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PID2021-122478NB-I00

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ESTUDIO MULTIESCALA DEL PLEGAMIENTO DE ACIDOS NUCLEICOS

EL PROYECTO MSNAF REPRESENTA UNA EVOLUCION NATURAL DEL TRABAJO REALIZADO POR NUESTRO GRUPO EN LOS ULTIMO AÑOS. EL OBJETIVO ULTIMO ES ESARROLLAR UNA METODOLOGIA MULTIESCALA QUE NOS PERMITA DESCRIBIR EL PLEGAMIENTO DE LOS ACIDOS NUC... ver más

01/01/2021

FUNDACIO INSTITUT...

387K€

Presupuesto del proyecto: 387K€

Líder del proyecto

FUNDACIO INSTITUT DE RECERCA BIOMEDICA IRB BA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 23M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

FUNDACIO INSTITUT DE RECERCA BIOMEDICA IRB BA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 23M€

Presupuesto del proyecto 387K€

Descripción del proyecto EL PROYECTO MSNAF REPRESENTA UNA EVOLUCION NATURAL DEL TRABAJO REALIZADO POR NUESTRO GRUPO EN LOS ULTIMO AÑOS. EL OBJETIVO ULTIMO ES ESARROLLAR UNA METODOLOGIA MULTIESCALA QUE NOS PERMITA DESCRIBIR EL PLEGAMIENTO DE LOS ACIDOS NUCLEICOS, DESDE FRAGMENTOS CORTOS A LA CRORMATINA EUCARIOTA. A NIVEL ATOMISTICO, QUEREMOS DESARROLLAR UN CAMPO DE FUERZAS QUE SUBSTITUYA A NUESTRO PARMBSC1 (EL ESTANDAR ACTUAL) AMPLIANDOLO A RNA Y POR OTRO LADO CREAR EL PRIMER PROTOTIPO DE UN CAMPO DE FUERZAS MACHINE LEARNING. ALGO MUY AMBICIOSO, Y QUE EL CAMPO ESTA ESPERANDO COMO EL SANTO GRIAL DE LA SIMULACION. A NIVEL MESOSCOPICO QUEREMOS REDUCIR EL PROBLEMA DE FALTA DE CORRELACION EN EL MODELO ACTUAL Y DESARROLLAR UN MODELO CARTESIANO QUE PERMITA EXTENDER EL CALCULO A LARGAS FIBRAS DE CROMATINA UNIENDO A POTENCIALES FISICOS RESTRICCIONES EXPERIMENTALES. LA TECNOLOGIA DESARROLLADA SE APLICARA PARA ENTENDER DIVERSOS SISTEMAS BIOLOGICOS EN LOS QUE EL GRUPO HA ESTADO Y ESTA INTERESADO. EL PRIMERO Y MAS RELEVANTE: LA CROMATINA, DONDE ESTAMOS EN CONDICIONES DE LLEGAR A UNA DESCRIPCION FLEXIBLE Y DINAMICA DE COMO SE ENCUENTRA EMPAQUETADO EL DNA EN LA CELULA Y DE COMO ESTE EMPAQUETAMIENTO CAMBIA EN FUNCION DE LAS NECESIDADES DE LA MISMA. UN SEGUNDO TIPO DE SISTEMAS QUE CENTRARAN NUESTRO INTERES SON PEQUEÑOS CONSTRUCTOS DE ACIDOS COMO APTAMEROS, ANTI-SENSE Y NANOESTRUCTURAS DE SIRNA, SISTEMAS DE INTERES CRECIENTES SOBRE LOS QUE ESPERAMOS TENER CAPACIDAD PREDICTIVA, A PARTIR DE METODOLOGIAS DE SIMULACION DE DINAMICA TRIDIMENSIONAL. TECNICAMENTE RELACIONADOS, AUNQUE CUBRIENDO OTRO RANGO DE INTERES SON LOS ENZIMAS BASADOS EN ACIDOS NUCLEICOS, DONDE ESPERAMOS SER EL PRIMER GRUPO CAPAZ DE REALIZAR DISEÑO RACIONAL DE NUEVAS ACTIVIDADES USANDO XNAS COMO ELEMENTOS CONSTRUCTIVOS E INTENTANDO COMO PRIMER OBJETIVO CREAR RNASES MAS EFECTIVAS. POR ULTIMO, QUEREMOS EMPLEAR Y MEJORAR LA NUEVA TECNOLOGIA PARA REPRODUCIR LAS INTERACCIONES DROGA-RNA . NUESTRO OBJETIVOS SE ENGLOBAN EN EL POSTULADO DE CIENCIA BASICA, PERO ESPERAMOS QUE, EN UN CONTEXTO DONDE LOS ACIDOS NUCLEICOS SON LA PRINCIPAL APUESTA TERAPEUTICA DE LA DECADA, NUESTRA TECNOLOGIA TENGA UN IMPACTO MAS DIRECTO EN TERMINO DE GENERACION DE RIQUEZA. DESTACAR QUE ES UN PROYECTO FUNDAMENTALMENTE TEORICO, PERO QUE INCLUYE UNA PARTE EXPERIMENTAL SIGNIFICATIVA, TANTO PAR PRODUCIR DATOS NUEVOS, COMO PARA VALIDAR LA CAPACIDAD PREDICTIVA DE NUESTROS MODELOS. IOINFORMATICA\DINAMICA MOLECULAR.\CROMATINA\RNA\DNA\SIMULACION MOLECULAR\QUIMICA TEORICA\BIOLOGIA COMPUTACIONAL

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