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PID2019-104249GB-I00

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GENOMICA DE LA ADAPTACION DE LAS PLANTAS: UN ESTUDIO COMPARATIVO EXPLOTANDO LA V...
GENOMICA DE LA ADAPTACION DE LAS PLANTAS: UN ESTUDIO COMPARATIVO EXPLOTANDO LA VARIACION NATURAL DE ARABIDOPSIS Y CARDAMINE A BAJA ESCALA GEOGRAFICA Y TEMPORAL UNO DE LOS RETOS FUNDAMENTALES DE LA BIOLOGIA VEGETAL, IMPULSADO POR EL RECIENTE CAMBIO CLIMATICO GLOBAL, ES COMPRENDER LOS MECANISMOS DE ADAPTACION DE LAS PLANTAS, SIN EMBARGO, DEBIDO A LA COMPLEJIDAD DE LOS CARACTERES CUANTITATI... UNO DE LOS RETOS FUNDAMENTALES DE LA BIOLOGIA VEGETAL, IMPULSADO POR EL RECIENTE CAMBIO CLIMATICO GLOBAL, ES COMPRENDER LOS MECANISMOS DE ADAPTACION DE LAS PLANTAS, SIN EMBARGO, DEBIDO A LA COMPLEJIDAD DE LOS CARACTERES CUANTITATIVOS DETERMINADA POR SU NATURALEZA MULTIGENICA Y SU INTERACCION CON NUMEROSOS FACTORES AMBIENTALES, SE DESCONOCEN TODAVIA LAS BASES GENOMICAS, MOLECULARES Y EVOLUTIVAS DE LA ADAPTACION, CON EL FIN DE ABORDAR ESTA COMPLEJIDAD, SE PROPONE UN ESTUDIO GENOMICO DE LA VARIACION NATURAL DE LAS PLANTAS ANUALES BASADO EN LA COMBINACION DE TRES COMPONENTES EXPERIMENTALES, 1) SE INTEGRARAN LAS TRES FUENTES DE VARIACION QUE SON NECESARIAS PARA LA EVOLUCION ADAPTATIVA (LA VARIACION AMBIENTAL, FENOTIPICA Y GENETICA) EN LA DISECCION DE DOS CARACTERES FUNDAMENTALES DEL DESARROLLO DE LAS PLANTAS: EL TIEMPO DE FLORACION Y LA DENSIDAD DE TRICOMAS, ESTOS CARACTERES ESTAN IMPLICADOS EN LA ADAPTACION A FACTORES DE ESTRES ABIOTICO (EJ, CLIMA) Y BIOTICOS (EJ, HERBIVORIA) Y PROPORCIONAN DOS ESCENARIOS GENOMICOS DE DIFERENTE COMPLEJIDAD, 2) SE LLEVARAN A CABO ANALISIS GENOMICOS COMPARATIVOS DE LA VARIACION NATURAL PARA ESTOS CARACTERES ENTRE DOS PLANTAS SILVESTRES MODELO: ARABIDOPSIS Y CARDAMINE, ASI ESPERAMOS IDENTIFICAR LOS MECANISMOS RESPONSABLES DE LA EVOLUCION ADAPTATIVA PARALELA Y DIFERENCIAL EN DOS ESPECIES RELACIONADAS, 3) PARA AUMENTAR EL POTENCIAL DE LOS ANALISIS DE ASOCIACION GENOMICA (GWA) ENFOCAREMOS NUESTRO ESTUDIO A LAS ESCALAS GEOGRAFICA Y TEMPORAL DE BAJA PROFUNDIDAD, DE ESTA FORMA ESPERAMOS REDUCIR LOS FACTORES QUE LIMITAN LA DETECCION DE GENES IMPLICADOS EN ADAPTACION (EJ, DEMOGRAFIA, HETEROGENEIDAD ALELICA), EL OBJETIVO GENERAL DE ESTE PROYECTO ES DILUCIDAR Y COMPARAR EN ARABIDOPSIS Y CARDAMINE, LOS MECANISMOS GENOMICOS Y MOLECULARES DE LA ADAPTACION DE LAS PLANTAS A TRAVES DE MODIFICACIONES DEL TIEMPO DE FLORACION Y DE LA DENSIDAD DE TRICOMAS, CON ESTE FIN, SE LLEVARAN A CABO DOS OBJETIVOS ESPECIFICOS, 1) SE DETERMINARA LA ARQUITECTURA GENOMICA DE ESTOS CARACTERES EN AMBAS ESPECIES A ESCALA REGIONAL, PARA ELLO SE REALIZARAN ANALISIS DE ASOCIACION GENOMICA AMBIENTALES Y FENOTIPICOS USANDO UNA COLECCION REGIONAL DE 125-250 ACCESIONES SILVESTRES DE ARABIDOPSIS Y CARDAMINE DE LA PENINSULA IBERICA, ESTOS ANALISIS NO SOLO REVELARAN NUEVAS REGIONES GENOMICAS ASOCIADAS CON CADA UNO DE ESTOS CARACTERES, SINO TAMBIEN LOS FACTORES CLIMATICOS QUE DIRIGEN LA EVOLUCION DE LA FLORACION Y LA DENSIDAD DE TRICOMAS, 2) SE ESTUDIARA LA ARQUITECTURA GENOMICA DE AMBOS CARACTERES A ESCALA LOCAL Y TEMPORAL, PARA ELLO SE DESARROLLARA UN NUEVO RECURSO GENOMICO BASADO EN ~200 ACCESIONES DE ARABIDOPSIS RECOLECTADAS EN LOS ULTIMOS 10 AÑOS EN UNA POBLACION LOCAL IBERICA, LOS GENOMAS DE ESTAS ACCESIONES SE SECUENCIARAN Y UTILIZARAN PARA REALIZAR ANALISIS DE ASOCIACION GENOMICA DIRIGIDOS A ENCONTRAR LAS REGIONES DEL GENOMA QUE AFECTAN A ESTOS DOS CARACTERES Y QUE ESTAN DIFERENCIADAS ENTRE MICROHABITATS O AÑOS, LOS GENES MAS SIGNIFICANTES DETECTADOS EN AMBOS OBJETIVOS SE CARACTERIZARAN FUNCIONALMENTE EN ARABIDOPSIS Y CARDAMINE, ASI ESPERAMOS IDENTIFICAR GENES Y MECANISMOS MOLECULARES IMPLICADOS EN LA ADAPTACION A LOS DIFERENTES MICROAMBIENTES Y FACTORES CLIMATICOS DE LA ULTIMA DECADA, Y QUE ESTAN CONSERVADOS O DIFERENCIADOS EN AMBAS ESPECIES, ESTE CONOCIMIENTO PROPORCIONARA GENES DIANA PARA LOS PROGRAMAS DE MEJORA GENETICA ENFOCADOS AL DESARROLLO DE NUEVAS VARIEDADES DE CULTIVOS ADAPTADAS AL CAMBIO CLIMATICO EN LA REGION MEDITERRANEA, ARABIDOPSIS\CARDAMINE\VARIACION NATURAL\GENOMICA COMPARATIVA\GENETICA CUANTITATIVA\ADAPTACION\FLORACION\TRICOMA\CLIMA\ANALISIS DE ASOCIACION GENOMICA (GWA) ver más
01/01/2019
CSIC
242K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2019-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 242K€
Líder del proyecto
AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Perfil tecnológico TRL 2-3 552M