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Descripción del proyecto
LAS CELULAS PLURIPOTENTES TIENEN UN GRAN POTENCIAL BIOMEDICO EN AREAS COMO EL MODELAJE DE ENFERMEDADES HUMANAS Y MEDICINA REGENERATIVA, SIN EMBARGO, PARA LA APLICACION DE ESTA TECNOLOGIA DE MANERA EXITOSA Y SEGURA, NECESITAMOS AVANZAR EN EL CONOCIMIENTO DE LAS BASES MOLECULARES QUE REGULAN LA PLURIPOTENCIA, EN CELULAS MADRES EMBRIONARIAS (ES) PLURIPOTENTES DE RATON, LOS COMPLEJOS REPRESIVOS POLYCOMB (PRC) SE UNEN Y REPRIMEN CIENTOS DE PROMOTORES DE GENES ESPECIFICOS DE LINAJE QUE SE ACTIVARAN MAS TARDE DURANTE EL DESARROLLO, ESTOS PROMOTORES MUESTRAN MARCAS CONTRADICTORIAS EN SUS HISTONAS ASOCIADAS CON REPRESION Y ACTIVACION TRANSCRIPCIONAL Y POR LO TANTO SE HAN DENOMINADO PROMOTORES BIVALENTES, LOS PROMOTORES REPRIMIDOS BIVALENTES TAMBIEN MUESTRAN RECLUTAMIENTO DE RNA POLIMERASA II (RNAPII), LA CUAL SE CREE QUE ESTA LISTA PARA TRANSCRIBIR LISTA PARA TRANSCRIBIR TRAS LA RECEPCION DE SEÑALES DE DIFERENCIACION, DURANTE MI POSTDOC EN EL LAB DE PROF, AMANDA FISHER, HEMOS IDENTIFICADO LA PROTEINA JARID2 COMO UNA NUEVA SUBUNIDAD DE PRC2 NECESARIA PARA RECLUTAR RNAPII A LOS GENES BIVALENTES, SIN EMBARGO, EL MECANISMO MOLECULAR POR EL CUAL JARID2 AFECTA EL RECLUTAMIENTO DE RNAPII ESTA AUN POR DILUCIDAR, EN ESTE PROYECTO, PROPONGO ANALIZAR EL PAPEL DEL POSICIONAMIENTO DE NUCLEOSOMAS EN EL ESTABLECIMIENTO DE CROMATINA BIVALENTE EN CELULAS PLURIPOTENTES ES, PARA EVITAR PATRONES COMBINATORIOS AMBIGUOS DE POSICIONES NUCLEOSOMICAS DEBIDO A HETEROGENEIDAD EN LA POBLACION DE CELULAS, COMBINAREMOS DOS TECNOLOGIAS DESARROLLADAS RECIENTEMENTE; SEPARACION DE CELULAS ES SEGUN FASE DE CICLO CELULAR (ELUTRIACION) Y ANALISIS DE UNION DE NUCLEOSOMAS CON RESOLUCION A NIVEL DE MOLECULAR UNICA (NOME-SEQ), SU USO COMBINADO NOS PERMITIRA LLEVAR A CABO UN NOVEDOSO ANALISIS A NIVEL GENOMICO DEL POSICIONAMIENTO DE LOS NUCLEOSOMAS CON RESOLUCION A NIVEL MOLECULAR Y A LO LARGO DEL CICLO CELULAR EN CELULAS PLURIPOTENTES, INTEGRACION DE ESTOS DATOS CON EL ANALISIS DE EXPRESION DE RNA Y UNION DE RNAPII A NIVEL GENOMICO NOS PERMITIRA ESTABLECER LA RELEVANCIA FUNCIONAL DE LOS MAPAS DE NUCLEOSOMAS OBTENIDOS, FINALMENTE, COMPLEMENTAREMOS NUESTRO ESTUDIO CON EL ANALISIS DEL PAPEL DE JARID2 Y OTRAS SUBUNIDADES DE POLYCOMB EN EL POSICIONAMIENTO DE NUCLEOSOMAS EN GENES BIVALENTES EN CELULAS PLURIPOTENTES, PLURIPOTENCIA\ CELULAS MADRES EMBRIONARIAS\ EPIGENETICA\ POSICIONAMIENTO DE NUCLEOSOMAS\ POLYCOMB\ CICLO CELULAR\ RNA POLIMERASA
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