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AGL2017-86946-R

Financiado

GENOMICA APLICADA AL DESARROLLO DE MARCADORES PREDICTIVOS DE CARACTERES REPRODUC...

GENOMICA APLICADA AL DESARROLLO DE MARCADORES PREDICTIVOS DE CARACTERES REPRODUCTIVOS EN VERRACO LA EFICIENCIA REPRODUCTIVA ES CLAVE EN LA SOSTENIBILIDAD DE LA INDUSTRIA GANADERA, LA SELECCION GENETICA PARA CARACTERES REPRODUCTIVOS EN CERDOS SE REALIZA TRADICIONALMENTE EN HEMBRAS, MIENTRAS QUE EN VERRACOS ESTA SE CENTRA EN CA... ver más

01/01/2017

CENTRE RECERCA EN...

145K€

Presupuesto del proyecto: 145K€

Líder del proyecto

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas organismos publicos

TRL 4-5 | 50K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2017-01-01

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Participantes

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMI...

Lider

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Líder del proyecto

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB...

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 145K€

Descripción del proyecto LA EFICIENCIA REPRODUCTIVA ES CLAVE EN LA SOSTENIBILIDAD DE LA INDUSTRIA GANADERA, LA SELECCION GENETICA PARA CARACTERES REPRODUCTIVOS EN CERDOS SE REALIZA TRADICIONALMENTE EN HEMBRAS, MIENTRAS QUE EN VERRACOS ESTA SE CENTRA EN CARACTERES PRODUCTIVOS, ESTO ESTA CAUSANDO UNA DISMINUCION DE LA CALIDAD SEMINAL Y UN INCREMENTO EN LA TASA DE RECHAZO DE VERRACOS EN LOS CENTROS DE INSEMINACION ARTIFICIAL, CON GRAN PREOCUPACION EN EL SECTOR GANADERO, EN LOS ULTIMOS AÑOS, LA INVESTIGACION SOBRE CARACTERES REPRODUCTIVOS EN VERRACO HA GANADO ATENCION, NUESTRO GRUPO HA LLEVADO A CABO UN GWAS Y ANALISIS DE EXPRESION DIFERENCIAL CON EL OBJETIVO DE ELUCIDAR LA BASE GENETICA DE LA CALIDAD SEMINAL Y DE LA CONGELABILIDAD DEL SEMEN, UN CARACTER IMPORTANTE PUESTO QUE PERMITE UNA OPTIMIZACION DE LA PRESERVACION Y TRANSPORTE DEL MATERIAL GENETICO DE LOS VERRACOS DE ELITE,GENBORE PROPONE EXTENDER ESTA INVESTIGACION A UN NUMERO MAYOR DE VERRACOS PIETRAIN E INCLUIR MEDIDAS DE FERTILIDAD EN MACHOS UTILIZANDO MATERIAL GENETICO Y REGISTROS FENOTIPICOS DE UNA COMPAÑIA PRIVADA, LA CALIDAD SEMINAL SE MEDIRA EN DIEZ EYACULADOS POR VERRACO CON EL OBJETIVO DE CORREGIR LA ALTA VARIABILIDAD INTRA-INDIVIDUAL OBSERVADA EN ESOS CARACTERES, VAMOS A LLEVAR A CABO UN GWAS DE ESTOS CARACTERES EN 480 CERDOS UTILIZANDO EL AFFYMETRIX AXIOM ARRAY DE 660,000 SNPS, LOS GENOTIPOS SERAN TAMBIEN UTILIZADOS, CONJUNTAMENTE CON LA INFORMACION GENEALOGICA PADRE : HIJOS, PARA EVALUAR LA DISTORSION DE LA TRANSMISION ALELICA (TRD), INDICATIVA DE UN EFECTO ALELICO EN LA EFICIENCIA REPRODUCTIVA, AMBOS ESTUDIOS OFRECERAN UNA INFORMACION COMPLEMENTARIA SOBRE LA BASE GENETICA DE LA FERTILIDAD EN EL VERRACO, ADEMAS, ANALIZAREMOS LAS REGIONES GWAS Y TRD MAS INTERESANTES MEDIANTE RNA-SEQ DEL ESPERMA DE 46 CERDOS REPRESENTANDO LAS DIFERENTES CLASES GENOTIPICAS, CON ESOS DATOS, SE LLEVARA A CABO UN ANALISIS DE EXPRESION DIFERENCIAL ENTRE LOS GENOTIPOS GWAS, SE BUSCARAN VARIANTES GENETICAS EXPRESADAS QUE CO-SEGREGUEN CON LAS REGIONES GWAS/TRD Y SE BUSCARAN CIS-EQTLS EN ESTAS REGIONES, TAMBIEN SE PLANTEA MEDIANTE TECNICAS DE NGS LA CARACTERIZACION DEL MICROBIOMA ESPERMATICO PORCINO Y EL ESTUDIO DE SU EFECTO SOBRE LA CALIDAD SEMINAL Y LA FERTILIDAD, SIMULTANEAMENTE SE ESTUDIARA LA PRESENCIA DE PATOGENOS Y LA EXISTENCIA DE GENES DE RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS COMO POTENCIAL VIA DE DISEMINACION DE RESISTENCIA EN LOS PROCESOS DE INSEMINACION DADA LA CRECIENTE PREOCUPACION SOBRE ESTE TEMA POR PARTE DE LAS AUTORIDADES SANITARIAS Y LEGISLATIVAS, IGUALMENTE, SE ESTUDIARAN LAS 9 REGIONES GWAS DE CONGELABILIDAD DETECTADAS EN NUESTRO ESTUDIO PREVIO MEDIANTE RNA-SEQ DE ESPERMA DE ANIMALES CON GENOTIPOS GWAS CLAVE, ESTOS DATOS SERAN SUJETOS A ANALISIS DE EXPRESION DIFERENCIAL ENTRE GENOTIPOS, BUSQUEDA DE VARIANTES EXPRESADAS CO-SEGREGANDO CON LOS GWAS Y LOCALIZACION DE CIS-EQTLS,EL OBJETIVO FINAL DE ESTE PROYECTO CONSISTE EN UTILIZAR TODA ESTA INFORMACION PARA SELECCIONAR UN PANEL DE VARIANTES GENETICAS Y VALIDAR SU ASOCIACION CON LOS CARACTERES REPRODUCTIVOS EN EL VERRACO EN UNA VARIEDAD DE RAZAS (LARGE WHITE, LANDRACE, DUROC E IBERICO), ESTE PANEL DE MARCADORES PODRIA SER DE GRAN UTILIDAD PARA LOS GANADEROS PARA SU IMPLEMENTACION EN LOS ESQUEMAS DE SELECCION GENETICA Y ELECCION DE LOS VERRACOS CON MAYOR VALOR GENETICO QUE ADEMAS SEAN BUENOS REPRODUCTORES Y CON SEMENES CONGELABLES, GWAS\RNA-SEQ\CALIDAD SEMINAL\FERTILIDAD\CONGELABILIDAD\PANEL DE MARCADORES DNA\TRANSMISSION RATIO DISTORTION\EQTL\FINE-MAPPING

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