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PGC2018-102192-B-I00

Financiado

EVOLUCION COMPUTACIONAL DE ENZIMAS MEDIANTE LA EXPLORACION DE LA SUPERFICIE CONF...

MILLONES DE AÑOS DE EVOLUCION HAN HECHO QUE LAS ENZIMAS SEAN EXCELENTES CATALIZADORES CAPACES DE ACELERAR LAS REACCIONES HASTA EN DIECISIETE ORDENES DE MAGNITUD, LAS ENZIMAS (TAMBIEN LLAMADOS BIOCATALIZADORES) SON DE HECHO LOS CAT... ver más

01/01/2018

UDG

119K€

Presupuesto del proyecto: 119K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT DE GIRONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 226

Ver Participantes

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2018-01-01

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Participantes

UDG

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT DE GIRONA

Total investigadores 226

Presupuesto del proyecto 119K€

Descripción del proyecto MILLONES DE AÑOS DE EVOLUCION HAN HECHO QUE LAS ENZIMAS SEAN EXCELENTES CATALIZADORES CAPACES DE ACELERAR LAS REACCIONES HASTA EN DIECISIETE ORDENES DE MAGNITUD, LAS ENZIMAS (TAMBIEN LLAMADOS BIOCATALIZADORES) SON DE HECHO LOS CATALIZADORES MAS EFICACES, ESPECIFICOS Y SELECTIVOS CONOCIDOS EN LA TIERRA, ESTAS CARACTERISTICAS HACEN QUE LOS PROCESOS CATALIZADOS POR ENZIMAS SEAN UNA ALTERNATIVA ATRACTIVA PARA LA INDUSTRIA QUIMICA, SIN EMBARGO, EL USO DE ENZIMAS EN LA INDUSTRIA ES LIMITADO, YA QUE LA MAYORIA DE LOS PROCESOS NO PRESENTAN UN BIOCATALIZADOR PARA ACELERAR LAS REACCIONES CORRESPONDIENTES, ESTO VIENE EN PARTE MOTIVADO POR LA AUSENCIA DE UN PROTOCOLO DE DISEÑO DE ENZIMAS EFICIENTE CAPAZ DE PREDECIR QUE CAMBIOS DE AMINOACIDOS SE REQUIEREN PARA EVOLUCIONAR LA ENZIMA HACIA NUEVAS FUNCIONES,LOS PRIMEROS INTENTOS DE DISEÑO DE ENZIMAS COMPUTACIONALES PASARON POR ALTO EL HECHO DE QUE LAS ENZIMAS EXISTEN COMO CONJUNTOS DE CONFORMACIONES, LAS CUALES SON IMPORTANTES PARA SU FUNCION, REDISTRIBUIR LAS POBLACIONES DE LOS ESTADOS CONFORMACIONALES A TRAVES DE MUTACIONES PERMITE LA EVOLUCION DE LA ENZIMA HACIA UNA NUEVA ACTIVIDAD, EN ESTE PROYECTO, SE EXPLORARA LA SUPERFICIE CONFORMACIONAL Y LA PROMISCUIDAD CATALITICA DE UNA SERIE DE ENZIMAS DESARROLLADAS EN LABORATORIO Y ANCESTRALES, CON EL OBJETIVO FINAL DE DESARROLLAR UNA SERIE DE HERRAMIENTAS PARA EL DISEÑO DE ENZIMAS BASADAS EN MOVIMIENTOS CORRELACIONADOS DE AMINOACIDOS Y PROTOCOLOS DE MACHINE-LEARNING, EN PARTICULAR, SE DESARROLLARAN NUEVAS ESTRATEGIAS PARA PREDECIR MUTACIONES DISTALES DEL SITIO ACTIVO, LAS MUTACIONES DISTALES A MENUDO SE OBSERVAN EN LA EVOLUCION DEL LABORATORIO (EVOLUCION DIRIGIDA) Y GENERALMENTE SON CLAVE PARA MEJORAR LA ACTIVIDAD CATALITICA DE LAS ENZIMAS, SIN EMBARGO, LA PREDICCION COMPUTACIONAL DE DICHAS MUTACIONES ES AUN UN DESAFIO,LAS NUEVAS TECNICAS DESARROLLADAS EN ESTE PROYECTO ENZEXPLORA BASADAS EN LA DINAMICA CONFORMACIONAL Y CORRELACIONES DE RESIDUOS PROPORCIONARAN EL CAMPO DEL (RE)DISEÑO DE ENZIMAS UNA ESTRATEGIA RACIONAL PARA DETERMINAR AMINOACIDOS PROMETEDORES PARA MEJORAR LA NUEVA ACTIVIDAD DE INTERES A TRAVES DE MUTACION, ESTE PROYECTO, POR LO TANTO, CONTRIBUIRA A LOGRAR EL DISEÑO RUTINARIO DE ENZIMAS PARA CUALQUIER REACCION OBJETIVO, QUE TIENE UN ALTO INTERES INDUSTRIAL ASOCIADO, DISEÑO COMPUTACIONAL DE ENZIMAS\DINÁMICA MOLECULAR\DINÁMICA CONFORMACIONAL\MACHINE-LEARNING

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