Descripción del proyecto
LA TECNICA DE SINGLE CELL GENOMICS HAN REVOLUCIONADO EL ANALISIS DE LA COMPLEJIDAD DE LOS TEJIDOS EN CONTEXTOS DE SALUD Y ENFERMEDAD, EL SINGLE-CELL SEQUENCING (SCS) GENERA UNA VISION INDIVIDUAL DE LOS ESTADOS TRANSCRIPTOMICOS, EPIGENOMICOS O PROTEOMICOS DE LAS CELULAS, ACTUALMENTE, LOS EXPERIMENTOS DE SCS DE ARN PERMITEN EL ANALISIS DE MILES DE CELULAS A LA VEZ, MEJORANDO LA SENSIBILIDAD EN LA IDENTIFICACION DE ESTADIOS CELULARES ESPECIFICOS DURANTE EL INICIO Y LA PROGRESION DE LA ENFERMEDAD, EN CANCER, SE HAN CARACTERIZADO A NIVEL DE UNA CELULA, LOS ESTADIOS DE LAS CELULAS NEOPLASICAS Y LA REMODELACION DEL MICROAMBIENTE TUMORAL (MAT), IDENTIFICANDO PERFILES INMUNES Y ESTROMALES QUE FACILITAN LA PROGRESION DEL CANCER, ACTUALMENTE, LAS ESTRATEGIAS DE TRATAMIENTO ESTAN DIRIGIDAS DIRECTAMENTE A REACTIVAR LAS CELULAS DEL SISTEMA INMUNE QUE COMPONEN EL MAT CON EL OBJETIVO DE ELIMINAR LAS CELULAS TUMORALES, AUNQUE LAS TERAPIAS DIRIGIDAS CONTRA LOS INHIBIDORES DE PUNTOS DE CONTROL INMUNITARIO (ICI) HAN DEMOSTRADO IMPORTANTES BENEFICIOS CLINICOS PERFILES INMUNES FAVORABLES NO RESPONDEN A LOS TRATAMIENTOS EN MUCHOS TUMORES, SUGIRIENDO MECANISMOS ADICIONALES QUE CONFIEREN RESISTENCIA A LA INMUNOTERAPIA, EN ESTE SENTIDO, SE HA PROPUESTO QUE LA DISTRIBUCION ESPACIAL DE LAS CELULAS INMUNES Y DEL ESTROMA EN MAT IMPACTA EN LA RESPUESTA DE LAS INMUNOTERAPIAS, SIN EMBARGO, LAS TECNICAS DE ANALISIS ESPACIALES ACTUALES SOLO PERMITEN IDENTIFICAR EL PERFIL DE MARCADORES PUNTUALES O PERFILES DE EXPRESION GENICA GENERALES,EN EL PROYECTO ONCOCELL COMBINAREMOS LA POTENCIA DE LAS TECNICAS DE SCS CON LA TRANSCRIPTOMICA ESPACIAL (TE), GENERAREMOS UN MAPA COMPLETO DE LA COMPOSICION CELULAR DE LOS TUMORES EN TODOS LOS TIPOS DE CANCER, TODOS ESTOS DATOS SE RECOGERAN EN UN ATLAS DE REFERENCIA DE LAS CELULAS ANALIZADAS INDIVIDUALMENTE, DONDE SE PODRAN VER LOS DIVERSOS TIPOS CELULARES Y LOS ESTADIOS CELULARES SEAN DE UN TUMOR PRIMARIO O METASTASIS, ADEMAS, AMPLIAREMOS NUESTROS PREVIOS ESTUDIOS GENERANDO UN ATLAS DE CELULAS INMUNITARIAS TUMORALES MEDIANTE LA INTEGRACION DE LAS CELULAS INMUNES, EL ESTROMA Y LAS CELULAS TUMORALES, MEJORANDO LA COMPRENSION DE LA HETEROGENEIDAD TUMORAL PROPORCIONANDO UNA REFERENCIA COMPLETA DE LAS CELULAS DEL MAT, ESTE ATLAS SE INTEGRARA CON LOS DATOS CLINICOS DE LOS PACIENTES PERMITIENDO UNA TIPIFICACION TUMORAL ESTANDARIZADA, IDENTIFICANDO FACTORES DE PRONOSTICO Y DE RESPUESTA A LA INMUNOTERAPIA,ADEMAS, INTEGRAREMOS LOS DATOS MOLECULARES Y CELULARES DEL ATLAS JUNTO CON LAS ARQUITECTURAS TUMORALES OBTENIDAS ESPACIALMENTE PARA CREAR UN PROCESAMIENTO DIGITAL AUTOMATIZADO DE LAS MUESTRAS, DE ESTE MODO, AVANZAREMOS EN LA EVALUACION PATOLOGICA IDENTIFICANDO CARACTERISTICAS ESPECIFICAS, COMO ESTRUCTURAS TUMORALES, DISTRIBUCION ESPACIAL DE LAS CELULAS INMUNES Y SUS NIVELES DE EXPRESION GENICA, IMPLEMENTAREMOS UN MARCO EXPERIMENTAL Y COMPUTACIONAL PARA IDENTIFICAR NUEVOS GENES Y MARCADORES CELULARES MEJORANDO LA CLASIFICACION DE LOS SUBTIPOS DE CANCER, EN RESUMEN, COMBINANDO EL FENOTIPAJE UNICELULAR CON UNA LECTURA TRANSCRIPTOMICA ESPACIAL EN CORTES TUMORALES, BUSCAMOS IDENTIFICAR CON PRECISION LA INTERACCION Y CO-LOCALIZACION DE CELULAS INMUNITARIAS, ESTROMA Y CELULAS TUMORALES DEFINIENDO SU VALOR PREDICTIVO DE RESPUESTA A LA TERAPIA MEDIANTE UN PROCESO DE TOMA DE DECISIONES UTILIZANDO LA PATOLOGIA DIGITAL, CANCER\INMUNO-ONCOLOGIA\MICROAMBIENTE TUMORAL\GENOMICA DE CELULAS INDIVIDUALES\TRANSCRIPTOMICA\SECUENCIACION DE ARN\TRANSCRIPTOMICA ESPACIAL\INMUNOTERAPIA\PATOLOGIA DIGITAL