SI LOS POTENCIALES REORDENAMIENTOS GENOMICOS, LOS CAMBIOS EN LA EXPRESION DE LOS GENES Y LOS MECANISMOS REGULATORIOS DE LOS ALOPOLIPLOIDES OCURREN INMEDIATAMENTE DESPUES DE LA POLIPLOIDIZACION O A LO LARGO DEL TIEMPO, E INVESTIGANDO EL POTENCIAL EFECTO DE LA PRESION SELECTIVA SOBRE ELLOS, DESENTRAÑAR LA EVOLUCION DE LAS PLANTAS ALOPOLIPLOIDES SUPONE UN DESAFIO AUN MAYOR CUANDO SUS PROGENITORES DIPLOIDES ESTAN EXTINTOS, ABORDAREMOS ESTE DESAFIO EMPLEANDO LAS ESPECIES DEL SISTEMA MODELO PERENNE BRACHYPODIUM EN LAS CUALES HEMOS IDENTIFICADO RECIENTEMENTE LA PRESENCIA DE GENOMAS HOMEOLOGOS TANTO CONOCIDOS COMO DESCONOCIDOS, ESTOS ULTIMOS HEREDADOS DE ANCESTROS DIPLOIDES EXTINTOS O NO MUESTRADOS, EN ESTE PROYECTO INVESTIGAREMOS LA NATURALEZA Y LOS ORIGENES DE LOS GENOMAS HOMEOLOGOS EMPLEANDO APROXIMACIONES DE GENOMICA FUNCIONAL Y CITOGENETICAS, ADICIONALMENTE PROBAREMOS HIPOTESIS SOBRE SI LA POSESION DE ESOS GENOMAS HOMEOLOGOS DESCONOCIDOS LES HAN CONFERIDO UN MAYOR EXITO ADAPTATIVO A CONDICIONES AMBIENTALES DE ESTRES A LOS ALOPOLIPLOIDES EN COMPARACION CON LAS DE SUS PROGENITORES DIPLOIDES ACTUALES (GENOMAS ORTOLOGOS CONOCIDOS) USANDO APROXIMACIONES PANGENOMICAS, DE COMPOSICION O EXPRESION DIFERENCIAL DE GENES Y PRUEBAS DE EVOLUCION DE NICHO, COMPLEJO MODELO BRACHYPODIUM\GENOMICA COMPARADA Y FUNCTIONAL\CITOGENETICA\EVENTOS FUNDADORES VS POST-POLIPLOIDIZAC\ORIGENES MULTIPLES DE ALOPOLIPLOIDES\PANGENOMICA\MODELADO DE NICHO ECOLOGICO\EVOLUCION DE NICHO