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Evolution of fungal mating type chromosomes

Sex chromosomes often show extensive areas of suppressed recombination and cytological differentiation, a well-documented phenomenon in animals and plants. Lack of recombination is expected to limit the efficacy of natural selecti... ver más

28/02/2018

UNIVERSITE PARISSA...

173K€

Presupuesto del proyecto: 173K€

Líder del proyecto

UNIVERSITE PARISSACLAY No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo H2020 notifico la concesión del proyecto el día 2018-02-28

MSCA-IF-2015-EF: Marie Skłodowska-Curie Individual F...

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Cerrada hace 9 años

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1 Participantes

UNIVERSITE PARISSACLAY

173.08K€ | Lider

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Duración del proyecto: 24 meses Fecha Inicio: 2016-02-15
Fecha Fin: 2018-02-28

Líder del proyecto

UNIVERSITE PARISSACLAY No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Presupuesto del proyecto 173K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto Sex chromosomes often show extensive areas of suppressed recombination and cytological differentiation, a well-documented phenomenon in animals and plants. Lack of recombination is expected to limit the efficacy of natural selection, leading to degeneration in gene content. Similarly, fungal mating-type chromosomes, which are responsible for controlling compatibility during mating, can display patterns of suppressed recombination encompassing up to 90% of the chromosome length. The mechanisms responsible for lack of recombination and consequent degeneration remain unclear. Here, I propose to use comparative genomics to investigate the patterns and underlying mechanisms involved in recombination suppression and genomic degeneration in Microbotryum, a model fungal system with a range of dimorphic mating-type chromosomes. I will complement the currently available high-quality genome assemblies for twenty species in the genus with three outgroups, which will allow to polarize all genomic data. I will then use the genomic dataset to: 1) test hypotheses on the origin of recombination suppression in fungal mating-type chromosomes; 2) study the evolution of non-recombining regions in fungal mating-type chromosomes, e.g., their size and age, and the existence of evolutionary strata; and 3) study the patterns and mechanisms of genomic degeneration in non-recombining regions, namely non-synonymous substitution accumulation, transposable elements, disrupted genes, and non-optimal codon usage. Results will not only shed light on the origins and consequences of suppressed recombination and genome degradation in fungal mating-type chromosomes, but will also yield unprecedented insights into the dynamics of sexual reproduction in eukaryotes and contribute for a unified view of the evolution of dimorphic chromosomes.

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