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PID2020-113284GB-C22

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EXPERIMENTAL EVOLUTION OF AN RNA BACTERIOPHAGE: INFLUENCE OF CONTACT NETWORKS, E...

EXPERIMENTAL EVOLUTION OF AN RNA BACTERIOPHAGE: INFLUENCE OF CONTACT NETWORKS, EXTERNAL ENVIRONMENT, AND PRE-EXISTING MUTATIONS EL PRINCIPAL OBJETIVO DE ESTE SUBPROYECTO ES EL ESTUDIO DE LA EVOLUCION DE VIRUS EN CONDICIONES RELEVANTES PARA SU PROPAGACION EN LAS POBLACIONES DE HOSPEDADORES. LOS RESULTADOS OBTENIDOS SERAN UTILIZADOS POR NUESTROS SOCIOS EN E... ver más

01/01/2020

INSTITUTO NACIONAL...

145K€

Presupuesto del proyecto: 145K€

Líder del proyecto

INSTITUTO NACIONAL DE TECNICA AEROESPACIAL No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 130K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2020-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

INSTITUTO NACIONAL DE TECNICA AEROESPACIAL No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 130K€

Presupuesto del proyecto 145K€

Descripción del proyecto EL PRINCIPAL OBJETIVO DE ESTE SUBPROYECTO ES EL ESTUDIO DE LA EVOLUCION DE VIRUS EN CONDICIONES RELEVANTES PARA SU PROPAGACION EN LAS POBLACIONES DE HOSPEDADORES. LOS RESULTADOS OBTENIDOS SERAN UTILIZADOS POR NUESTROS SOCIOS EN EL PROYECTO GLOBAL COORDINADO, CON EL FIN DE RECONSTRUIR LAS REDES DE GENOTIPOS EXPLORADAS DURANTE LA ADAPTACION Y TAMBIEN DE IMPLEMENTAR MODELOS EPIDEMIOLOGICOS TEORICOS. ESTA RETROALIMENTACION ENTRE RESULTADOS EMPIRICOS Y TEORIA ES FUNDAMENTAL PARA EL DESARROLLO DE MODELOS CON PROPIEDADES REALISTAS. LA PROBABILIDAD DE INFECCION ES UNO DE LOS FACTORES CON MAYOR INFLUENCIA EN LA ADAPTACION VIRAL. CUANTO MAYOR SEA ESTA PROBABILIDAD, MAS FACILIDAD TENDRA EL VIRUS PARA PERSISTIR EN UNA POBLACION DE HOSPEDADORES Y GENERAR UNA PROGENIE HETEROGENEA QUE CONTENGA LA DIVERSIDAD GENETICA Y FENOTIPICA QUE PERMITA LA ADAPTACION. ES FACIL COMPRENDER QUE LA PROBABILIDAD DE INFECCION ESTA RELACIONADA CON LA CONCENTRACION Y LA MOVILIDAD DE LOS HOSPEDADORES SUSCEPTIBLES, ASI COMO CON LA SENSIBILIDAD DEL VIRUS A LAS CONDICIONES AMBIENTALES ADVERSAS QUE PODRIAN DAÑAR SU INTEGRIDAD. POR ENCIMA DE LA DENSIDAD CRITICA DE HOSPEDADORES QUE PERMITE SU PROPAGACION SOSTENIDA, EL VIRUS PUEDE SELECCIONAR ESTRATEGIAS EVOLUTIVAS QUE LE PERMITAN MEJORAR SU CAPACIDAD DE REPLICACION Y/O TRANSMISION BAJO LAS PRESIONES SELECTIVAS QUE ESTEN ACTUANDO EN EL AMBIENTE. LA NATURALEZA Y EXTENSION DE LA DIVERSIDAD GENETICA PREEXISTENTE DETERMINARA LAS REDES GENOTIPICAS ACCESIBLES Y, POR TANTO, LAS POSIBLES TRAYECTORIAS ADAPTATIVAS Y LAS REGIONES DEL ESPACIO DE SECUENCIAS QUE SERAN OCUPADAS.EL SISTEMA QUE USAREMOS PARA LOS EXPERIMENTOS DE EVOLUCION ES EL BACTERIOFAGO QBETA, UN VIRUS LITICO CON UN GENOMA DE ARN QUE INFECTA A LA BACTERIA ESCHERICHIA COLI. LA REPLICACION DE QBETA TIENE LUGAR CON ALTA TASA DE ERROR, DANDO LUGAR A POBLACIONES MUY HETEROGENEAS QUE POSEEN UNA GRAN CAPACIDAD DE ADAPTACION. EL ANALISIS DE LOS CAMBIOS EXPERIMENTADOS POR LOS PARAMETROS QUE DEFINEN EL CICLO INFECCIOSO DE QBETA (TASA DE ADSORCION, NUMERO DE VIRUS PRODUCIDOS POR BACTERIA INFECTADA Y DURACION DEL PERIODO DE LATENCIA) EN RESPUESTA A LAS VARIACIONES TANTO EN LA DENSIDAD Y MOVILIDAD BACTERIANA COMO EN LAS VARIABLES AMBIENTALES EXTERNAS (TEMPERATURA, INTENSIDAD DE RADIACION ULTRAVIOLETA Y CONDICIONES QUE FAVORECEN LA DESECACION) PERMITIRA OBTENER INFORMACION RELEVANTE SOBRE LOS FACTORES QUE INFLUYEN EN LA PROPAGACION VIRAL Y LOS RESULTADOS ESPERADOS DE DETERMINADAS MEDIDAS DE CONTENCION QUE SUELEN APLICARSE DURANTE LOS BROTES EPIDEMICOS.LA DETERMINACION DE LAS SECUENCIAS CONSENSO DE LAS POBLACIONES VIRALES EVOLUCIONADAS, JUNTO CON LA CARACTERIZACION DE MUTANTES CONTENIENDO MUTACIONES UNICAS, SERA MUY UTIL PARA ESTABLECER RELACIONES FENOTIPO-GENOTIPO. FINALMENTE, LA SECUENCIACION MASIVA DE LAS POBLACIONES OBTENIDAS EN DIFERENTES MOMENTOS DE SU EVOLUCION, COMBINADA CON LA SECUENCIACION DE VIRUS INDIVIDUALES POR EL METODO DE SANGER, PERMITIRA ANALIZAR LAS REDES DE GENOTIPOS EXPLORADAS POR POBLACIONES QUE DIFIEREN EN SU DIVERSIDAD GENETICA PREEXISTENTE, CUANDO SE PROPAGAN SIGUIENDO EL MISMO REGIMEN DE TRANSMISION O SE ADAPTAN A UNA NUEVA PRESION SELECTIVA. DE ESTE MODO SERA POSIBLE ESTABLECER RELACIONES ENTRE REDES DE GENOTIPOS, PRESIONES SELECTIVAS E INNOVACIONES EVOLUTIVAS. VOLUCION EXPERIMENTAL\RELACIONES GENOTIPO-FENOTIPO\MODELIZACION\REDES DE GENOTIPOS\VIRUS DE RNA\BACTERIOFAGOS\EVOLUCION MOLECULAR

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