Descripción del proyecto
LA PRESENTE PROPUESTA DE PROYECTO TRATA LOS PRINCIPALES PROBLEMAS ACTUALES EN CIENCIA ANIMAL: PRODUCCION DE ALIMENTOS SEGUROS PROVENIENTES DE ANIMALES SANOS, CUMPLIENDO LAS EXPECTATIVAS DE BIENESTAR ANIMAL, EL PROYECTO, SI SE FINANCIA, ABORDARA CON LOS METODOS MAS AVANZADOS EN LA ACTUALIDAD Y ESTUDIOS EN LA INTERFAZ DE LA CIENCIA ANIMAL (SELECCION GENOMICA), GENETICA HUMANA (ESTUDIOS DE ASOCIACION CON GENOMA COMPLETO-GWAS-) Y CIENCIA DE LA COMPUTACION ESTADISTICA (APRENDIZAJE AUTOMATICO), LOS PANELES DE POLIMORFISMOS DE UN SOLO NUCLEOTIDO (SNP) SE HAN COMERCIALIZADO RECIENTEMENTE Y HAN EMPEZADO A UTILIZARSE EN ESPECIES GANADERAS PARA MAPEAR E IDENTIFICAR VARIANTES DEL GENOMA QUE SUBYACEN EN DISTINTOS CARACTERES PARA SELECCIONAR GENETICAMENTE ANIMALES DESEABLES, LA SELECCION GENOMICA USANDO EL GENOMA COMPLETO ES UNA APLICACION PROMETEDORA QUE PODRIA LLEGAR A DOBLAR LA TASA DE PROGRESO GENETICO POR SELECCION, UN ASPECTO IMPORTANTE PARA CARACTERES DE BAJA HEREDABILIDAD, COMO LOS DE RESISTENCIA A ENFERMEDADES Y FUNCIONALIDAD, LA PARATUBERCULOSIS, MAMITIS, FERTILIDAD, DIFICULTAD AL PARTO Y RETENCION DE PLACENTA SON ALGUNOS DE LOS CARACTERES FUNCIONALES MAS INTERESANTES EN GANADO VACUNO LECHERO POR SU INFLUENCIA EN LOS COSTES DIRECTOS E INDIRECTOS DE EXPLOTACION Y SU IMPACTO EN LA SALUD PUBLICA, FUNCIONALIDAD DE LOS ANIMALES Y PRODUCCION DE ALIMENTOS SALUDABLES Y SEGUROS, LOS OBJETIVOS DEL PROYECTO SON: 1) DETERMINAR EL METODO MAS APROPIADO PARA IMPUTAR GENOTIPOS FALTANTES EN NUESTRA POBLACION DE VACAS DE LECHES 2) DETECTAR REGIONES GENOMICAS ASOCIADAS A CARACTERES FUNCIONALES Y DE RESISTENCIA A ENFERMEDADES DE IMPORTANCIA ECONOMICA EN EL VACUNO DE LECHE USANDO GWAS, E INCLUYENDO INTERACCIONES ENTRE MARCADORES, 2) INVESTIGAR NUEVOS METODOS PARA GWAS, EN PARTICULAR AQUELLOS RELACIONADOS CON EL APRENDIZAJE AUTOMATICO, QUE MEJOREN LA FIABILIDAD Y LA PRECISION DE LAS ESTIMAS, COMPARANDOLOS CON LOS METODOS ACTUALES,SE PROPONE UN PLANTEAMIENTO EXPERIMENTAL SIGUIENDO EL DISEÑO ESTANDAR DE CASO-CONTROL CON 512 ANIMALES (APROXIMADAMENTE, 250 CASOS Y 250 CONTROLES) PORQUE OFRECE NUMEROSAS VENTAJAS PARA LA DISECCION DE CARACTERES COMPLEJOS CON UN COSTE RAZONABLE Y UNA POTENCIA ESTADISTICA ADECUADA PARA LOS GWAS, SE APLICARAN METODOS AVANZADOS PARA DETECTAR LAS REGIONES GENOMICAS ASOCIADAS A CADA CARACTER Y PARA INCLUIR INFORMACION GENOMICA EN LAS EVALUACIONES GENETICAS DE ESTOS CARACTERES, SE ESPERA QUE ESTOS METODOS PROPORCIONEN UNA MAYOR PRECISION EN LA DETECCION DE VARIANTES GENOMICAS QUE LOS METODOS TRADICIONALES, EL EQUIPO INVESTIGADOR ESPERA CONSEGUIR RESULTADOS NOVEDOSOS Y RELEVANTES PARA EL SECTOR LECHERO Y LA COMUNIDAD CIENTIFICA, LOS RESULTADOS OBTENIDOS GENERARAN NUEVO CONOCIMIENTO SOBRE REGIONES GENOMICAS O VARIANTES GENICAS Y SUS INTERACCIONES AUN NO DETECTADAS PARA CARACTERES DE SALUD Y FUNCIONALIDAD, SE ESPERA ASIMISMO PROFUNDIZAR EN LOS MECANISMOS GENETICOS SUBYACENTES, INCLUYENDO INTERACCIONES ENTRE GENES, QUE AFECTAN ESOS CARACTERES, GENOMICA\SELECCION GENOMICA\VACUNO DE LECHE\MACHINE LEARNING\PARATUBERCULOSIS\MAMITIS\FERTILIDAD\SNP