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PID2021-129034NB-I00

Financiado

DISEÑO COMPUTACIONAL DE ENZIMAS CONFORMACIONALMENTE DIRIGIDO PARA MEJORAR LA ACT...

DISEÑO COMPUTACIONAL DE ENZIMAS CONFORMACIONALMENTE DIRIGIDO PARA MEJORAR LA ACTIVIDAD AISLADA O EN COMPLEJO LAS ENZIMAS SON EXCELENTES CATALIZADORES CAPACES DE ACELERAR LAS REACCIONES QUIMICAS HASTA EN DIECISIETE ORDENES DE MAGNITUD. DICHAS ACELERACIONES DE LA VELOCIDAD DE REACCION TAN IMPRESIONANTES SE DEBEN A SU CAPACIDAD DE DISMINUIR... ver más

01/01/2021

UDG

157K€

Presupuesto del proyecto: 157K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT DE GIRONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 226

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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UDG

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT DE GIRONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 226

Presupuesto del proyecto 157K€

Descripción del proyecto LAS ENZIMAS SON EXCELENTES CATALIZADORES CAPACES DE ACELERAR LAS REACCIONES QUIMICAS HASTA EN DIECISIETE ORDENES DE MAGNITUD. DICHAS ACELERACIONES DE LA VELOCIDAD DE REACCION TAN IMPRESIONANTES SE DEBEN A SU CAPACIDAD DE DISMINUIR LAS BARRERAS DE ACTIVACION DE LAS REACCIONES, HACIENDOLAS POSIBLES A TEMPERATURAS Y PRESIONES MAS BAJAS. APARTE DE SU ALTA EFICACIA, LAS ENZIMAS SON ESPECIFICAS Y SELECTIVAS Y OPERAN EN CONDICIONES BIOLOGICAS SUAVES. ESTAS CARACTERISTICAS HACEN QUE LOS PROCESOS CATALIZADOS POR ENZIMAS SEAN UNA ALTERNATIVA ATRACTIVA PARA LA FABRICACION DE PRODUCTOS QUIMICOS. AUN ASI, LA APLICACION DE ENZIMAS EN LA INDUSTRIA ES BASTANTE LIMITADA, YA QUE LA MAYORIA DE LOS PROCESOS INDUSTRIALES CARECEN DE UNA ENZIMA NATURAL CAPAZ DE REALIZAR LAS TRANSFORMACIONES DESEADAS, NO PUEDEN ACEPTAR LOS SUSTRATOS NO NATURALES DE INTERES INDUSTRIAL Y / O PRESENTAN UNA BAJA ESTABILIDAD EN CONDICIONES NO OPTIMAS. .EL DISEÑO DE ENZIMAS SE CENTRA EN LA GENERACION DE NUEVOS BIOCATALIZADORES CON PROPIEDADES MEJORADAS MEDIANTE LA ALTERACION DE LA SECUENCIA NATURAL DE AMINOACIDOS QUE LOS CONSTITUYEN. EL INTERES POR EL DISEÑO DE ENZIMAS SURGE DE SUS CARACTERISTICAS VENTAJOSAS, PERO TAMBIEN DEL DESAFIO INTELECTUAL DE CREAR NUEVAS ACTIVIDADES ENZIMATICAS. EL DISEÑO DE ENZIMAS ES UNA PRUEBA RIGUROSA QUE NOS PERMITE COMPRENDER LA CATALISIS, LA EVOLUCION, EL PLEGAMIENTO Y LA ESTABILIDAD DE LAS ENZIMAS. LOS INTENTOS INICIALES DE DISEÑAR ENZIMAS COMPUTACIONALMENTE PASARON POR ALTO EL HECHO DE QUE LAS ENZIMAS EXISTEN COMO CONJUNTOS DE CONFORMACIONES QUE SON IMPORTANTES PARA SU FUNCION. ALTERANDO LAS POBLACIONES DE LOS ESTADOS CONFORMACIONALES A TRAVES DE MUTACIONES PERMITE LA EVOLUCION DE LA ENZIMA HACIA NUEVAS ACTIVIDADES.EN ESTE PROYECTO, SE DESARROLLARA UN PROTOCOLO GENERAL DE DISEÑO DE ENZIMAS BASADO EN LA DINAMICA CONFORMACIONAL CENTRADO EN LA CARACTERIZACION EXTENSA DEL CONJUNTO DE CONFORMACIONES Y LA APLICACION DE HERRAMIENTAS BASADAS EN CORRELACION PARA IDENTIFICAR LOS PUNTOS DE MUTACION (YA SEA SITUADOS EN EL SITIO ACTIVO, COMO EN POSICIONES DISTALES). LAS HERRAMIENTAS BASADAS EN CORRELACION SE COMBINARAN CON MULTIPLES TECNICAS DE ALINEACION DE SECUENCIAS, Y SE APLICARAN TECNICAS DE MACHINE-LEARNING PARA CLASIFICAR Y EVALUAR RAPIDAMENTE LAS NUEVAS VARIANTES GENERADAS. EL PROTOCOLO COMPUTACIONAL SE APLICARA PARA CONFERIR ACTIVIDAD INDEPENDIENTE A ENZIMAS REGULADAS ALOSTERICAMENTE Y TAMBIEN PARA DISEÑAR NUEVAS ENZIMAS REGULADAS ALOSTERICAMENTE. LA CAPACIDAD DE DISEÑAR COMPUTACIONALMENTE NUEVAS ENZIMAS QUE PODRIAN ACTIVARSE O DESACTIVARSE MEDIANTE INTERACCIONES ALOSTERICAS CON OTROS EFECTORES O PROTEINAS DE UNION AMPLIARIA ENORMEMENTE LA CAJA DE HERRAMIENTAS DE LA BIOLOGIA QUIMICA.ESTE PROYECTO MEJORARA NUESTRA COMPRENSION ACTUAL DE LA REGULACION ALOSTERICA Y SU PAPEL EN LA CATALISIS ENZIMATICA, Y CONTRIBUIRA ADICIONALMENTE A LOGRAR EL DISEÑO RUTINARIO DE ENZIMAS PARA CUALQUIER REACCION DE INTERES INDUSTRIAL. ISEÑO COMPUTACIONAL DE ENZIMAS\MACHINE-LEARNING\DINAMICA CONFORMACIONAL\DINAMICA MOLECULAR

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