Descripción del proyecto
LA SINERGIA ENTRE METODOS COMPUTACIONALES Y EL ACTUAL ARSENAL DE TECNICAS BIOFISICAS ES FUNDAMENTAL PARA DETERMINAR LA ESTRUCTURA Y FUNCION DE LOS GRANDES COMPLEJOS MACROMOLECULARES RESPONSABLES DE LAS PRINCIPALES FUNCIONES CELULARES. A PESAR DE LOS GRANDES AVANCES EN EL CAMPO, LA VARIABILIDAD CONFORMACIONAL Y EL MUESTREO EFICIENTE EN LAS ESCALAS DE TIEMPO BIOLOGICAMENTE RELEVANTES SE PRESENTAN COMO GRANDES DESAFIOS. EN ESTE CONTEXTO, PROPONEMOS EL DESARROLLO Y LA APLICACION DE NUEVOS METODOS COMPUTACIONALES PARA EL ESTUDIO DE LOS CAMBIOS CONFORMACIONALES DE MACROMOLECULAS QUE PERMITA LA INTEGRACION DE INFORMACION ESTRUCTURAL A DISTINTAS RESOLUCIONES PROVENIENTE DE DISTINTAS TECNICAS INSTRUMENTALES (CRISTALOGRAFIA DE RAYOS X, EM , SAXS, FRET, ETC). ENTRE ESTAS TECNICAS, LA CRIO-MICROSCOPIA DE PARTICULAS INDIVIDUALES SE HA CONVERTIDO EN UNA TECNICA DE REFERENCIA PARA CARACTERIZAR COMPLEJOS MACROMOLECULARES EN SOLUCION, GRACIAS A LOS RECIENTES AVANCES INSTRUMENTALES Y DE PROCESAMIENTO DE IMAGEN QUE HAN MEJORADO DRAMATICAMENTE SU RESOLUCION Y RENDIMIENTO. NUESTRO PLAN DE INVESTIGACION INCLUYE LA APLICACION DE LOS METODOS HIBRIDOS DESARROLLADOS EN ESTRECHA COLABORACION CON LABORATORIOS EXTERNOS PARA CARACTERIZAR LA FLEXIBILIDAD Y FUNCION DE MACROMOLECULAS CLAVE COMO SON: EL COMPLEJO DE PRE-INICIACION DE LA TRANSCRIPCION, EL REGULADOR DE LA PROTEINA DE LA CITOCINESIS 1 Y EL PROTEASOMA. ADEMAS, SE ESTUDIARA CON ESTAS TECNICAS HIBRIDAS LOS MECANISMOS MOLECULARES DE MICROTUBULOS Y FILAMENTOS FTSZ PARA ENTENDER MEJOR LA DINAMICA E INHIBICION DE ESTOS IMPORTANTES SISTEMAS DEL CITOESQUELETO. LA APLICACION DE NUESTRAS HERRAMIENTAS HIBRIDAS SOBRE ESTOS SISTEMAS NOS DARA LA OPORTUNIDAD DE PROBAR SUS BONDADES Y LIMITACIONES, A LA VEZ QUE PROPORCIONARA UN MARCO REAL PARA REFINARLAS. CREEMOS FIRMEMENTE QUE LA APLICACION DE ENFOQUES HIBRIDOS BIOFISICOS Y COMPUTACIONALES ES DETERMINANTE PARA LA COMPRENSION DE LAS ACCIONES, INTERACCIONES Y ENSAMBLAJE DE LA MAQUINARIA MACROMOLECULAR. IOLOGÍA ESTRUCTURAL\MICROSCOPIA ELECTRÓNICA\MUESTREO CONFORMACIONAL\MODELADO\MÉTODOS HÍBRIDOS\MAQUINAS MACROMOLECULARES\BIOINFORMÁTICA ESTRUCTURAL